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2021 Fiscal Year Research-status Report

Development of tracking integrated Raman spectroscopy to measure myosin state distribution in a sarcomere under physiological environment

Research Project

Project/Area Number 20K15762
Research InstitutionChubu University

Principal Investigator

新谷 正嶺  中部大学, 生命健康科学部, 助教 (40650536)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
KeywordsAIL: AI to learn / 深層学習型シンボリック回帰 / 概位相同期カオス振動子 / 熱筋節振動 / 筋節内ミオシン動態 / 収縮リズム恒常性 / UMAP / ラマン分光計測
Outline of Annual Research Achievements

ニューラルネットワークによる深層学習を中心とした人工知能技術は、ある程度の判断根拠の可視化を可能とするものの、基本的に、入力と出力の間のブラックボックスとして機能する。代表者は、人工知能技術を活用して、研究の学習や発見を効率化しつつ、学習や発見が出来た後は、人工知能技術由来のブラックボックスを抱え込まないで済む人工知能技術の使い方を「学習させる人工知能(AIL: Artificial intelligence to learn)」と命名し、本研究のデータ解析に適用した。
その結果、入力を実験データ、出力をデータに潜むと推定した数式とする、深層学習型シンボリック回帰によって、代表者が発見した、心筋細胞を温めると細胞内部のサルコメア(筋節)が収縮と弛緩を繰り返す熱筋節振動(HSOs; Hyperthermal Sarcomeric Oscillations)状態になる現象に関して、個々のサルコメアが概位相同期カオス振動子になっていることを発見した。HSOsは、一定の振動周期を保ちつつ、細胞内のカルシウム濃度変化の影響を受けて振動振幅や隣接サルコメア間の位相同期状態をカオス的に変化させていた。すなわち、温められた心筋サルコメアは安定性と不安定性を併せ持った収縮リズムを刻むことを明らかにした。2020年度に発表した数理モデルから、カオス的な不安定性がミオシン分子1個にかかる力を一定にして安定性を生み出すと予想している。本成果はAILによる、見落としを抑止し、効率的な研究発見を可能にした成果の実例であると共に、サルコメア内の分子動態に関する具体的な仮説でもある。
また、顕微ラマン分光計測とUMAP法による非線形次元圧縮による複合解析で、正常マウスと糖尿病モデルマウスの血液のラマン分光スペクトルを明確に区別できることの確認にも成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

人工知能技術由来のブラックボックスを抱え込まないで済む人工知能技術の使い方、「学習させる人工知能(AIL: Artificial intelligence to learn)」の活用によって、筋節内ミオシン動態を推定するために重要な現象(心筋細胞を温めると、振幅のカオス的不安定性と周期の恒常性的安定性を併せ持った収縮リズムが生じる)の発見と、その数理モデル予想を得ることに成功した。また、顕微ラマン分光計測により、正常マウスと糖尿病モデルマウスの血液を明確に区別できることも確認した。

Strategy for Future Research Activity

引き続き研究計画通りに研究を進める。そして、研究成果の論文・学会発表を継続する。

  • Research Products

    (19 results)

All 2022 2021 Other

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 7 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 1 results) Remarks (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Hyperthermal sarcomeric oscillations generated in warmed cardiomyocytes control amplitudes with chaotic properties while keeping cycles constant2022

    • Author(s)
      Shintani Seine A.
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 611 Pages: 8~13

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.04.055

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Drug-Releasing Gelatin Coating Reinforced with Calcium Titanate Formed on Ti?6Al?4V Alloy Designed for Osteoporosis Bone Repair2022

    • Author(s)
      Yamaguchi Seiji、Akeda Koji、Shintani Seine A.、Sudo Akihiro、Matsushita Tomiharu
    • Journal Title

      Coatings

      Volume: 12 Pages: 139~139

    • DOI

      10.3390/coatings12020139

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Does the Hyperthermal Sarcomeric Oscillations Manifested by Body Temperature Support the Periodic Ventricular Dilation With Each Heartbeat?2022

    • Author(s)
      Shintani Seine A.
    • Journal Title

      Frontiers in Physiology

      Volume: 13 Pages: 846206

    • DOI

      10.3389/fphys.2022.846206

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Changes in the structure and function of myofibrils during pressurization using a high-pressure microscope2021

    • Author(s)
      Shintani Seine A.
    • Journal Title

      J-STAGE Data

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.34600/data.biophysico.16625002.v1

