• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2022 Fiscal Year Annual Research Report

Verification of epigenetic abnormalities in hybrid endosperm and estimation of its mechanism

Research Project

Project/Area Number 20K15504
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

殿崎 薫  横浜市立大学, 木原生物学研究所, 助教 (20749494)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords生殖的隔離 / エピゲノム / ゲノムインプリンティング / イネ / 野生イネ / 胚乳
Outline of Annual Research Achievements

これまでの研究から、栽培イネと野生イネの雑種胚乳では、インプリント遺伝子の片親特異的な発現パターンに異常が生じることを明らかにしてきた。本年度は、これら雑種胚乳で異常を示すインプリント遺伝子が、どのようなエピゲノムに制御されるのかを調査した。昨年取得した栽培イネの胚乳におけるエピゲノム情報と比較した結果、インプリント遺伝子によって、その制御様式が大きく異なることを明らかにするとともに、雑種胚乳で発現パターンに異常が生じるインプリント遺伝子のほとんどが、抑制型のヒストン修飾であるH3K27me3に制御されていることが明らかになった。また、H3K27me3修飾に関わるポリコーム複合体の変異体系統(emf2a変異体)の胚乳でも、同様のインプリント遺伝子の発現パターンの異常が観察されたことから、種間交雑で見られる胚乳発生の異常は、雑種胚乳におけるH3K27me3レベルの変化が関与していることが示唆された。
さらに、雑種胚乳におけるH3K27me3レベルの変化が胚乳発生の異常に関与するかを検証するために、emf2a変異体と3種の野生イネとの種間交雑を実施したところ、2種の野生イネとの雑種胚乳の発生が正常化した。胚乳発生の正常化が見られた組合せでは、種間交雑から得られる雑種種子における生存率は有意に上昇しており、多くの種間交雑では雑種胚乳のH3K27me3レベルを低下させることで、生殖的隔離を緩和できることを明らかにした。現在は、栽培イネと野生イネとのエピゲノム解析を進めている。

  • Research Products

    (5 results)

All 2023 2022

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Multi-layered epigenetic control of persistent and stage-specific imprinted genes in rice endosperm2023

    • Author(s)
      Tonosaki Kaoru、Ono Akemi、Nagata Hiroki、Furuumi Hiroyasu、Nonomura Ken-ichi、Sato Yutaka、Comai Luca、Hatakeyama Katsunori、Kawakatsu Taiji、Kinoshita Tetsu
    • Journal Title

      Research Square

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.21203/rs.3.rs-2403620/v1

    • Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Comparative Evaluation of Three Commercial Quantitative Real-Time PCRs Used in Japan for Bovine Leukemia Virus2022

    • Author(s)
      Yoneyama Syuji、Kobayashi Sota、Matsunaga Towa、Tonosaki Kaoru、Leng Dongze、Sakai Yusuke、Yamada Shinji、Kimura Atsushi、Ichijo Toshihiro、Hikono Hirokazu、Murakami Kenji
    • Journal Title

      Viruses

      Volume: 14 Pages: 1182~1182

    • DOI

      10.3390/v14061182

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Will epigenetics be a key player in crop breeding?2022

    • Author(s)
      Tonosaki Kaoru、Fujimoto Ryo、Dennis Elizabeth S.、Raboy Victor、Osabe Kenji
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 13 Pages: -

    • DOI

      10.3389/fpls.2022.958350

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Multi-layers of epigenetic controls in the genomic imprinting during rice endosperm development2022

    • Author(s)
      Kaoru Tonosaki, Akemi Ono, Hiroyasu Furuumi, Yutaka Sato, Taiji Kawakatsu, Tetsu Kinoshita
    • Organizer
      CSHA Integrative Epigenetics in Plants
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] イネの胚乳発生過程におけるゲノムインプリンティングの多層的なエピゲノム制御2022

    • Author(s)
      殿崎薫, 木下哲
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会

URL: 

Published: 2023-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi