2021 Fiscal Year Research-status Report
Panton–Valentine leukocidin-producing Staphylococcus aureus in Japanese MSM
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20K08837
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
安達 英輔 東京大学, 医科学研究所, 助教 (80725804)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
城戸 康年 大阪市立大学, 大学院医学研究科, 准教授 (90511395)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 市中感染型MRSA / 分子疫学解析 / 性感染症 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
USA300株はPanton-Valentin leucocidin (PVL)毒素を産生する強毒なmethicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA)で、市中感染型MRSAとして米国を中 心として流行している。HIV感染や男性と性交渉のある男性 (Men who have sex with men: MSM)はUSA300株の保菌リスクとされる。
本邦におけるUSA300株は極め て稀であったが、近年HIV患者において報告数が増加しており、保菌率の調査とリスク因子の解析を目的とした。2019年12月から2020年3月の間に当院を受診した HIV感染者に対して、PVL遺伝子がPCRにより、鼻腔のMRSA保菌調査を行い、分子疫学的に背景因子を解析した。PVL遺伝子が検出されたものを分離し、全ゲノム解析を行い報告した。これらの成果は J Infect Dis. 24;223(4):610-620. (2021)に責任著者として発表している。
さらに今年度は血液培養ボトル内の細菌の16sリボゾームのアンプリコンを解析を行った。HIV感染者における、血液培養ボトルや、血液検体を用いて直接メタ16sのアンプリコン解析を行い、細菌のトランスロケーション等を評価することを目的とするものである。これまで、血液疾患による免疫不全者の血液培養ボトルで陰性であったものを用いて、予備的な実験を行ったが、多くの場合、菌血症を反映しているのかどうか判別できなかった。今後は、MRSA等が分離されたものを用いた解析に切り替えていく予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初の目的であった、これまで国内ではまれであるとされてきたUSA300株の成人での流行が行っていることを示すという目標についてはほぼ達成されており、関連した文献も海外の専門誌から今年度出版されている。現在は関連した細菌の解析を行なっている。
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| Strategy for Future Research Activity |
今回、ゲノム解析による分子疫学解析の手法が確立され、今後もメタゲノム解析を用いた、菌種の同定を行うことを考えている。また、臨床現場においては、現在もUSA300株だと思われるPVL産生の市中感染型MRSAを認めており、現在も流行が続いている。新規に網羅的な培養検査を行い、分離株の分子疫学解析を行うことにより新たな知見が得られることも期待できる。
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| Causes of Carryover |
当初の研究計画の部分についてはすでに発表を終了している他、学会発表がweb発表となり、旅費を使用する必要がなくなった。また本研究をさらに進めた血液検体の解析については、新型コロナウイルス対応ののエフォートにより予備的な次世代シーケンサー解析で止まっている状況であったため。今年度はさらに設備投資と分子疫学解析を続けていく。
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[Journal Article] Efficacy of Antibodies and Antiviral Drugs against Covid-19 Omicron Variant.2022
Author(s)
Takashita E, Kinoshita N, Yamayoshi S, Sakai-Tagawa Y, Fujisaki S, Ito M, Iwatsuki-Horimoto K, Chiba S, Halfmann P, Nagai H, Saito M, Adachi E, Sullivan D, Pekosz A, Watanabe S, Maeda K, Imai M, Yotsuyanagi H, Mitsuya H, Ohmagari N, Takeda M, Hasegawa H, Kawaoka Y.
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Journal Title
N Engl J Med
Volume: 26
Pages: c2119407
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] An Outbreak of USA300 Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Among People With HIV in Japan2021
Author(s)
Kazuhiko Ikeuchi, Eisuke Adachi, Takashi Sasaki, Masato Suzuki, Lay Ahyoung Lim, Makoto Saito, Michiko Koga, Takeya Tsutsumi, Yasutoshi Kido, Yuki Uehara, Hiroshi Yotsuyanagi
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Journal Title
J Infect Dis
Volume: 223
Pages: 610-620
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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