    • Open Access
  • [Journal Article] Iodine-Loaded Calcium Titanate for Bone Repair with Sustainable Antibacterial Activity Prepared by Solution and Heat Treatment2021

    • Author(s)
      Yamaguchi Seiji、Le Phuc Thi Minh、Shintani Seine A.、Takadama Hiroaki、Ito Morihiro、Ferraris Sara、Spriano Silvia
    • Journal Title

      Nanomaterials

      Volume: 11 Pages: 2199~2199

    • DOI

      10.3390/nano11092199

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Bioactivation Treatment with Mixed Acid and Heat on Titanium Implants Fabricated by Selective Laser Melting Enhances Preosteoblast Cell Differentiation2021

    • Author(s)
      Le Phuc Thi Minh、Shintani Seine A.、Takadama Hiroaki、Ito Morihiro、Kakutani Tatsuya、Kitagaki Hisashi、Terauchi Shuntaro、Ueno Takaaki、Nakano Hiroyuki、Nakajima Yoichiro、Inoue Kazuya、Matsushita Tomiharu、Yamaguchi Seiji
    • Journal Title

      Nanomaterials

      Volume: 11 Pages: 987~987

    • DOI

      10.3390/nano11040987

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Effects of high-pressure treatment on the structure and function of myofibrils2021

    • Author(s)
      Shintani Seine A.
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: 18 Pages: 85~95

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v18.010

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Autonomous oscillation characteristics of the heart measured by the new electron microscope live imaging method2022

    • Author(s)
      Seine A. Shintani
    • Organizer
      The 99th Annual Meeting of the Physiological Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 温めた心筋で顕在化する収縮リズム恒常性と電子顕微鏡ライブイメージング2022

    • Author(s)
      新谷正嶺
    • Organizer
      生体運動研究合同班会議2022
  • [Presentation] 深層学習型シンボリック回帰活用で加速する、心拍リズム頑強性の研究2022

    • Author(s)
      新谷正嶺
    • Organizer
      第3回 中部大学・生理学研究所・基礎生物学研究研 連携セミナー ”AIと生命システム”
    • Invited
  • [Presentation] Mechanical properties of cardiomyocyte sarcomeric oscillations captured by sarcomere length nanometry and electron microscope live imaging2021

    • Author(s)
      Seine A. Shintani
    • Organizer
      The 59th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Enhancing differentiation of preosteoblast on selective laser melting Titanium implants treated with mixed acid and heat2021

    • Author(s)
      Phuc Thi Minh Le,Seine A. Shintani, Hiroaki Takadama, Morihiro Ito, Tatsuya Kakutani, Hisashi Kitagaki, Shuntaro Terauchi, Takaaki Ueno, Hiroyuki Nakano, Yoichiro Nakajima, Kazuya Inoue,Tomiharu Matsushita and Seiji Yamaguchi
    • Organizer
      MS&T21 Technical Meeting and Exhibition
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 電子顕微鏡ライブイメージング法による心臓の構造と動きの計測2021

    • Author(s)
      新谷正嶺
    • Organizer
      日本顕微鏡学会 第77回学術講演会
  • [Presentation] 温めた心筋細胞で顕在化する収縮リズム恒常性2021

    • Author(s)
      新谷正嶺
    • Organizer
      第73回日本細胞生物学会大会
  • [Presentation] ヨウ素含有チタン酸カルシウムを形成したチタン金属の抗菌性及びその長期安定性2021

    • Author(s)
      山口誠二, 伊藤守弘, Phuc Thi Minh Le, 新谷正嶺, 中村孝志, 高玉博朗
    • Organizer
      第40回整形外科バイオマテリアル研究会
  • [Presentation] 心筋を温めると顕在化する熱筋節振動の収縮リズム恒常性と電子顕微鏡ライブイメージング2021

    • Author(s)
      新谷正嶺
    • Organizer
      令和3年度 筋生理の集い
  • [Remarks] Research mapの研究者情報

    • URL

      https://researchmap.jp/Seine_A_Shintani

  • [Remarks] 所属大学の研究者情報

    • URL

      https://www.chubu.ac.jp/about/faculty/profile/b44e9f346b010f4dcaa34e30b1ced0d3e3c67b9a.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 走査型電子顕微鏡を用いた観察方法、及びそのための試料ホルダ2021

    • Inventor(s)
      新谷正嶺、山口誠二、高玉博朗
    • Industrial Property Rights Holder
      新谷正嶺、山口誠二、高玉博朗
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2020-103469
    • Overseas

URL: 

Published: 2022-12-28  

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