Dissemination and phylogeny of carbapenemase harboring plasmids based on their gene contents.

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20K10457
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 58020:Hygiene and public health-related: including laboratory approach
• Research Institution: Fujita Health University
• Principal Investigator: Suzuki Masahiro 藤田医科大学, 医学部, 准教授 (70446649)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: プラスミド / 薬剤耐性

Outline of Final Research Achievements

β-lactamases in the major drug-resistant strains of Enterobacterales are often located on IncF plasmids. Genomic analysis of clinical isolates and machine learning of genomic data suggest that the combination of drug resistance plasmids and chromosomes is involved in the retention of drug resistance genes. Comprehensive analysis of the genetic properties of the chromosomes and the plasmid phylogeny is expected to help elucidate the predominant drug-resistant bacteria.

Free Research Field

薬剤耐性菌

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究により、プラスミドの系統解析が進み、薬剤耐性遺伝子は特定の系統に分類されるプラスミド上に多いことが明らかとなった。また、ゲノムデータの機械学習手法による解析に道筋を付けることに成功し、染色体の性質によって薬剤耐性プラスミドの保有頻度が決まることがゲノムデータから見いだされた。細菌のゲノム解析ではプラスミドと染色体の系統に着目することで、薬剤耐性菌として流行する潜在能力を推定するための基礎的知見が得られ、感染制御の一助となると期待される。