2023 Fiscal Year Annual Research Report
Ab initio法を活用した造血系腫瘍におけるlncRNAの統合的機能解析
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20K08716
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| Research Institution | Fukushima Medical University |
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Principal Investigator |
森 努 福島県立医科大学, 看護学部, 准教授 (60244373)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
合山 進 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (80431849)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | 造血器腫瘍 / システム生物学 / ab initio遺伝子軌道法 / long non-coding RNA / 薬剤標的性 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
私たちは実験なしで遺伝子機能を解析する手法の計算方法について特許を取得し（特許第6820621号），ab initio遺伝子軌道法として論文でも公開した。この方法は原理的にはnon-coding RNAに応用できるものである。そこで本法をTCGAのデータベースに適用し，linc RNAとタンパクをコードする遺伝子protein-coding geneとのab initio法による情報解析を行った。
TCGAに登録されたlinc RNAは871種類であるが，その中でprotein-coding geneとの有意な相互作用が検出されたlinc RNAは，最終的に121個であった。それらをab initio機能計算に掛けることでネットワーク機能を算出したところ，細胞分裂や癌化に関わる機能を持つことが予測されるものが多数を占めることが判った。個々のlinc RNAの機能解析は，完了次第，個別に公開していく方針である。
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