高齢者肺炎における肺炎球菌保菌調査の構築と分析

2023 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 20K08841
• Research Institution: Nagasaki University
• Principal Investigator: 森本 浩之輔 長崎大学, 熱帯医学研究所, 教授 (50346970)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2025-03-31
• Keywords: 肺炎球菌 / 保菌 / 肺炎

Outline of Annual Research Achievements

2020年冬期から長崎市内の市中病院で研究対象症例の登録を開始した。当初順調に症例登録を行ったが、2020年2月以降に発生した新型コロナウイルスパンデミックにより研究の遂行が困難になった。新型コロナウイルス以外の病原体による肺炎患者が激減したこと、感染対策の観点から発熱患者から書面で同意を取得した上で研究のために咽頭ぬぐい液を採取することが不可能になったこと、また新型コロナウイルス対策により協力市中病院が研究を行うマンパワーを確保できなくなったことが原因として挙げられる。
研究の代替案として、リハビリを目的とした病院において、入院時の咽頭や唾液中の保菌を分析しその後の肺炎発症時の起炎菌との相関を調査する研究を発案し、病院の責任者と議論を進めた。しかしながら、当該病院における1年間の肺炎発症数が研究により結論を導くには十分ではなく、断念した。
休止している間、口腔内における病原体、特に肺炎球菌の保菌をPCRで検出する方法を開発した。唾液を用いた検査では、肺炎球菌のPCRで一般的に使用されるターゲット遺伝子であるlytAの特異性が低く、より精度を上げるための新規multi-plex PCRシステムを開発した。R5年度はこの有用性を陽性コントロールと肺炎球菌近縁の連鎖球菌、実際の検体を用いて検討した。その結果、lytAのみでは肺炎球菌以外の連鎖球菌がしばしば検出されることがわかった。
血清型特異的PCRのシステムをnanofluidicテクノロジーを用いて開発しており、これと前記のulti-plex PCRを組み合わせて高齢者の唾液からの肺炎球菌検出を試みた。高齢者の唾液中の肺炎球菌は少量であると推察され、タンパク分解酵素を用いたDNA抽出により効率を上げた。

Current Status of Research Progress

4: Progress in research has been delayed.

Reason

医療機関における新型コロナウイルスに対する警戒心は依然として強く、臨床現場での呼吸器感染症の患者を対象とした検体採取は引き続き困難であった。また、肺炎患者は徐々に増加しているが、新型コロナウイルスの病棟内での流行などにより入院加療される頻度が下がり、研究対象とできる患者数が減少していることも影響した。

Strategy for Future Research Activity

研究内容を一部変更し、一般的な病原体による肺炎が増加し、臨床現場の新型コロナウイルスによる作業量が減少したタイミングでの再開を協力医師と協議している。

Causes of Carryover

新型コロナウイルス感染による研究の停滞、新規研究を発案し実行に移そうとしたが話し合い段階で断念するなど、研究の遂行が計画通り進まなかったため、次年度使用額が生じた。次年度に繰り越した経費については、再開した場合の微生物検査やそれに要する資材に使用する予定である。