2022 Fiscal Year Annual Research Report
原発性線毛不全症の慢性気道感染病態に見られる微生物叢のメタ16S解析と臨床的意義
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20K08532
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| Research Institution | 公益財団法人結核予防会 結核研究所 |
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Principal Investigator |
慶長 直人 公益財団法人結核予防会 結核研究所, 副所長, 副所長 (80332386)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
土方 美奈子 公益財団法人結核予防会 結核研究所, 生体防御部, 部長 (90332387)
森本 耕三 公益財団法人結核予防会 結核研究所, 抗酸菌部 細菌科, 研究員 (40511879)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 原発性線毛機能不全症候群 / 鼻腔NO測定 / 遺伝子検査 / 電子顕微鏡検査 / 副鼻腔気管支症候群 / 不妊 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
原発性線毛不全症（primary ciliary dyskinesia; PCD）は、粘液線毛クリアランスの異常に起因する先天性疾患で、線毛の構造や機能に関わる50前後の遺伝子が原因として知られている。抗酸菌感染症を含む慢性の上下気道感染症を生じやすく、先天性疾患でありながら成人期に発見されるなど、診断困難な症例が多い。進行の遅い症例と幼少期に病状が進む症例の違いは何か、臨床的に何をマーカーとしてPCDを鑑別すべきか、またマクロライド抗菌薬に反応しない難治例は、何を指標に治療を進めればよいか。これらの疑問に対して本研究では、病態の類似する嚢胞性線維症で注目される喀痰中の微生物ゲノム解析を真菌にまで広げて、病態と微生物叢との関連を検討する。
対象となるPCD症例の集積と一連の検査は別プロジェクトと共同で実施している。これまでにPCDに合致する遺伝子異常は40症例で確認され、そのうち19例に日本人で最も高頻度に認められるDRC1遺伝子の大規模欠失変異がホモ接合でみられた。
今年度は23例から喀痰の提供を受けた。採取後直ちに分注し、-80度で保存したのち、昨年度までの条件検討に基づいてDNAを抽出した。細菌ゲノム 16S rRNA V3-V4領域と真菌ゲノムのITS領域のPCR増幅、ライブラリー作成を実施した。今年度はデータ確定のために、イルミナ社MiSeq 600サイクルキットでシークエンスを行い、QIIME2解析ツールを用いた細菌叢の分布の可視化と真菌叢解析ツールによる真菌の同定を行った。
PCDにおける原因遺伝子異常と電子顕微鏡上の異常所見、びまん性汎細気管支炎およびその他の気管支拡張症、臨床疫学情報、各種検査情報との相関を合わせて、嫌気性菌、抗酸菌、真菌ゲノムを含む下気道由来の微生物叢の多様性、分布の特徴を明らかにすべく検討した。
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