2022 Fiscal Year Annual Research Report
Causal inference between the NKG2D-ligand expression and the human phenome
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20K10509
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| Research Institution | Iwate Medical University |
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Principal Investigator |
須藤 洋一 岩手医科大学, いわて東北メディカル・メガバンク機構, 特命准教授 (50810561)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 免疫 / RNA-seq / NKG2Dリガンド / メンデル無作為化 / デンジャーシグナル |
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| Outline of Annual Research Achievements |
これまでの研究成果を取りまとめ、その一部をアメリカ人類遺伝学会(ASHG) 2022、第51回日本免疫学会学術集会でそれぞれ報告した。いずれの学会においても、人類遺伝学、あるいは免疫学の最近の動向を見て取ることができ、本研究の今後の研究の進め方を考える上で大いに参考になった。ASHGにおいてはシングルセル・RNA-seq （単一細胞ごとに個々の遺伝子発現量等を算出する手法）を用いた研究が主流となっており、本研究でもそういった新規手法を検討することの必要性を感じた。日本免疫学会においては、老化と免疫について多くの報告があった。老化に関連して出現する分子の中には、本研究が標的とするデンジャーシグナル（NKG2Dリガンド）も含まれており、本研究もその点において、現在の国内外の研究動向に沿うものであることが確認できた。同様に、本年度より開始された、次世代シーケンサー等を用いた最新の解析研究を報告するNGS EXPOにもリモート参加した。こちらもシングルセル・RNA-seq 等の解析手法が主流であり、本研究を進める上で必要な情報を得ることができた。
一方、当初の研究計画に従い、血液中から分離した末梢血単核球からのRNA-seq 解析を進めた。合わせて、基礎的な解析を概ね完了した。
研究期間全体を通じて、予定したRNA-seq 解析に加え、メンデル無作為化によるデンジャーシグナル（NKG2Dリガンド）発現量と疾患との関連性の解明を進めることができた。また、その結果を論文として報告し、学会での報告も行った。概ね当初期待した通りの成果が得られたと思われる。
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[Presentation] Mendelian randomization reveals the causal interaction of MICA transcription levels with the risk of Graves’ disease2022
Author(s)
Yoichi Sutoh, Shohei Komaki, Taiki Yamaji, Shiori Nakano, Ryoko Katagiri, Norie Sawada, Kanako Ono, Hideki Ohmomo, Tsuyoshi Hachiya, Yayoi Otsuka-Yamasaki, Akira Takashima, So Umekage, Motoki Iwasaki, Atsushi Shimizu
Organizer
The American Society of Human Genetics 71st Annual Meeting
Int'l Joint Research
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[Presentation] Low MICA transcription levels are associated with the risk of Graves’ disease: Mendelian randomization study2022
Author(s)
Yoichi Sutoh, Shohei Komaki, Taiki Yamaji, Shiori Nakano, Ryoko Katagiri, Norie Sawada, Hideki Ohmomo, Tsuyoshi Hachiya, Yayoi Otsuka-Yamasaki, So Umekage, Motoki Iwasaki, Atsushi Shimizu
Organizer
第51回日本免疫学会学術集会
