Urinary circular RNA: novel biomarker for early detection of colorectal cancer

2021 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 20K08362
• Research Institution: Nagoya City University
• Principal Investigator: 北川 美香 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 助教 (80588632)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 志村 貴也 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 講師 (90405192)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: 大腸癌 / 尿 / バイオマーカー / circRNA

Outline of Annual Research Achievements

数多くの予備実験を行うことにより、含有量の少ない尿中circRNAの抽出および発現解析における最適な条件を設定しえた。年齢と性別をマッチさせた、健常者16例およびステージ0/I大腸癌患者16例の尿中からRNAを抽出し、circRNAマイクロアレイによる網羅的解析を施行した結果、健常者群と比較し、大腸癌患者群の尿中で有意に高発現を示す541のcircRNA、低発現を示す35のcircRNAを同定した。それらのバイオマーカー候補circRNAのなかから、データベースにて大腸または悪性腫瘍にかかわるcircRNAや、予備実験にて尿中で安定的に発現するcircRNAを抽出しプライマーを設計、現在32例のコホートを使用し、定量PCRを施行中である。今後は、約400例規模でのトレーニングおよびバリデーションコホートでの解析・検討を行う予定である。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

尿中のcircRNAの発現量が少ないことから、その抽出や最適な発現解析の条件設定に時間を要したため。また、育児と研究の両立をする上で、コロナ感染流行による影響で支障がでたため。

Strategy for Future Research Activity

尿中に微量に含まれるcircRNAの解析は、抽出や定量法などの細かい条件設定が大変難しいが、多くの予備実験によりその課題はクリアした。すでに樹立した方法により、多くの尿サンプルからの尿中RNAの抽出し、cDNAを進行中である。今後は多くの尿サンプルにを用い、信頼性の高いバイオマーカーの樹立と検証を行う。

Causes of Carryover

circRNAの解析にかかる諸条件の設定のために時間を要したため。また前述のごとくコロナウィルス感染症にかかる様々な要因により、研究の進捗に遅れを生じたため。

Research Products

• [Journal Article] A Novel Urinary miRNA Biomarker for Early Detection of Colorectal Cancer. (2022)
  • Author(s): Iwasaki H, Shimura T, Kitagawa M, Yamada T, Nishigaki R, Fukusada S, Okuda Y, Katano T, Horike SI, Kataoka H
  • Journal Title: Cancers Volume: 14 Pages: 461
  • DOI: 10.3390/cancers14020461.
• [Journal Article] Long-term outcomes of nasogastric tube with Gastrografin for adhesive small bowel obstruction (2022)
  • Author(s): Nishie H, Shimura T, Katano T, Iwai T, Itoh K, Ebi M, Mizuno Y, Togawa S, Shibata S, Yamada T, Mizushima T, Inagaki Y, Kitagawa M, Nojiri Y, Tanaka Y, Okamoto Y, Matoya S, Nagura Y, Inagaki Y, Koguchi H, Ono S, Ozeki K, Hayashi N, Takiguchi S, Kataoka H.
  • Journal Title: J Gastroenterol Hepatol. Volume: 37 Pages: 111
  • DOI: 10.1111/jgh.15681.
• [Journal Article] Urinary microRNA biomarkers for detecting the presence of esophageal cancer. (2021)
  • Author(s): Okuda Y, Shimura T, Iwasaki H, Fukusada S, Nishigaki R, Kitagawa M, Katano T, Okamoto Y, Yamada T, Horike SI, Kataoka H.
  • Journal Title: Sci Rep. Volume: 11 Pages: 8508
  • DOI: 10.1038/s41598-021-87925-1.
• [Journal Article] Relationship between Immunophenotype and Clinicopathological Findings for Superficial Nonampullary Duodenal Epithelial Tumor. (2021)
  • Author(s): Fukusada S, Shimura T, Iwasaki H, Okuda Y, Katano T, Nishigaki R, Ozeki T, Kitagawa M, Nishie H, Tanaka M, Ozeki K, Kubota E, Tanida S, Kataoka H.
  • Journal Title: Digestion Volume: 102 Pages: 870-877
  • DOI: 10.1159/000514812.
• [Journal Article] Serum Exosomal Dicer Is a Useful Biomarker for Early Detection of Differentiated Gastric Adenocarcinoma. (2021)
  • Author(s): Okuda Y, Shimura T, Iwasaki H, Katano T, Kitagawa M, Nishigaki R, Fukusada S, Natsume M, Tanaka M, Nishie H, Ozeki K, Yamada T, Kataoka H.
  • Journal Title: Digestion Volume: 102 Pages: 640-649
  • DOI: 10.1159/000510993.
• [Presentation] 当院における肛門扁平上皮癌に対する治療成績の検討 (2021)
  • Author(s): 北川美香、志村貴也、片岡洋望、西垣瑠里子、尾関貴紀、岩崎弘靖、田中 守、西江裕忠、片野敬仁、尾関啓司、久保田英嗣、谷田論史
  • Organizer: GI week 2021: 第17回日本消化管学会総会学術集会
• [Presentation] 当院における肛門扁平上皮癌に対する治療成績の検討 (2021)
  • Author(s): 北川美香、志村貴也、西垣瑠里子、杉村直美、奥田悠介、尾関貴紀、岩崎弘靖、田中守、西江裕忠、片野敬仁、尾関啓司、久保田英嗣、谷田諭史、片岡洋望
  • Organizer: 第107回日本消化器病学会総会
• [Presentation] Gene mutation analysis in nonampullary duodenal epithelial tumors (2021)
  • Author(s): Shigeki Fukusada, Takaya Shimura, Yusuke Okuda, Hiroyasu Iwasaki, Mika Kitagawa, Takahito Katano, Hiromi Kataoka
  • Organizer: UEG Week Virtual 2021