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2022 Fiscal Year Annual Research Report

対向型塩基損傷に対するDNA修復の検証-炎症性発がんのメカニズムの探求-

Research Project

Project/Area Number 20K17055
Research InstitutionKawasaki Medical School

Principal Investigator

森脇 隆仁  川崎医科大学, 医学部, 助教 (60734100)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
KeywordsDNA修復 / 炎症
Outline of Annual Research Achievements

本研究では炎症における突然変異誘発メカニズムの解明を試みた。これまで炎症による突然変異誘発メカニズムとして、シチジンジアミナーゼの発現誘導と活性酸素種の産生の二つの仮説から検証が試みられてきた。本研究ではシチジンジアミナーゼと活性酸素種の二つが同時に作用した時に、塩基対内の両方のDNAに同時に損傷が生じた対向型DNA損傷が突然変異の誘発に関わっているのではないかと仮説をたて、検証を行った。
炎症によって生じる対向型DNA損傷は8-オキソグアニンとウラシルによる塩基対が想定される。そこで8-オキソグアニンとウラシルが塩基対形成をするような二本のオリゴヌクレオチドを合成し、アニールさせることで対向型DNA損傷の基質を作成した。作成した基質を用いて、細胞抽出液内に対向型DNA損傷を認識するタンパク質があるか、タンパク質とオリゴヌクレオチドの相互作用を観察するゲルシフトアッセイで検証を試みた。その結果、ヒト細胞抽出液内に対向型DNA損傷を特異的に認識するタンパク質が存在することが分かった。また、対向型DNA損傷に対する修復活性を検証するべく、グリコシラーゼ活性を検出するニッキングアッセイとリアーゼ活性を検出するトラッピングアッセイを行った。ニッキングアッセイでは細胞抽出液によって対向型DNA損傷のウラシルが効率よく除去されることが分かった。その一方で8-オキソグアニンはほとんど除去されなかった。またトラッピングアッセイから、この反応にはリアーゼ活性を持つ酵素は関わっていないことが示唆された。各種アッセイの結果から考察すると、対向型DNA損傷はUNG1により認識され、優先的にウラシルが除去される可能性が高い。その一方でその後8-オキソグアニンがどのように除去されるかはまだ追加の検証が必要である。現在ゲルシフトアッセイで発見した特異的に認識するタンパク質について解析を進めている。

  • Research Products

    (4 results)

All 2023 2022

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results)

  • [Journal Article] A Case of Mucopolysaccharidosis II Caused by a Novel Variant with Skin Linear Hyperpigmented Streaks along Blaschko’s Lines2023

    • Author(s)
      Sofronova Viktoriia、Gurinova Elizaveta、Petukhova Diana、Fukamatsu Hiroko、Yamamoto Takenobu、Aoyama Yumi、Golikova Polina、Moskvitin Gavril、Ivanova Roza、Savvina Mira、Vasilev Filipp、Moriwaki Takahito、Terawaki Seigo、Sukhomyasova Aitalina、Maksimova Nadezhda、Otomo Takanobu
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 24 Pages: 5647~5647

    • DOI

      10.3390/ijms24065647

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] SPRTN and TDP1/TDP2 Independently Suppress 5-Aza-2′-deoxycytidine-Induced Genomic Instability in Human TK6 Cell Line2022

    • Author(s)
      Nakano Toshiaki、Moriwaki Takahito、Tsuda Masataka、Miyakawa Misa、Hanaichi Yuto、Sasanuma Hiroyuki、Hirota Kouji、Kawanishi Masanobu、Ide Hiroshi、Tano Keizo、Bessho Tadayoshi
    • Journal Title

      Chemical Research in Toxicology

      Volume: 35 Pages: 2059~2067

    • DOI

      10.1021/acs.chemrestox.2c00213

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A novel nonsense variant in ARID1B causing simultaneous RNA decay and exon skipping is associated with Coffin-Siris syndrome2022

    • Author(s)
      Sofronova Viktoriia、Fukushima Yu、Masuno Mitsuo、Naka Mami、Nagata Miho、Ishihara Yasuki、Miyashita Yohei、Asano Yoshihiro、Moriwaki Takahito、Iwata Rina、Terawaki Seigo、Yamanouchi Yasuko、Otomo Takanobu
    • Journal Title

      Human Genome Variation

      Volume: 9 Pages: 1~6

    • DOI

      10.1038/s41439-022-00203-y

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Hematopoietic Disorders, Renal Impairment and Growth in Mucopolysaccharidosis-Plus Syndrome2022

    • Author(s)
      Sofronova Viktoriia、Iwata Rina、Moriya Takuya、Loskutova Kiunniai、Gurinova Elizaveta、Chernova Mairanush、Timofeeva Anastasia、Shvedova Anna、Vasilev Filipp、Novgorodova Saina、Terawaki Seigo、Moriwaki Takahito、Sukhomyasova Aitalina、Maksimova Nadezhda、Otomo Takanobu
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 23 Pages: 5851~5851

    • DOI

      10.3390/ijms23105851

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2023-12-25  

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