2020 Fiscal Year Research-status Report
ベーチェット病におけるHLA-B51とCD8陽性T細胞の関連についての検討
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20K08771
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Research Institution | Kobe City Medical Center General Hospital(First Clinical Division, Second Clinical Division, Third |
Principal Investigator |
住友 秀次 地方独立行政法人神戸市民病院機構神戸市立医療センター中央市民病院(第1診療部、第2診療部、第3診療部, 中央市民病院, 医長 (20392996)
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Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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Keywords | ベーチェット病 / トランスクリプトーム解析 / HLA-B51 / パスウェイ解析 |
Outline of Annual Research Achievements |
2020年度は、ベーチェット病(Behcet’s syndrome; BS)患者23人と健常人28人の末梢血20分画(好中球を含む)をフローサイトメーターで解析し、分取してmRNA発現解析を行い、またeQTL解析を進めた。 フローサイトメーター解析結果では、BS患者ではTh17細胞は増加しており、mRNA発現解析ではBS患者のTh17細胞ではNFkB経路が活性化していた。パスウェイ解析ではBS患者で骨髄系樹状細胞をはじめとする抗原提示細胞の活性化を認めた。また、BSと最も強く関連する遺伝因子であるHLA-B51陽性とメモリーCD8陽性T細胞のIL-17 signature との関連が明らかにされ、HLA-B51陽性BSの病原性にIL-17産生CD8陽性T細胞 (T cytotoxic 17; Tc17)が関与する可能性が示唆された。また、eQTL解析ではあるBSリスクSNPとある遺伝子のeQTL効果が示唆された。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
2020年度はin silicoでの遺伝子解析に労力を要したため、in vitroの実験による証明を行うことができておらず、予定より遅れがみられている。
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Strategy for Future Research Activity |
eQTL解析を行うことで、BSリスクSNPがeQTL効果をもつ遺伝子が抽出された。この情報をもとに、in vitro 実験での確認ができるかを検討する。また、フローサイトメーターで、BS患者の抗原提示細胞が活性化しているか、Tc17細胞比率などを確認する。Naive CD4 T細胞のTh17分化と関連するケモカインがTc17分化に関与するかの検討を行う。in silicoでの解析として、TCRレパトワ解析を検討する。
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Causes of Carryover |
2020年度は、Covid-19の流行により、学会はすべてオンラインで参加した。そのため、旅費は発生しなかった。また、2020年度はin silicoの研究が主となりin vitro実験を行わなかったため、使用金額が発生しなかった。2021年度は、実験環境が整い、フローサイトメーター解析を行うことも可能となったことから、染色用の抗体やメディウム類、ソフトウエア類に対して研究費を使用する計画としている。
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Research Products
(1 results)
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[Journal Article] Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases2021
Author(s)
Ota M, Nagafuchi Y, Hatano H, Ishigaki K, Terao C, Takeshima Y, Yanaoka H, Kobayashi S, Okubo M, Shirai H, Sugimori Y, Maeda J, Nakano M, Yamada S, Yoshida R, Tsuchiya H, Tsuchida Y, Iwasaki Y, Sumitomo S, Shoda H, Kochi Y, Okada Y, Yamamoto K, Okamura T, Fujio K, et al.
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Journal Title
Cell
Volume: 184
Pages: 1-16
DOI
Peer Reviewed