2020 Fiscal Year Research-status Report
歯周病原因菌の病原性因子及び挿入配列を制御するsmall RNAの解析
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20K09922
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| Research Institution | Kagoshima University |
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Principal Investigator |
大貝 悠一 鹿児島大学, 医歯学域歯学系, 助教 (40511259)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
中田 匡宣 鹿児島大学, 医歯学域歯学系, 教授 (90444497)
小松澤 均 広島大学, 医系科学研究科(歯), 教授 (90253088)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | small RNA / 歯周病原因菌 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
歯周病原因菌のひとつであるAggregatibacter actinomycetemcomitansのsRNAを介した病原因子の発現制御を目的として以下の解析を行った。
・sRNA欠損株の作成
Aggregatibacter actinomycetemcomitansの欠損株作成法は一部の株で確立されているものの、多くの株では困難であることが知られている。申請者らによりsRNAの同定が行われたAggregatibacter actinomycetemcomitans HK1651株においてsRNAの欠損株作成を試みたものの欠損株は得られなかった。そこで、他株を用いた検討を行うことを見据え、株間におけるsRNAの分布及び全長の解析を定量性PCR及び5', 3' RACEにより行っている。HK1651株において病原性因子のmRNAと塩基対形成しうるsRNAを優先的に解析している。
・RNAシャペロンHfqにおける遺伝子欠損株の作成
申請者らにより保持されているいくつかのAggregatibacter actinomycetemcomitans株において遺伝子欠損が可能な株を探索するため、多くの細菌によりsRNAの遺伝子発現制御に関連するRNAシャペロンhfqの欠損株作成を試みた。結果３株のAggregatibacter actinomycetemcomitansにおいてhfqの欠損に成功した。これらの欠損株は一部の表現型の変動を野生型と比較し認めた。現在、その表現型に関連する遺伝子及びsRNAの探索を行っている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
以前にsRNAを網羅的に同定したAggregatibacter actinomycetemcomitans HK1651株におけるsRNAの個別解析は当初の予定通りには進んでいないものの、他のAggregatibacter actinomycetemcomitans株においてsRNAと強く相関すると予想されるRNAシャペロンhfqの欠損株を作成し、それらの病原性に変動を認めた。これらの詳細を今後明らかにすることで目的は達成されると考えられる。
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| Strategy for Future Research Activity |
遺伝子欠損可能株においてsRNAの欠損株作成を行う。必要な際は該当菌株のgenome配列およびsRNA発現の網羅的同定を行う。病原性因子の発現制御に関与するsRNAにおいてはその発現制御メカニズムの詳細を解明し、動物実験を用いた歯周病発症への関与を明らかにする。
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