2020 Fiscal Year Research-status Report
Urinary circular RNA: novel biomarker for early detection of colorectal cancer
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20K08362
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| Research Institution | Nagoya City University |
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Principal Investigator |
北川 美香 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 助教 (80588632)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
志村 貴也 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 講師 (90405192)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 大腸癌 / 尿 / バイオマーカー / circRNA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
年齢と性別をマッチさせた、32例の健常者およびステージ0/I大腸癌患者の尿中からRNAを抽出した。代表的な複数のcircRNAのプライマーを設計し、抽出したRNA中のcircRNA発現をqPCR法にて解析することに成功した。網羅的解析のためにcircRNAマイクロアレイをするべく試みたが、尿中のcircRNA発現量が少ないことからかプローブのハイブリダイゼーションがうまくいかず諸条件の調整が必要であった。約10種類の抽出法にて、尿中からRNAの抽出を行い、circRNAの網羅的解析に最適な条件設定を行い、解析に値する方法を決定し、現在すべてのコホート約500例中、約400例の尿中からのRNA抽出を終えた。次年度からは、それらのRNAを使用し解析をすすめる予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
尿中のcircRNAの発現量が少ないことから、その抽出の条件設定に時間を要した。またコロナウィルス感染症により、海外からの輸入試薬の入手に遅延を生じたことも一因である。さらに、幼児を育児しながらの研究であるが、コロナウィルスに伴う種々の保育所の制限に伴い在宅待機が多くなり研究に時間をさくことができなかった。
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| Strategy for Future Research Activity |
前述のごとく、circRNA解析に最適なRNAの抽出法の決定に時間を要したが、令和2年度に条件設定は終え、現在約400例からの尿中RNAの抽出は終えている。令和3年度の5月中にはマイクロアレイによる網羅的解析を終え、circRNAバイオマーカーの候補因子を同定し、次フェーズの大規模コホートでの解析に早期に進む予定である。
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| Causes of Carryover |
circRNAの解析にかかる諸条件の設定のために時間を要したため。また前述のごとくコロナウィルス感染症にかかる様々な要因により、研究の進捗に遅れを生じたため。
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Research Products
(4 results)
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[Journal Article] Serum Exosomal Dicer Is a Useful Biomarker for Early Detection of Differentiated Gastric Adenocarcinoma2020
Author(s)
Okuda Y, Shimura T, Iwasaki H, Katano T, Kitagawa M, Nishigaki R, Fukusada S, Natsume M, Tanaka M, Nishie H, Ozeki K, Yamada T, Kataoka H.
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Journal Title
Digestion.
Volume: Oct 13
Pages: 1-10
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Novel urinary protein biomarker panel for early diagnosis of gastric cancer2020
Author(s)
Shimura T, Dayde D, Wang H, Okuda Y, Iwasaki H, Ebi M, Kitagawa M, Yamada T, Yamada T, Hanash SM, Taguchi A, Kataoka H
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Journal Title
British Journal of Cancer
Volume: 123
Pages: 1656-1664
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] The first management using intubation of a nasogastric tube with Gastrografin enterography or long tube for non-strangulated acute small bowel obstruction: a multicenter, randomized controlled trial2020
Author(s)
Katano T, Shimura T, Nishie H, Iwai T, Itoh K, Ebi M, Mizuno Y, Togawa S, Shibata S, Yamada T, Mizushima T, Inagaki Y, Kitagawa M, Nojiri Y, Tanaka Y, Okamoto Y, Sugiura M, Matoya S, Nagura Y, Inagaki Y, Koguchi H, Ono S, Ozeki K, Hayashi N, Takiguchi S, Kataoka H
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Journal Title
Journal of Gastroenterology
Volume: 55
Pages: 858-867
DOI
Peer Reviewed
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