小児呼吸器腫瘍の網羅的遺伝子解析とプロテオーム解析を用いた創薬ターゲットの検索

2022 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 20K08946
• Research Institution: Kanagawa Children's Medical Center (Clinical Research Institute)
• Principal Investigator: 田中 水緒 地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立こども医療センター(臨床研究所), 臨床研究所, 部長 (60565232)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 永原 則之 日本医科大学, 医学部, 准教授 (10208043) ; 田中 祐吉 地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立こども医療センター(臨床研究所), 臨床研究所, 医師 (50420691)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 小児呼吸器腫瘍 / 先天性嚢胞性肺疾患 / 次世代シーケンサー / RNAシークエンス

Outline of Annual Research Achievements

小児呼吸器腫瘍は肺の発生異常が背景にあることや、喫煙を含む環境要因の程度が低いことなど成人の肺癌とは異なる病因で発症することが多い。腫瘍の種類も小児や若年に特有のものがあり、腫瘍の診断・治療には成人とは異なるアプローチが必要である。本研究では、小児呼吸器腫瘍の分子生物学的背景を明らかにすることで、病態を解明しその中から特異性の高い診断マーカーの同定を行うことを目的とする。具体的には、次世代シーケンサーおよびプロテオーム解析を用いて、新生児期・小児期にみられる呼吸器腫瘍およびその前病変の細胞遺伝学的背景を解明および診断マーカーの確立を試みる。
本年度は昨年度に引き続き当施設の病理アーカイブより分子生物学的背景が明らかにされていない小児肺腫瘍を抽出し、次世代シーケンサーを用いてRNAシーケンスを行った。昨年度、新生児・胎児に発症する肺腫瘍様病変で見出した既報告のない遺伝子異常について追加症例での検討が必要と考えていたところ、国内他施設より同病変と考えらえる症例の提示があった。提供施設での組織学的・免疫組織学検討の結果は、同病変を強く示唆するものであった。現在各種手続きを行い、提供症例について分子生物学的検討の開始の準備をしている。同病変は比較的新しい疾患概念であり、世界的にも20例程度の報告例を認めるのみである。われわれが見出した遺伝子異常がこれらの病変での検出の有無を確認することで、疾患概念の確立に寄与し、さらに遺伝子治療の可能性も示唆しうると考える。
本年度は当施設アーカイブより、さらに2症例の新生児早期死亡にいたった肺病変を抽出した。組織学的・免疫組織学検討の結果、いずれも既に確立されている病名では説明の難しい疾患であったため、次世代シーケンサーを用いてRNAシーケンスを行った。現在結果解析中である。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当科アーカイブより小児呼吸器腫瘍を抽出し、胎児・新生児に特異的に発症する腫瘍1例で既報告のない遺伝子異常が検出され、国内他施設の協力を得て同遺伝子異常の検討を進めている。検体提供に関わる手続きに若干時間を要したが、概ね想定の範囲で進展している。
また、当科アーカイブより2例の新生児早期死亡に至った肺病変を抽出し、この2例について組織学的・免疫組織学検討ののち、次世代シーケンサーを用いた検討を開始した。

Strategy for Future Research Activity

腫瘍発生に関わる遺伝子異常についての研究は近年の急速な進歩がみられる一方、小児の呼吸当科のアーカイブを用いた、次世代シーケンサーの予備実験を開始しており、一部論文発表に値する結果が得られている。対象症例を拡大して検討を進める予定である。プロテオーム解析については対象症例を選択から着手する。
また、症例集積のため当科アーカイブの症例に加えて希少疾患については国内他施設の協力が望ましく、小児病理・小児外科のネットワークを活用して協力機関を募ることを予定している。

Causes of Carryover

本年度は新型肺炎拡大など世界情勢のため、一部の試薬、実験器具の入手の遅延が生じ、また共同研究者とのミーティングの延期や研究会・学会の中止があり、申請時に予定していた研究予定の一部が先送りとなったため、次年度使用額が生じた。

Research Products

• [Journal Article] Fetal lung interstitial tumorの1例 (2022)
  • Author(s): 西野 彰悟, 黒田 靖浩, 畠山 理, 玉置 祥子, 芳本 誠司, 長谷川 大一郎, 小阪 嘉之, 杉岡 勇典, 赤坂 好宣, 田中 水緒, 吉田 牧子
  • Journal Title: 日本小児血液・がん学会雑誌 Volume: 59 Pages: 86