血清中cell free DNAを用いた悪性リンパ腫の中枢神経再発リスクの研究

2021 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 20K16365
• Research Institution: Nagoya City University
• Principal Investigator: 鈴木 智貴 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 助教 (80834001)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: びまん性大細胞型B細胞リンパ腫 / 中枢神経再発 / 次世代シーケンサー

Outline of Annual Research Achievements

本研究はびまん性大細胞型B細胞リンパ腫 (DLBCL)患者の重要な予後不良因子である中枢神経（CNS)再発を予測するための精度の高い因子を検討するものである。
リスク因子として特定の遺伝子変異の関与および、「骨髄中に腫瘍由来の遺伝子変異が検出されること（病理学的に骨髄への腫瘍浸潤を認めない症例においても）」を考慮している。
多施設よりCNS再発したDLBCL患者が合計で47例登録され、国内では最大級のCNS再発DLBCL患者のコホートであると考えられる。
登録患者から収集した腫瘍組織（FFPE)を用いて、genomic DNA (gDNA) を抽出した。47例のうち、gDNAが一定量採取可能であった26例について、全エクソンシーケンスによる遺伝子異解析を実施した。現在結果のとりまとめを行っているところである。
また、本研究に附随して登録された47症例の臨床病理学的な特徴についての評価を行った。特に、CNS再発後の予後に影響を与えた臨床的な因子を検討し、これらの成果について国内学会にて発表を予定している。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

FFPEから抽出したgDNAを用いて遺伝子変異解析を行ったため、gDNAの質が低いサンプルが存在した。これらにおいても信頼性の高い結果を得るために追加のシーケンスを行ったため時間を要している。また、アーチファクトと思われる結果と、真の結果の判定に若干時間を要している。

Strategy for Future Research Activity

ケース（CNS再発した患者）の腫瘍由来gDNAの全エクソンシーケンス結果から、CNS再発に関与する可能性がある遺伝子変異を複数個までに絞り込む。
絞り込んだ遺伝子をターゲットとしたターゲットシーケンスを、ケースの骨髄検体由来のgDNAおよびコントロール（CNS再発しなかったDLBCL患者）の腫瘍由来のgDNAを用いて実施する。

Causes of Carryover

解析の進捗に遅れが生じているため。残りの遺伝子変異解析を順次実施していく