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2022 Fiscal Year Annual Research Report

13C代謝フラックス解析を用いた分化細胞の代謝計測と運命制御

Research Project

Project/Area Number 20K15100
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

岡橋 伸幸  大阪大学, 大学院情報科学研究科, 准教授 (30802748)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords13C代謝フラックス解析 / 細胞分化 / 分化制御 / 中心炭素代謝 / 補酵素バランス
Outline of Annual Research Achievements

特定の機能を持つ細胞への分化誘導技術の開発は、再生医療の重要な課題である。本研究では、細胞種ごとに代謝状態が異なる可能性に注目し、代謝反応速度を計測できる13C代謝フラックス解析法を用いて、分化前後の細胞の代謝状態の定量的な比較に取り組んだ。さらに、得られた結果をもとに代謝状態を調節することで、細胞の分化方向性を外的に制御できるか検討した。解析対象には好中球モデル細胞のHL-60とマクロファージモデル細胞THP-1を選んだ。まず、これらの細胞を安定的に分化させる実験条件の検討、および、これらの細胞株に13C代謝フラックス解析を適用させるための基盤技術の最適化を行った。続いて、安定同位体である13Cで標識したグルコースやグルタミンを細胞内に取り込ませる13Cトレーシング実験を実施した。当初の解析では、実験データを十分説明する解が得られず、その傾向は特に分化後の細胞で顕著であった。これは、代謝フラックスの計算に利用する代謝モデルに考慮していない反応が実際の細胞で起こっているためと考えられた。そこで、非必須アミノ酸の取り込みや、細胞構成成分の分解反応を考慮に入れて計算を行ったところ、統計的に許容できる解が得らえることが明らかとなった。さらに、実際にそのような反応が起こっていることを13C標識実験で実証し、分化細胞に代謝フラックス解析を適用するための方法論を確立することができた。分化前後の細胞の代謝状態を比較したところHL-60は分化に伴って解糖系のフラックスが低減するのに対し、THP-1は活性化しており、分化後の細胞種ごとに代謝変化の方向性が異なることが明らかとなった。分化前後で著しく活性化した反応を代謝阻害剤で抑制したところ、それぞれの細胞の分化マーカーの発現量に変化が見られ、代謝への介入によって分化度合いを制御できる可能性が示唆された。

  • Research Products

    (3 results)

All 2022

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (2 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Isotope Calculation Gadgets: A Series of Software for Isotope-Tracing Experiments in Garuda Platform2022

    • Author(s)
      Okahashi Nobuyuki、Yamada Yuki、Iida Junko、Matsuda Fumio
    • Journal Title

      Metabolites

      Volume: 12 Pages: 646~646

    • DOI

      10.3390/metabo12070646

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 好中球の活性酸素種産生能の制御に向けた中心炭素代謝経路の定量解析法の構築2022

    • Author(s)
      谷口赳夫 岡橋伸幸 松田史生
    • Organizer
      第74回日本生物工学会大会
  • [Presentation] 代謝の”流れ”を観る2022

    • Author(s)
      岡橋伸幸
    • Organizer
      AgTechセミナー
    • Invited

URL: 

Published: 2023-12-25  

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