Quantification of human-specific DNA in teeth placed in various environments

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20K10278
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 57080:Social dentistry-related
• Research Institution: Nihon University
• Principal Investigator: TSUTSUMI Hirofumi 日本大学, 歯学部, 講師 (30188594)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: ヒト特異的DNA量 / 分解指標 / STRタイピング / リアルタイムPCR法 / Quantifiler Trio

Outline of Final Research Achievements

This study examined the extent of DNA degradation and the amount of human-specific DNA over time (3, 6, 12, 22, and 26 months) by burying teeth in four different soils and using the Quantifiler Trio DNA Quantification Kit. We also examined the effects of the degree of degradation and the amount of human-specific DNA on STR typing. The results showed that there was no difference in the degradation index (DI value) between the different soils, but the DNA obtained showed moderate fragmentation, suggesting that STR typing is possible if the amount of human-specific DNA is sufficient for STR typing．

Free Research Field

歯科法医学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

法医学における試料は、腐敗あるいは陳旧化した微量な場合が多く、また、DNAが分解されて低分子化になっている。試料DNAが、ヒト由来であっても分解されている場合、そのDNAの分解度とTotal human genomic DNA定量値を求めることにより、後に行われるSTRタイピングに使用するDNA量を決定することが可能となれば、微量試料を無駄にせず検査することが可能となる。
また、本研究では、試料が置かれていた状況あるいはさらされていた期間における、ヒト特異的DNA量およびDNA劣化度を調べ、それらの違いによるDNAがSTRタイピングに与える影響について検討した。