口腔マイクロバイオームとヒトの相互作用による疾患の発症機序の解析

2020 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 20K11550
• Research Institution: Tohoku University
• Principal Investigator: 齋藤 さかえ 東北大学, 未来型医療創成センター, 講師 (20335491)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: マイクロバイオーム

Outline of Annual Research Achievements

ヒトの体に共生する微生物は健康に影響を与える環境要因の一つであり、炎症や免疫系など人体の仕組みと密接に相互作用し、疾患の発症にも関与している。本研究は、ヒトの遺伝的要因と口腔マイクロバイオーム（微生物叢）の多様性が糖尿病および動脈硬化症の発症にどのように関連していのるかを明らかにすることを目的としている。2020年度には、東北メディカル・メガバンク機構バイオバンクに口腔検体が登録されているコホート参加者から生理学検査情報をもとに200人（健常群、高血糖群、高コレステロール群、高血糖/コレステロール群を各50人）を選択し、唾液および舌苔検体からのDNA抽出を行った。予備検討として6検体でメタゲノム（ショットガン）シークエンスを実施し、ヒトDNAの混入率および同定された微生物種の数および種類を解析した。また、検体中に含まれる細菌の密度を測定するため、16SリボソームRNA遺伝子を標的とした定量PCRを検討しプロトコルを確立した。
ヒトの体に共生する微生物は地域や生活習慣によって構成が異なることが報告されており、日本人集団のマイクロバイオームの特徴を明らかにすることは、疾患の民族差の理解や個別化予防へつながる有用な取り組みである。今後、ヒトゲノム情報や血漿メタボローム情報との相関解析を進める予定であり、マイクロバイオームを標的とした糖尿病および動脈硬化症の新しいリスク因子の同定や、新しい治療法につながる知見が得られると期待できる。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

メタゲノムシークエンスの予備検討の結果に基づいて大規模シークエンスに着手しており、概ね想定通りに進捗している。

Strategy for Future Research Activity

当初の計画に従い、マイクロバイオーム解析を推進する。

Causes of Carryover

参加予定の学会大会が開催中止となり、旅費を使用しなかった。また実験補助員の雇用を控え、人件費・謝金を使用しなかったため次年度使用額が生じた。これらは、翌年度の物品費（実験試薬の購入）および受託解析サービスの利用に使用する計画である。