Investigation of metabolic regulation and role of FAM167A in SLE B cells using trans-omics analysis

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20K08799
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 54020:Connective tissue disease and allergy-related
• Research Institution: Institute of Physical and Chemical Research (2021-2022); The University of Tokyo (2020)
• Principal Investigator: Iwasaki Yukiko 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 客員研究員 (30592935)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: 全身性エリテマトーデス / 免疫代謝 / B細胞 / アミノ酸 / I型インターフェロン / 自然免疫シグナル / トランスオミクス解析

Outline of Final Research Achievements

This study started to elucidate the function of FAM167A, a GWAS SNP for SLE, which has relatively specific expression and eQTL effects in B cells, but whose function is unknown. To elucidate the metabolic regulation in B cells under such a condition that this molecule is assumed to be involved, basic data acquisition was performed to acquire time-series omics data using B cell lines. Through analysis on metabolic status using oxidative phosphorylation as an index, metabolomics revealed that metabolic regulation occurred and some amino acids, that were identified by the applicants and suggested to be important for differentiation of antibody-producing cells, fluctuated several hours after stimulation.

Free Research Field

免疫学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

近年immunometabolism、 免疫代謝研究は注目されており、免疫担当細胞の代謝環境の制御と機能に密接に関連があることが知られるようになった。こうした研究の潮流に伴い、ヒト血清を用いたメタボローム解析も盛んにおこなわれるようになっているが、血清中の代謝産物と血球内で生じている代謝変容の関連性を議論するには未だ基礎的研究における知見の蓄積が不十分である。本研究では、既にSLEの血清メタボローム解析と免疫担当細胞のトランスクリプト―ム解析の統合解析の結果から得られた知見から、B細胞の抗体産生細胞分化時の代謝変容過程のより詳細な解明を目指し、アミノ酸の重要性を同定したことに学術的意義がある。