ゲノムの詳細解析に基づく若年肺癌発生分子機序の解明

2022 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 20K17770
• Research Institution: National Cancer Center Japan
• Principal Investigator: 角南 久仁子 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 医長 (70766823)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: AYA世代がん / 非小細胞肺癌 / ドライバー遺伝子

Outline of Annual Research Achievements

本研究では、社会的な注目度が高い一方でその希少性から大規模データ解析を含めた発がん要因特定や治療開発が進んでいない若年(Adolescent and Young Adult, AYA) 世代における発がんに影響を及ぼす分子生物学的機序の解明を目的として、全ゲノムシークエンスを主体としたゲノム解析やRNAシークエンスデータ等と共に、臨床情報の統合解析を行う。対象がん種は特に予後不良な非小細胞肺癌(NSCLC)としている。これまでにドライバー遺伝子検索を実施しAYA世代NSCLCにおいては既報のドライバー遺伝子陽性症例の割合が高く、中でも融合遺伝子陽性症例が多いことを確認した。さらに、本邦において頻度の高いEGFR遺伝子変異陽性症例においてはAYA世代がんでEGFR L858R変異よりもexon 19 deletion変異の割合が大きいことを示した。EGFR exon 19 deletion変異においては複数のパターンが報告されているが、その変異パターンに注目しAYA世代と非AYA世代での頻度に差異がある可能性が示唆された。その結果に基づいて全ゲノムシークエンス実施症例の選定を行うと共に、既解析例データおよび公開データベースを用いて症例数を増やした検討に着手をした。さらに、より詳細な臨床データ (臨床病期、発生部位、生活歴等) を主に診療録から収集し、ゲノム解析に基づいた特徴と併せた検討に着手をした。

Current Status of Research Progress

4: Progress in research has been delayed.

Reason

臨床情報の収集とそのデータに基づいた症例選択および、既存データ解析に時間を有したため新規全ゲノム解析データの取得が遅延した。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度では新規症例に対して全ゲノム解析およびRNAシークエンスデータ取得を進める。また、収集した臨床データとの関連解析を実施し、最終的にはAYA世代がんと非AYA世代がんにおけるゲノム情報及び臨床情報を基にした比較検証を実施する。

Causes of Carryover

既存データおよび臨床データ解析を実施したため当初実施する予定であった全ゲノムシークエンスが実施できなかったため、解析費用が次年度に繰り越しとなった。また、学会発表等が主にオンライン開催になったことから、旅費もほぼ未使用となった。