2021 Fiscal Year Annual Research Report
神経線維腫症2型(NF2)における遺伝子診断法の確立
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20K17954
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
寺西 裕 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (50844635)
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2020-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 神経線維腫症2型 / Neurofibromatosis type 2 / NF2遺伝子 / 神経鞘腫 / 体細胞モザイク / Long read sequence / 生殖細胞変異 / Schwanomatosis |
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| Outline of Annual Research Achievements |
神経線維腫症2型(Neurofibromatosis type 2:NF2)はNF2 germline mutationにより脳腫瘍が多発し、根治治療法が無い遺伝性疾患である。実臨床ではNF2と臨床 診断されるが、NF2 germline mutationが検出されない患者が5割存在することが知られている。現在の診断基準は臨床診断であり、遺伝子診断は確立されていな い。本研究の目的はNF2患者におけるNF2遺伝子変異を正確に検出する方法を明らかにし、NF2の遺伝子診断法を確立することである。
Discovery study: Intron variantの検出:施行期間: 2020年4月~2021月9月
対象:これまでの解析でNF2と診断されるにも関わらずNF2 germline mutationが検出されず、かつ体細胞モザイクでもない患者の末梢血DNA計10検体を当初予定していた。しかし疾患責任遺伝子及びvariantだけでなく、修飾因子の存在も示唆される報告があったため、対象をNF2患者72例とした。 またシークエンスに関しては当初whole genome sequenceを行う予定であったが、intron variantやnon-coding lesionを対象としたsequenceが必要であること、また過去の報告ではNF2遺伝子及びschwannomatosisに関わるLZTR1, SMARCB1遺伝子以外に疾患発生に関わる遺伝子は発見されていないことから、この3遺伝子の全ゲノム領域に対するPac Bio sequel/sequel2を用いたlong read sequenceを行う方針となった。現在24検体分までのシークエンスが終了、残りの４８検体はprobe captureを行なっている段階である。
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Research Products
(7 results)
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[Journal Article] Targeted deep sequencing of DNA from multiple tissue types improves the diagnostic rate and reveals a highly diverse phenotype of mosaic neurofibromatosis type 22021
Author(s)
Yu Teranishi, Satoru Miyawaki, Hiroki Hongo, Shogo Dofuku, Atsushi Okano, Shunsaku Takayanagi, Takahiro Ota, Jun Yoshimura, Wei Qu, Jun Mitsui, Hirofumi Nakatomi, Shinichi Morishita, Shoji Tsuji, Nobuhito Saito
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Journal Title
Journal of Medical Genetics
Volume: 58(10)
Pages: 701-711
DOI
Peer Reviewed
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