メタゲノム解析を用いた口腔内細菌叢と内頚動脈狭窄症との関連性の追求

2020 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 20K18834
• Research Institution: Showa University
• Principal Investigator: 宮久保 あや子 昭和大学, 歯学部, 助教 (50643706)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: メタゲノム解析 / 口腔内細菌 / 内頚動脈狭窄症

Outline of Annual Research Achievements

近年、心血管疾患の病変部より口腔内常在菌が検出されたという報告を多数認める。口腔内常在菌が病変部に存在しているということは分かってきているが、実際の疾患に対する原因になっているのか、また検出された細菌が生菌であり活動していたのかなど不明な点が多い。
本研究は、内頚動脈狭窄症の病変部より得られた検体と口腔内プラークをメタゲノム解析し、網羅的に細菌の同定を行うこと。また、細菌のハウスキーピング遺伝子対応プライマーを用いてPCRを行い、発現量を解析することで検出細菌が生菌であったか検証する研究である。
本年度は検体54例の次世代シークエンスを行い、細菌の同定を行っている。

Current Status of Research Progress

4: Progress in research has been delayed.

Reason

検体54例から細菌の同定を行うために外部に発注したが、新型コロナウイルス蔓延の影響で同定に時間がかかった。
また、研究代表者の産休・育休のため研究の中断となった。

Strategy for Future Research Activity

検体54例の細菌の同定を行い、結果の分析を行う。
また、検体からRNAを精製し、細菌のハウスキーピング遺伝子対応プライマーを用いてr-PCRを行い、発現量を解析する。その結果を用いて検出細菌が生菌であったかを分析する。
研究結果を解析・検証し、論文や学会発表の準備をする。

Causes of Carryover

新型コロナウイルスの影響で研究に遅れがでた。
また、研究代表者の産休・育休のため研究が中断となっていた。