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2021 Fiscal Year Annual Research Report

RNA修飾情報に基づいたがん原発巣を特定するバイオマーカーの開発

Research Project

Project/Area Number 20K16414
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

浅井 歩  大阪大学, 産業科学研究所, 特任助教(常勤) (40783262)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2022-03-31
KeywordsRNA修飾 / がん / バイオマーカー
Outline of Annual Research Achievements

我々はこれまでに消化器がんにおけるRNA修飾の検出によるがん診断方法を確立してきた。
本研究ではさらに多くのがん種に対して、RNA修飾の検出によるがん診断を適用するために、単分子シーケンサーによるRNA修飾の検出技術の確立及び臨床検体におけるRNA修飾の計測に取り組んだ。
まず、RNA修飾の化学合成品やRNA修飾を含有する核酸配列を用いて、単分子シーケンサーで計測することで、5-methylcytosine(5mC)をはじめとする各種RNA修飾由来のコンダクタンス情報を取得し、無修飾核酸との判別技術を確立した。
また、各RNA修飾の合成品の計測と並行して、様々ながん種の患者検体を集積しており、消化器系がん、婦人科系がん、泌尿器系がんなど計138検体からRNA抽出が完了し、順次、単分子シーケンサーによる計測を進めている。
単分子シーケンサーでの計測を進める中で、以前の質量分析による計測時と同様に、消化器がんで亢進しているlet-7aの19位のN6-methyladenosine(m6A)の検出に成功した。さらに、質量分析では検出することができなかったlet-7a中の他の箇所でも修飾を検出することができ、単分子シーケンサーは質量分析よりも高感度にRNA修飾を検出可能であることが示された。また、がん種特異的なバイオマーカーを同定するために、様々ながん種において検出されたRNA修飾を解析中であり、今後、本研究の成果として公表する予定である。
本研究の成果はRNA修飾の検出によるがん診断の実現に貢献するものである。

  • Research Products

    (3 results)

All 2022 2021

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results)

  • [Journal Article] Direct observation of DNA alterations induced by a DNA disruptor2022

    • Author(s)
      Ohshiro Takahito、Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Ohkawa Mayuka、Komoto Yuki、Ofusa Ken、Ishii Hideshi、Taniguchi Masateru
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Pages: 6945

    • DOI

      10.1038/s41598-022-10725-8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single-molecule RNA sequencing for simultaneous detection of m6A and 5mC2021

    • Author(s)
      Ohshiro Takahito、Konno Masamitsu、Asai Ayumu、Komoto Yuki、Yamagata Akira、Doki Yuichiro、Eguchi Hidetoshi、Ofusa Ken、Taniguchi Masateru、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Pages: 19304

    • DOI

      10.1038/s41598-021-98805-z

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Computational healthcare: Present and future perspectives (Review)2021

    • Author(s)
      Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Taniguchi Masateru、Vecchione Andrea、Ishii Hideshi
    • Journal Title

      Experimental and Therapeutic Medicine

      Volume: 22 Pages: 1351

    • DOI

      10.3892/etm.2021.10786

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2022-12-28  

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