2020 Fiscal Year Research-status Report
HLAリスク因子陰性のベーチェット病患者を対象としたゲノムワイド関連解析
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20K09806
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| Research Institution | Yokohama City University |
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Principal Investigator |
山根 敬浩 横浜市立大学, 医学研究科, 客員講師 (30714448)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
目黒 明 横浜市立大学, 医学研究科, 特任准教授 (60508802)
水木 信久 横浜市立大学, 医学研究科, 教授 (90336579)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | ベーチェット病 / ゲノムワイド関連解析 / HLA / 疾患感受性遺伝子 / SNP |
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| Outline of Annual Research Achievements |
ベーチェット病は全身の諸臓器に急性の炎症を繰り返す原因不明の難治性炎症性疾患であり、口腔内アフタ性潰瘍、眼症状、皮膚症状、外陰部潰瘍の4症状を主症状とする。ベーチェット病は長期間に渡って再発と寛解を繰り返すため、ベーチェット病により重度の視力障害を来す患者は少なく、今なお失明率の高い疾患である。ベーチェット病は人種を超えてHLA（human leukocyte antigen）-B*51アリルと顕著に相関することが知られている。また、近年の遺伝子解析研究により、HLA-A*26アリルもベーチェット病の発症に関与することが報告されている。一方、これらHLAリスク因子を保有しないベーチェット病患者も存在しており、ベーチェット病の発症にはHLA以外の遺伝子も多数関与していることが示唆されている。
したがって本研究では、既に取得しているベーチェット病患者のゲノム全域に渡る遺伝子解析（ゲノムワイド関連解析（genome-wide association study：GWAS））のデータを活用し、ベーチェット病の発症に関与するHLA遺伝子以外の遺伝要因（疾患感受性遺伝子）の網羅的なスクリーニングを実行する。
2020年度は、日本人集団（患者611例、健常者737例）のGWASデータからHLAリスク因子（HLA-B*51、HLA-A*26）陰性のベーチェット病患者群および健常者群を抽出して、HLAリスク因子陰性者を対象としたGWASを実行し、HLAリスク因子陰性のベーチェット病患者と有意に相関を示すSNP（single nucleotide polymorphism：一塩基多型）を網羅的に同定した。その後、同定したSNPを対象に、新たな日本人集団を用いて追認試験（再現性の検討）を行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本研究では、既に取得している日本人集団のGWASデータを用いて、ベーチェット病の発症に関与するHLA遺伝子以外の疾患感受性遺伝子の同定を行う。
現在までに、日本人のHLAリスク因子（HLA-B*51、HLA-A*26）陰性者を対象としたGWASを完了しており、HLAリスク因子（HLA-B*51、HLA-A*26）陰性のベーチェット病と有意な相関を示す疾患感受性SNPを網羅的に同定している。また、同定した疾患感受性SNPを対象に、新たな日本人集団を用いて追認試験を行っている。
以上より、本研究は当初の研究計画のとおり、「おおむね順調に進展している。」といえる。今後引き続き研究を進めることで、当初の目標を達成できると考えている。
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| Strategy for Future Research Activity |
2020年度に引き続き、HLAリスク因子陰性者を対象としたGWASで同定した疾患感受性SNPについて、新たな集団（日本人、トルコ人、イラン人）を用いた追認試験を行い、ベーチェット病と真に相関を示すSNPを明確に特定する。その後、特定されたSNPの位置する遺伝子を対象に機能解析（立体構造解析、発現解析など）を実行し、特定したSNPが疾患感受性遺伝子の機能に与える影響を検討する。
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