2020 Fiscal Year Research-status Report
Exploratory study to find predictive genomic biomarkers using liquid biopsy in multiple myeloma
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20K08759
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| Research Institution | Nagoya City University |
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Principal Investigator |
飯田 真介 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 教授 (50295614)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
李 政樹 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 講師 (00567539)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 多発性骨髄腫 / cfDNA / バイオマーカー / リキッドバイオプシー |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、骨髄中の腫瘍性形質細胞および末梢血中の核酸（単核球および血清cell free DNA: cfDNA）の分子生物学的解析と臨床病態の比較により骨髄腫の病勢進行や薬剤感受性に関わる遺伝子変異を同定し、血液中から予後や薬剤感受性を予測するバイオマーカーを同定することを目的とする。
今年度は、初発未治療の多発製骨髄腫患者由来の末梢血血清1mlから、cfDNAを抽出し、約40-200ngほどのライブラリー作成に十分量を得ることができた。多発性骨髄腫の病期の進行や腫瘍量の増加にしたがい、末梢血cfDNA収量の増加を認めており、体内の腫瘍量とcfDNA収量に相関が認められた。さらに、ターゲットキャプチャー・シクエンスの基盤となる、多発性骨髄腫の薬剤や病態に関連する遺伝子をピックアップしてリストを作成した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
骨髄腫患者由来の純化形質細胞および末梢血血清からそれぞれ、gDNAおよびcfDNAを抽出し、解析を行う上で十分量があることを確認している。その先のライブラリー作成・シークエンス・データ解析などはまだ十分に実施できていない。しかし、変異探索の対象となる多発性骨髄腫の薬剤や病態に関連する遺伝子リストは作成できいるため、上記の作業はすぐに着手できる状況にある。したがって、現状の進捗はやや遅れていると判断した。
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| Strategy for Future Research Activity |
前述したように、骨髄腫患者由来の純化形質細胞および末梢血血清から抽出したgDNAおよびcfDNAから、ライブラリー作成・シークエンス・データ解析などの一連の解析を着手する予定である。gDNAおよびcfDNAのそれぞれからライブラリーを作成するためのキットおよびその手順は予備実験で確立されており、シークエンスによって得られたデータの生物統計学的解析の手順も既に確立できている。データ解析が完了した後は、病態や治療薬の効果などの関連解析へと進めて行く予定である。
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| Causes of Carryover |
理由: 研究を進めていく上で必要に応じて研究費を執行したため当初の見込み額と執行額は異なったが、研究計画に変更はなく、前年度の研究費も含め、当初の予定通りの研究計画で進めていく。
使用計画: 次世代シークエンスに必要な試薬群（ライブラリー作成試薬、シークエンス試薬など）を購入する。さらには、抽出された核酸のなかでも、cell free DNAおよびマイクロRNAの解析として、必要な試薬群も購入予定である。
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[Journal Article] Genomic analysis of multiple myeloma using targeted capture sequencing in the Japanese cohort.2020
Author(s)
Kanamori T, Sanada M, Ri M, Ueno H, Nishijima D, Yasuda T, Tachita T, Narita T, Kusumoto S, Inagaki A, Ishihara R, Murakami Y, Kobayashi N, Shiozawa Y, Yoshida K, Nakagawa MM, Nannya Y, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Horibe K, Handa H, Ogawa S, Iida S.
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Journal Title
British Journal of Hematology
Volume: 191
Pages: 755-763
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Expression, mutation, and methylation of CRBN-pathway genes at pre- and post-lenalidomide treatment in multiple myeloma.2020
Author(s)
Tachita T, Kinoshita S, Ri M, Aoki S, Asano A, Kanamori T, Yoshida T, Totani H, Ito A, Kusumoto S, Komatsu H, Yamagata K, Kubo K, Tohkin M, Fukuda S, Iida S.
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Journal Title
Cancer Science
Volume: 111
Pages: 1333-1343
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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