2022 Fiscal Year Research-status Report
Project/Area Number |
20K16785
|
Research Institution | Shinshu University |
Principal Investigator |
金子 智喜 信州大学, 学術研究院医学系(医学部附属病院), 講師 (40324256)
|
Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
|
Keywords | functional MRI / ASD / voxel based morphometry / freesurfer |
Outline of Annual Research Achievements |
コロナ状況も改善し、患者リクルートを始めた。 前年度までボランティアによる画像評価方法を検討し、従来の画像処理方法(voxel based)と、HCPpipelinesで利用するsurface basedを比較し、後者で研究する方針となった。これに関しては両者を比較した差に関する報告を今年度の学会発表を行い論文化する方針。 結論として、標準脳への合わせ込みはvoxel basedがsurface basedに劣ることがわかり、脳の接続性解析に差を生じていることがわかった。一方、合わせ込み以外の信号の処理方法に関して、定まった方法がないため、今回はsurfacce baseによる画像処理を用いて研究することとする。 患者提供側の精神科と協議し、心理テストなど必要事項を決定した。
|
Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
コロナによる地方病院の患者制限や、診察差し控えがあり、エントリーに苦慮した。 2023年は5類へ移行したため、対象被検者の検査、及び患者リクルートを行い始めている。可能な限りリクルートに努めたい。 本来であれば、データ解析、学術報告の時期なので、1年から1年半程度の遅延となっている。 健常者を用いた単語認知に関する画像観察において、健常者の場合は一般コミュニケーションで利用する言葉の場合、優位半球の言語処理の領域は利用せず、紡錘状回での形態処理を行うのみで、瞬時に言語理解をしている(自動化)と考えられた。本来は、この段階でASD患者のリクルートを行う予定であったが、患者の診察控えやクラスター発生時の研究撮影ができないなど、さまざまな理由でリクルートが遅れた。 2023年、MRI検査機器のバージョンアップで撮影方法が刷新されるため、健常者、患者ともに最新バージョン(HCPpipelines用プロトコール)で再撮影する。
|
Strategy for Future Research Activity |
2023年中に、患者30〜40人、対象健常者30人〜40人ほどを完了させたい。 検査後の前処理に関しては、これまでの処理方法を刷新し、以下の内容で統一する 完了内容:撮影;HCPpipeline用のシーメンスプロトコールのインストールと、これを用いた被検者データ取得。 前処理;ワシントン大学からHCP pipeline と、workbenchをlinux PCにインストールし、上記被検者データによるpipeline前処理を行う。 これからの内容:健常者、被検者をそれぞれリクルートする。上記による3T T1MRI, T2 MRIをHCP pipelineを利用し、freesurferを用いた前処理(pre-freesurfer , freesurfer, post freesurfer)を行う。その後、fMRI用の前処理GenericfunctionalMRIVolumeと、surfaceを行い前処理を完了する。その後、SPMを利用した被検者データ間で言語処理に関する両者の違いを解析する。
|
Causes of Carryover |
患者のリクルートが遅延した影響で、画像の処理装置の用意、及び実データのストレージなどの用意が必要なかった。 2023年、撮影数を増やすにあたって、一人10時間近くかかるPCの刷新と、一人1Gを超えるデータをストレージするNASを用意する必要がある。
|