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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Identification of the enhancer sequences that are controlled by androgen receptor

Research Project

Project/Area Number 20K09539
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

藤田 潤  京都大学, 医学研究科, 客員研究員 (50173430)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 赤松 秀輔  京都大学, 医学研究科, 准教授 (20767248)
武田 俊一  京都大学, 医学研究科, 名誉教授 (60188191)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywordsアンドロゲン / LNCap / 前立腺癌 / トランスクリプトーム / エンハンサー / c-MYC
Outline of Annual Research Achievements

前立腺癌は、男性ホルモン、アンドロゲン依存的に増殖する。転移がある前立腺癌は、アンドロゲンの作用を抑制するホルモン治療が使われる。本研究の目的は、アンドロゲンで活性化される転写制御領域(エンハンサー)を見つけることにある。エンハンサーを同定することは、ホルモン治療への抵抗性の機序を解明することにつながる。
従来、エンハンサーは、エピジェネティックマーカー(例、DNase hypersensitivity、ヒストンH3 K27Ac、H3K4me1)により同定された。この手法は、恒常的に活性化されているエンハンサーの同定には有効であるが、ホルモン曝露後すぐに活性化される動的エンハンサーの同定には適さない。この問題を克服したのが、京都大学・村川泰裕教授であり、活性化されたエンハンサーからのみ発現されるenhancer RNA (eRNA) を世界最高感度に検出するNET-CAGE手法を開発した (Nature Genet 2019, PMID:31477927)。
我々は、前立腺癌細胞株、LNCap(野生型とTDP2欠損株)にアンドロゲンを加え、2、3、4、6、12、24時間後にRNAを抽出し(各時点に3サンプル毎)、eRNAと遺伝子プロモーターからの転写物を定量した。TDP2欠損はeRNAの発現を亢進する。以上の解析の結果、アンドロゲン追加によってeRNA発現が誘導するエンハンサーを2,000箇所以上同定した。うち半分は新規に見つかったものである(新規エンハンサー)。既知のアンドロゲン依存的エンハンサーと新規エンハンサーとのあいだで、エピジェネチィックマーカーとの共局在、アンドロゲン受容体結合サイトとの共局在、FOXA1転写因子結合サイトとの共局在に関して、差異はなく、新規エンハンサーも真にアンドロゲン依存的と結論した。我々の発見は、アンドロゲンの作用機序解明に貢献する。

  • Research Products

    (12 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (5 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 5 results)

  • [Int'l Joint Research] Cedars-Sinai Medical Center/Memorial Sloan Kettering Cancer Center(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Cedars-Sinai Medical Center/Memorial Sloan Kettering Cancer Center
  • [Int'l Joint Research] Shenzhen University(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      Shenzhen University
  • [Int'l Joint Research] University of Bern(スイス)

    • Country Name
      SWITZERLAND
    • Counterpart Institution
      University of Bern
  • [Int'l Joint Research] University of Oxford(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      University of Oxford
  • [Int'l Joint Research] University of British Columbia/BC Cancer Agency(カナダ)

    • Country Name
      CANADA
    • Counterpart Institution
      University of British Columbia/BC Cancer Agency
  • [Journal Article] ATM suppresses c-Myc overexpression in the mammary epithelium in response to estrogen2023

    • Author(s)
      Najnin Rifat Ara、Al Mahmud Md Rasel、Rahman Md Maminur、Takeda Shunichi、Sasanuma Hiroyuki、Tanaka Hisashi、Murakawa Yasuhiro、Shimizu Naoto、Akter Salma、Takagi Masatoshi、Sunada Takuro、Akamatsu Shusuke、He Gang、Itou Junji、Toi Masakazu、Miyaji Mary、Tsutsui Kimiko M.、Keeney Scott、Yamada Shintaro
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 42 Pages: 111909~111909

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.111909

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Physiological concentrations of glucocorticoids induce pathological <scp>DNA</scp> double‐strand breaks2022

    • Author(s)
      Akter Salma、Shimba Akihiro、Ikuta Koichi、Mahmud Md. Rasel Al、Yamada Shintaro、Sasanuma Hiroyuki、Tsuda Masataka、Sone Masakatsu、Ago Yukio、Murai Kenichi、Tanaka Hisashi、Takeda Shunichi
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 28 Pages: 53~67

    • DOI

      10.1111/gtc.12993

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Development and validation of prediction model for incident overactive bladder: The Nagahama study2022

    • Author(s)
      Funada Satoshi、Luo Yan、Yoshioka Takashi、Setoh Kazuya、Tabara Yasuharu、Negoro Hiromitsu、Yoshimura Koji、Matsuda Fumihiko、Efthimiou Orestis、Ogawa Osamu、Furukawa Toshi A、Kobayashi Takashi、Akamatsu Shusuke
    • Journal Title

      International Journal of Urology

      Volume: 29 Pages: 748~756

    • DOI

      10.1111/iju.14887

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Clinical significance of <scp>IDC‐P</scp> as predictive factor after intensity‐modulated radiation therapy2022

    • Author(s)
      Aizawa Rihito、Tsuzuki Toyonori、Haga Hironori、Nakamura Kiyonao、Ogata Takashi、Inoue Takahiro、Kobayashi Takashi、Akamatsu Shusuke、Goto Takayuki、Ogawa Osamu、Mizowaki Takashi
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 113 Pages: 2425~2433

    • DOI

      10.1111/cas.15392

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Clinical Utility of Germline Genetic Testing in Japanese Men Undergoing Prostate Biopsy2022

    • Author(s)
      Akamatsu S、Terada N、Takata R、Kinoshita H、Shimatani K、Momozawa Y、Yamamoto M、Tada H、Kawamorita N、Narita S、Kato T、Nitta M、Kandori S、Koike Y、Inazawa J、Kimura T、Kimura H、Kojima T、Terachi T、Sugimoto M、Habuchi T、Arai Y、Yamamoto S、Matsuda T、Obara W、Kamoto T、Inoue T、Nakagawa H、Ogawa O
    • Journal Title

      JNCI Cancer Spectrum

      Volume: 6 Pages: pkac001

    • DOI

      10.1093/jncics/pkac001

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Prognostic significance of pathogenic variants in BRCA1, BRCA2, ATM and PALB2 genes in men undergoing hormonal therapy for advanced prostate cancer2022

    • Author(s)
      Kimura H、Mizuno K、Shiota M、Narita S、Terada N、Fujimoto N、Ogura K、Hatano S、Iwasaki Y、Hakozaki N、Ishitoya S、Sumiyoshi T、Goto T、Kobayashi T、Nakagawa H、Kamoto T、Eto M、Habuchi T、Ogawa O、Momozawa Y、Akamatsu S
    • Journal Title

      British Journal of Cancer

      Volume: 127 Pages: 1680~1690

    • DOI

      10.1038/s41416-022-01915-2

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A case of microsatellite instability-high clinically advanced castration-resistant prostate cancer showing a remarkable response to pembrolizumab sustained over at least 18 months2022

    • Author(s)
      Shimizu Kosuke、Sano Takeshi、Mizuno Kei、Sunada Takuro、Makita Noriyuki、Hagimoto Hiroki、Goto Takayuki、Sawada Atsuro、Fujimoto Masakazu、Ichioka Kentaro、Ogawa Osamu、Kobayashi Takashi、Akamatsu Shusuke
    • Journal Title

      Molecular Case Studies

      Volume: 8 Pages: a006194~a006194

    • DOI

      10.1101/mcs.a006194

    • Peer Reviewed / Open Access

URL: 

Published: 2023-12-25  

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