2022 Fiscal Year Annual Research Report
多発鋸歯状病変の分子病態解明と大腸がん高リスク患者のサーベイランス体系の構築
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20K07662
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| Research Institution | Sapporo Medical University |
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Principal Investigator |
原田 拓 札幌医科大学, 医学部, 研究員 (60468030)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
山本 英一郎 札幌医科大学, 医学部, 訪問研究員 (60567915)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 鋸歯状病変 / 大腸がん / エピゲノム / ヒストン修飾 / DNAメチル化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
内視鏡的に切除した新鮮な大腸多発性鋸歯状腺腫2例の腫瘍部および背景正常大腸粘膜から、細胞を抽出し、ホルマリン固定した上で、抗ヒストンH3リジン4トリメチル化(H3K4me3)抗体、ならびに抗H3K27me3抗体を用いてクロマチン免疫沈降シークエンス(ChIP-seq)を行った。また対照群として大腸腺腫2例の腫瘍部および正常背景粘膜を対照として、同様にH3K4me3とH3K27me3のChIP-seqを行った。また腫瘍部のDNAメチル化をInfinium BeachChipにより解析した。これらのデータを統合して解析した結果、鋸歯状腺腫の腫瘍部におけるDNAメチル化と、背景粘膜のH3K27me3との間に高い相関を認めた。逆に腫瘍部のDNAメチル化と、背景粘膜のH3K4me3は逆相関を示した。この傾向はThe Cancer Genome Atlasデータベースに登録された大腸がんのDNAメチル化データからも確認された。その中から我々は、TXL2とGABRA4に着目した。これらの遺伝子はCIMP陽性腫瘍において高頻度にDNAメチル化し、かつCIMP陽性腫瘍の背景粘膜においてH3K27me3の上昇を示した。
次に我々はエンハンサー領域のDNAメチル化を解析した。公的データベースに登録された大腸がん臨床検体のヒストンH3リジン27アセチル化(H3K27ac)のChIP-seqデータを指標にエンハンサー領域を同定し、多発性鋸歯状腺腫のDNAメチル化データと統合した結果、FGF19遺伝子に存在するエンハンサー領域候補においてDNAメチル化の上昇を認めた。この領域のメチル化はBRAF変異陽性、MSI陽性の大腸がんにおいても高頻度に認めたことから、腫瘍リスクに関わる可能性が考えられた。
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Research Products
(5 results)
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[Journal Article] Serum amyloid A1 recruits neutrophils to the invasive front of T1 colorectal cancers.2023
Author(s)
Yoshido A, Sudo G, Takasawa A, Aoki H, Kitajima H, Yamamoto E, Niinuma T, Harada T, Kubo T, Sasaki H, Ishiguro K, Yorozu A, Kai M, Katanuma A, Yamano HO, Osanai M, Nakase H, Suzuki H.
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Journal Title
J Gastroenterol Hepatol.
Volume: 38
Pages: 301-310
DOI
Peer Reviewed
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