2020 Fiscal Year Research-status Report
網羅的遺伝子・エピゲノム解析による性成熟疾患の病因の解明
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20K08876
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| Research Institution | National Center for Child Health and Development |
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Principal Investigator |
鈴木 江莉奈 国立研究開発法人国立成育医療研究センター, 分子内分泌研究部, (非)研究員 (60726785)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
松原 圭子 国立研究開発法人国立成育医療研究センター, 分子内分泌研究部, 上級研究員 (90542952)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | NDNF遺伝子 / DNAメチル化解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本年度は、思春期遅発症患者を対象にサンガー法による遺伝子バリアント解析、DNAメチル化解析を行い、下記の成果を得た。
①近年、思春期遅発症の新規責任遺伝子としてNDNF遺伝子が報告された。日本人思春期遅発症患者におけるNDNF遺伝子バリアントの関与の程度を明確にするため、思春期遅発症を呈する日本人61例を対象にサンガー法を用いてバリアントスクリーニングを行った。解析の結果、NDNF遺伝子の同義置換を9つ同定した。以上の結果より、われわれは日本人思春期遅発症患者におけるNDNF遺伝子の病原性バリアントが稀であることを明らかにした。
②思春期遅発症に関与するDNAメチル化変化を同定するため、既知責任遺伝子バリアント陽性の思春期遅発症男性患者9例、健常成人男性8例と健常男児4例を対象に網羅的DNAメチル化解析を行った。得られたデータを用いてバイオインフォマティクス解析を行い、思春期遅発症男性患者と健常男性群との間でDNAメチル化レベルに有意な差を認める1,000以上のプローブを同定した。現在、同定したプローブのDNAメチル化変化の再現性を確認するため、既知責任遺伝子バリアント陽性の思春期遅発症男性患者13例、原因不明思春期遅発症男性患者31例、健常成人男性50例を対象にパイロシークエンス法を用いてDNAメチル化率を算出している。一部の既知責任遺伝子バリアント陽性の思春期遅発症男性患者においてDNAメチル化変化が存在するという結果を得ている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初の計画に沿って研究を進められた。重要な点として、①の成果について論文化することができた (Tamaoka S., Suzuki E. et al., Hum Genome Var. 2021)。
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| Strategy for Future Research Activity |
2021年度も引き続き、遺伝学的解析手法を用いて性成熟疾患 (思春期早発症と思春期遅発症)の新規発症責任遺伝子を同定する。また、性成熟疾患におけるエピゲノム異常の関与の有無および寄与の程度を明らかにする。研究成果を公表するため、論文執筆にも力を入れる。
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| Causes of Carryover |
2020年度にエクソーム解析を予定していたが、コロナウイルス感染の影響で納品が遅れた試薬があって行うことができなかった。その代わりに2021年度に予定していたサンガー法による遺伝子バリアント解析を2020年度に行った。どちらも当初の研究計画にある実験であり、研究計画全体の進捗に問題は生じていない。
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