2023 Fiscal Year Research-status Report
臨床情報と細菌の薬剤感受性、遺伝子情報を統合した耐性菌と患者予後の関連の研究
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20K18972
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| Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
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Principal Investigator |
梶原 俊毅 国立感染症研究所, 薬剤耐性研究センター, 主任研究官 (40816948)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2025-03-31
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| Keywords | 薬剤耐性菌 / JANIS / ESBL産生腸内細菌目細菌 / 予後 / 医療経済 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
ESBL(Extended Spectrum Beta-Lactamase)産生菌は、入院患者検体での分離頻度が上昇し続けており、その患者予後に与える影響の理解と制御を行うことを目的に、３種類（広島大学院内感染症プロジェクト研究センター内にある10年間蓄積された広島県下12病院のESBL産生菌の菌株遺伝子情報とJANISに含まれる薬剤感受性情報、DPC情報）のビッグデータを統合解析し、(A) ESBL産生菌が分離された患者について、診療の過程で薬剤感受性が判明するまでに行われた経験的治療の内容によって、予後がどれだけ改善・悪化するのか、(B)世界中で頻度が増加しているST (Sequence Type) 131とその他の間で、および抗菌薬分解酵素タイプ
の違いによって、患者予後に有意な差があるか、(C) ほとんどの薬剤が無効にも関わらず、見かけ上感受性を示す「ステルス型」と称される耐性菌が患者予後をどれだけ悪化させるか、その治療にアミノグリコシド系薬剤併用が有効かどうか、を解明する。臨床情報を扱うため、各12病院で倫理審査を受けている。現在、１２病院中、１０病院において承認を受け、うち、７病院からDPC情報の収集を行った。３病院について、DPCデータの準備中であり、２病院において、倫理審査の準備を続けている。臨床情報を含まない菌株遺伝子情報とJANISの薬剤感受性情報は各病院の担当者にて準備は完了している。
収集した７病院のDPCデータと薬剤感受性情報、遺伝子情報は結合作業を行い、５病院で結合が完了した。解析に向けて、多数あるDPC項目のうち、必要な情報の選定と、予備解析を行い、さらに必要な情報を選定している。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
新型コロナウイルス感染症のパンデミックにより、各病院の担当者(主に臨床検査技師)の業務を圧迫し、残り２病院の倫理審査への対応が引き続き困難であった。本年度は３病院を訪問し、臨床情報の収集を行った。また、新型コロナウイルス感染症が落ち着いた時期を見計らい、３病院に対し担当者に病院内での臨床情報のデータ取得を依頼し、２病院については準備が完了したとのことで来年度取得を行う。また、統合データセットでは、感染症の原因菌であるかどうかの判別が困難のため、収集した結合データセットを現状に即した形で解析できるかどうかを検討しているところである。
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| Strategy for Future Research Activity |
引き続き、残り２病院の倫理審査を推進すること、残りの３病院についてDPCデータの収集を行うこと、統合プログラムの改善、発展を行う予定である。
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| Causes of Carryover |
新型コロナウイルス感染症の影響で、各病院におけるデータの準備ができず、訪問などで使用する旅費が計上できない状況であった。本年度は各病院のデータが準備でき次第、取得のために使用する予定である。また、収集したデータを結合、解析できる形に成形するプログラムの開発費用に使用する予定である。
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