Survival strategies and potential pathogenicity of H. pylori in aquatic environments

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20K15582
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 40030:Aquatic bioproduction science-related
• Research Institution: Kochi University
• Principal Investigator: Takahashi Michiko 高知大学, 医学部, 特任助教 (40868189)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: ピロリ菌 / Helicobacter pylori

Outline of Final Research Achievements

A detection PCR system targeting virulence genes of H. pylori was established and applied to aquatic samples. In addition, the whole genome sequence of a clinical strain of H. pylori was successfully determined by combining short- and long-read sequencing. As a result of multi-locus-sequence-typing (MLST) analysis, it was found that six housekeeping genes, except one, were not classified to the existing ST number. Then, we changed some parts of research plan from the original versionn and focused on restriction-modification system which is one of the survival strategies of H. pylori against phage invasion.

Free Research Field

微生物学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ピロリ菌は世界人口の半数以上が保菌しており、多くは幼少期に感染するとされている。ピロリ菌の感染経路として経口・糞口感染が示唆されていることからも、天然の水圏環境が本菌の感染経路においてリザーバーの役割を果たしている可能性も推察されるが、その実態は明らかになっていないのが現状である。本研究では、水圏環境でピロリ菌のモニタリングを行うための検出系を構築した。加えて、臨床由来株の全ゲノム配列を決定し、公共データベースに登録した。本成果を手がかりとして、ピロリ菌がどのような生存戦略を有しているのか解析を進めたい。