Establishment of a highly accurate pain assessment system using leukocyte single cell transcriptome analysis

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20K12724
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 90140:Medical technology assessment-related
• Research Institution: Okayama University of Science
• Principal Investigator: Ohwada Kazuo 岡山理科大学, 獣医学部, 特担教授 (60101010)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 野原 正勝 岡山理科大学, 獣医学部, 助教 (70649996)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: シングルセル / 疼痛

Outline of Final Research Achievements

Leukocyte separation from mouse blood was accomplished by a method using a density gradient separation reagent to remove platelets and a hemolysis reagent to obtain a leukocyte suspension from which platelets were mostly removed. Although good quality single cells could be obtained from leukocyte suspensions prepared under these conditions, the labels used to label the cells bound to each other's cells between test groups, making it impossible to identify and separate the leukocytes for analysis. Further study is needed to analyze the samples together in one lane of the single cell separation device.

Free Research Field

実験動物学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

マウスの血液は他の動物種と比較して、赤血球と血小板の数が多い。このことは血液サンプルを用いたシングルセル・トランスクリプトーム解析やmiRNAシーケンス解析において、白血球をターゲットとした場合に評価を困難なものとする。本研究成果は、全血から赤血球と血小板を取り除くことができ、白血球トランスクリプトーム解析の高精度化に貢献するものである。また本研究の分離法により得られた白血球サンプルは、シングルセル・トランスクリプトーム解析において、オリゴが結合した脂質で標識された細胞を識別して分類するセルマルチプレックスには不適であることを見出した。