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2023 Fiscal Year Annual Research Report

新生ポリペプチド鎖の空間的な局在化に伴ったmRNA分解機構と生理的意義の解明

Research Project

Project/Area Number 20K15748
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

石井 英治  大阪大学, 微生物病研究所, 助教 (10835698)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Keywords新生ポリペプチド鎖 / RNA / RNase
Outline of Annual Research Achievements

翻訳後の新生ポリペプチド鎖がもたらすRNAレベルでの挙動に着目した研究であり、特に細胞小器官による区画整理のなされていない細菌細胞内でのRNAの空間的な配置に新生鎖がどのようにして関わるかを生化学的な手法により解析することでその分子機構や生理的な意味合いの一端を解明しようとする研究である。具体的には、既に申請者が報告したビブリオ属菌が有する局在化タンパク質の翻訳アレストとそれに伴って制御される下流遺伝子の発現機構を基盤として研究課題にアプローチしてきた。
本年度は、前年度からの課題である長さの異なる二種類の転写産物の生成機構、特に短鎖転写産物の生成機構について解析を進めた。短鎖転写産物の生成過程やその生理的な意義は依然として明らかにすることができなかった。また、新生ポリペプチドの局在過程において各段階で関わる因子の変異や経路の遮断などによりRNAの挙動がどのように変化するかについて検証を行った。その結果、局在経路の遮断や局在にかかわる因子の変異によりS転写産物の挙動が異なることを見出した。今年度までに得られた結果を併せて、新生ポリペプチド鎖の挙動(本研究においては翻訳アレスト)に応じた転写産物の動態変化におけるその実態を捉え、分子機構の一端について明らかにすることができ、細菌研究における転写翻訳機構の。一方で、ポリペプチド鎖の空間的局在に応じたRNA挙動の変化を見出すことはできたものの、生化学的な手法の限界もありその詳細な分子機構や生理的な意味合いを明らかにすることができなかったため、これらは今後の課題となった。

  • Research Products

    (7 results)

All 2024 2023

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] The read-through transcription-mediated autoactivation circuit for virulence regulator expression drives robust type III secretion system 2 expression in Vibrio parahaemolyticus2024

    • Author(s)
      Anggramukti Dhira Saraswati、Ishii Eiji、Pratama Andre、Al Kadi Mohamad、Iida Tetsuya、Kodama Toshio、Matsuda Shigeaki
    • Journal Title

      PLOS Pathogens

      Volume: 20 Pages: e1012094

    • DOI

      10.1371/journal.ppat.1012094

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] The regulatory circuit of type III secretion system 2 genes in Vibrio parahaemolyticus2023

    • Author(s)
      Dhira Saraswati Anggramukti, Eiji Ishii, Andre Pratama, Mohamad Al kadi, Tetsuya Iida, Toshio Kodama and Shigeaki Matsuda
    • Organizer
      57th United States - Japan Cooperative Medical Science Program -Joint Panel Conference on Cholera and Other Bacterial Enteric Infections
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Single-Cell Analysis Of iPSC-Derived Organoids as Model to Study Host-Pathogen Interaction2023

    • Author(s)
      M. Al kadi, M. Ishikawa, S. Matsuda, Y. Liu, S. Sato, E. Ishii, S. Sakakibara, T. Kodama and D. Okuzaki
    • Organizer
      第46回分子生物学会年会
  • [Presentation] A positive regulatory loop of a virulence regulator gene linked by read-through transcription ensures pathogenicity in Vibrio parahaemolyticus2023

    • Author(s)
      Dhira Saraswati Anggramukti, Eiji Ishii, Andre Pratama, Mohamad Al kadi, Tetsuya Iida, Toshio Kodama and Shigeaki Matsuda
    • Organizer
      第76回日本細菌学会関西支部総会
  • [Presentation] Read-through transcription-mediated positive autoregulation of VtrB drives robust type III secretion system 2 expression in Vibrio parahaemolyticus2023

    • Author(s)
      Dhira Saraswati Anggramukti, Eiji Ishii, Andre Pratama, Mohamad Al kadi, Tetsuya Iida, Toshio Kodama and Shigeaki Matsuda
    • Organizer
      第55回ビブリオシンポジウム
  • [Presentation] The regulatory circuit of type III secretion system 2 genes ensures virulence in Vibrio parahaemolyticus2023

    • Author(s)
      Dhira Saraswati Anggramukti, Eiji Ishii, Andre Pratama, Mohamad Al kadi, Tetsuya Iida, Toshio Kodama and Shigeaki Matsuda
    • Organizer
      第21回あわじ感染と免疫国際フォーラム
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 腸炎ビブリオの病原性遺伝子島を制御する転写因子VtrBの遠位プロモーターによる正の自己制御機構の解析2023

    • Author(s)
      Dhira Saraswati Anggramukti、石井英治、児玉年央、Andre Pratama、Al kadi Mohamad、 飯田哲也、松田重輝
    • Organizer
      第19回21世紀大腸菌研究会

URL: 

Published: 2024-12-25  

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