2022 Fiscal Year Annual Research Report
A multilateral approach to the diagnosis of sudden cardiac death centering on DNA methylation
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20K10569
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| Research Institution | Kansai Medical University |
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Principal Investigator |
橋谷田 真樹 関西医科大学, 医学部, 准教授 (40374938)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | ミトコンドリアDNA / 心臓突然死 / 次世代シークエンサー / ゲノム変異解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
2022年度は次世代シークエンサーを用いたミトコンドリアDNA(mtDNA)解析を行った．mtDNAに変異が存在すると極めて重篤となる臨床症状を示し，ミトコンドリア病と呼ばれている．先天性で持つと乳幼児から症状が見られるが，成長後にミトコンドリア病を発症することもある．これは時間が経過すると共に変異を持つmtDNAの数が増加し，ある閾値を超えると臨床症状が出ると考えられている．特に心臓でこれが起きると心筋症の症状が出現し，突然死に至ることもあり得る．そこで当大学での解剖した突然死例のうち，1歳以下の乳幼児突然死9例，および成人6例を解析した．解剖中に採取した心筋，および心臓血からそれぞれDNAを抽出し，Precision ID mtDNA Whole Genome Panelを用いてmtDNA全領域の増幅を行い，Ion Chef Systemで前処理後， Ion Gene Studio S5 Systemでデータを取得した．得られたシークエンスデータは，ConvergeソフトウェアでmtDNA参照配列(rCRS)との変異解析を行った．なお，使用した試薬・機器はすべてThermo Fisher Scientific社製である．心筋と血液で全く同じ配列を示したのは15例中3例のみであり，心筋に生じたmtDNAの変異は蓄積されることが確認された．病原性変異は観察されなかったが，ATP8遺伝子エクソン中に塩基置換があるものが１例観察された．また，５例において，NADH dehydrogenase, subunit 4遺伝子の11038部位に変異が観察された．これらの変異と死因との関連はまだ不明であるが，心筋と血液間でのヘテロプラスミーや心筋内でのヘテロプラスミーの存在が複数例で観察されており，心臓突然死には心筋のゲノム変異のみならず，mtDNA変異が関与している可能性が示唆された．
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