2020 Fiscal Year Research-status Report
Distribution and clonality of multiple intraductal neoplasms of the pancreas evaluated by morphology
| Project/Area Number |
20K09070
|
|---|
| Research Institution | Center for Clinical and Biomedical Research, Sapporo Higashi Tokushukai Hospital |
|---|
Principal Investigator |
唐崎 秀則 医療法人徳洲会札幌東徳洲会病院医学研究所, がん生物研究部, 客員研究員 (50374806)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
水上 裕輔 旭川医科大学, 医学部, 教授 (30400089)
小野 裕介 医療法人徳洲会札幌東徳洲会病院医学研究所, ゲノム診断研究部, 部門長 (40742648)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
|
| Keywords | 背景膵 / 膵発癌素地 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
膵癌周辺の肉眼的正常膵に分布する微小膵管内病変の遺伝子変異プロファイルを取得することにより、膵発癌素地（premalignantfield defect）並びに、発癌・進展・再発様式の多様性を明らかにするという目的に沿って、通常型膵癌1例、IPMN由来浸潤癌1例、非浸潤性IPMN1例の切除例に対して、背景膵病変の徹底解析を行った。具体的には上記それぞれ88,41,91病変の形態分類とマッピング、DNA採取と変異解析を終了している。ここまでの中間解析により今後の研究推進方法に対して必要な改良を協議した。多数病変を効率的に解析するために、またコストを抑えるためにもKRAS/GNAS遺伝子変異をデジタルPCRでスクリーニングして、変異病変のみを遺伝子パネル解析に進めることとした。パネルも中間解析の結果から、解析遺伝子を吟味して新規パネルを作成した。組織学的に異常を認めない（異型のない）「正常膵管」もこれらのパネル解析が相当な確率で可能なことも明らかになった。現在はこれら解析病変の膵内での分布、病変間の連続性と変異情報の関連を可視化すべく、様々な方法を検討中である。これにより単なる病変間距離ではなく、病変の連続性も加味した変異の広がりが評価可能となる見込みである。この評価にはバーチャルスライドの活用が必要で、その導入と操作手順の標準化を終えた。
さらに、上記以外の4切除例について臨床・病理情報の整理を終え、さらにそのうちの1例のマッピングと異型度評価が終了している。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
バーチャルスライドを用いた作業工程の確立に想像以上に時間を要した。そのほかのサンプリングや遺伝子解析自体は予定通りに進行している。ただし、中間解析の結果、コストパフォーマンスの問題からパネルのバージョンアップを要した。
病変の地理情報を簡潔に表示する方法の開発が喫緊の課題で、試行錯誤中である。
|
| Strategy for Future Research Activity |
症例の集積自体は問題ない。遺伝子解析の工程・手技・精度も安定している。これら変異情報と病変の分布に関する情報（地理情報）の効果的な提示方法の開発が重要な課題となる。
|
| Causes of Carryover |
多数例での解析を効率よく行うために方法論の詳細をつめる検討が中心になったため、予算が予定よりも少なく経過している。多数例での解析で必要となる繰り越しである。
|
-
-
-
-
-
[Presentation] FEASIBILITY OF DIGITAL PCR-BASED QUANTIFICATION AND MUTATION ANALYSIS OF PLASMA CELL-FREE DNA FOR DIAGNOSIS AND SURVEILLANCE OF EARLY-STAGE PANCREATIC TUMORS.2020
Author(s)
Okada T, Mizukami Y, Koizumi K, Takahashi K, Iwano H, Asahara S, Kuwatani M, Kawamoto T, Sato H, Hayashi A, Kawabata H, Goto T, Sasajima J, Fujiya M, Ono Y, Karasaki H, Okumura T.
Organizer
DDW2020
Int'l Joint Research
-
