Causal inference between the NKG2D-ligand expression and the human phenome

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20K10509
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 58030:Hygiene and public health-related: excluding laboratory approach
• Research Institution: Iwate Medical University
• Principal Investigator: Sutoh Yoichi 岩手医科大学, いわて東北メディカル・メガバンク機構, 特命准教授 (50810561)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: 遺伝子発現解析 / eQTL / 単核球 / 細胞ストレス / NKG2Dリガンド / メンデル無作為化

Outline of Final Research Achievements

We conducted transcriptome analysis of peripheral mononuclear cells (PBMCs). The expression-quantitative trait loci (eQTL) were detected from the genotype data and the corresponding transcriptome data. Of the eQTLs, we focused on the NKG2D ligands - a group of molecules known as danger signals that are expressed in response to cellular stress. We conducted an analysis of the association between their expression levels and the risk of each disease using phenome-wide association analysis (PheWAS) and Mendelian randomization (MR) analysis. As a result, we confirmed a statistically significant association between the expression level of MICA - one of the NKG2D ligands, and the risk of diseases such as Graves' disease.

Free Research Field

免疫学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

NKG2Dリガンドの機能についてはこれまで動物を使用した研究では示されてきたが、人間における機能については不明な点が多かった。また、NKG2Dリガンドは人間と動物の間で違いが大きいことが知られており、動物で判明したことを人間に応用することが比較的困難であると考えられていた。今回の研究により、人間において、少なくともNKG2DリガンドのうちMICAの末梢血単核球における発現量と、バセドウ病などの疾患リスクとの間に因果関係があることが統計的に示唆され、将来的に、こうした疾患のメカニズム解明に貢献すると期待される。