子宮頸癌の網羅的ゲノム解析による放射線治療効果の予測因子の探索

2022 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 20K16731
• Research Institution: University of the Ryukyus
• Principal Investigator: 前本 均 琉球大学, 病院, 助教 (70774470)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 子宮頸癌 / 次世代シークエンサー / ゲノム解析 / 放射線治療

Outline of Annual Research Achievements

本研究では、子宮頸癌に対する根治的放射線治療を開始する前に遺伝子変異解析のため少量の生検検体を採取し、子宮頸癌の遺伝子変異情報を次世代シークエンサーを用いて網羅的に解析し、放射線治療の側面から治療効果や生存との関連を調べ、ひいては遺伝子変異情報に基づいて個別化された子宮頸癌の新たな治療戦略の開発につなげることを目的としている。具体的には、遺伝子変異情報に基づいて局所遺残や照射野内再発が多い群を特定できれば局所線量を増加させる、また照射野外再発や遠隔転移が多い群へは照射範囲や化学療法の内容を検討することで治療成績が向上する可能性がある。反対に治療成績が非常に良好な遺
伝子変異を有する群を特定できれば、治療強度を落として有害事象の低減を期待できる。さらには子宮頸癌の発症にはHPV感染が最大のリスク因子とされているが、本研究では子宮頸癌の網羅的遺伝子変異情報と原因HPV型の関連を詳細に解析し、子宮頸癌発症についての新たな知見を得ることも目的としている。子宮頸癌の原因となるHPV型は多数あり、その分布には地域差があることが報告されているため、本邦における子宮頸癌の網羅的遺伝子変異情報と、放射線治療の効果や原因HPV型の関連を調べる試みは独自性が高いと考えられる。本研究について、2020年度から検体採取を開始し、これまでに24検体を採取し、すべての検体からDNA抽出が完了した。網羅的遺伝子解析は6検体で完了し、今年度前半にはすべての検体について網羅的遺伝子解析を完了する予定である。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

予定通り令和４年度中に全検体の採取を完了した。今後は網羅的遺伝子解析が済んでいない17検体について実験を行う必要があるが、8月までに完了するスケジュールとなっている。十分な経過観察期間を確保したのち、研究結果のまとめや解析を行う予定である。

Strategy for Future Research Activity

2023年8月までに次世代シークエンサーを用いた解析までは完了し、以後は経過観察期間を確保したのち、研究成果をまとめて公表する予定である。十分な経過観察期間の確保のために研究成果の公表は次年度以降にずれこむ可能性はあるが、若干のずれは当初から想定しており、研究遂行上の問題は2023年3月時点では生じていない。

Causes of Carryover

実験に用いる試薬に使用期限が短いものが含まれており、当初はまとめて初年度に購入する予定であったが、実験の進捗にあわせてその都度購入する必要が出たため次年度使用額が生じている。また新型コロナの影響で旅費の支出がなかったことも次年度使用額が生じた原因である。試薬代が実験開始時よりも高騰しており、近年オープンアクセス誌が増え投稿費用が嵩むようになっているため、研究費は次年度ですべて使用される計画となっている。