2021 Fiscal Year Research-status Report
個人識別を目的とした試料の劣化に頑強な新規微生物叢解析法の開発
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20K18991
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| Research Institution | National Research Institute of Police Science |
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Principal Investigator |
豊間根 耕地 科学警察研究所, 法科学第一部, 研究員 (70845362)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 個人識別 / 微生物叢 / CRISPR |
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| Outline of Annual Research Achievements |
研究代表者はこれまでに、新規個人識別法の開発を目標として、皮膚微生物叢中に存在する真正細菌が保持するCRISPRに着目し、CRISPRのスペーサー配列を指標とした新規微生物叢解析法を構築してきた。本研究の当初の目的は、環境への曝露などによって生じる試料の劣化が、研究代表者が開発した新規解析法に対して与える影響を評価することであった。しかしながら、新型コロナウイルス感染症の流行を受けて、試料採取に支障をきたしており、昨年度はDNA抽出法の最適化について検討を進めた。
本年度も昨年度に引き続き、DNA抽出の最適化を目的とした抽出試薬の比較を進めた。二つのDNA抽出試薬を利用して皮膚スワブから抽出したDNAについて、qPCRによるDNA濃度の定量を行った。また、同DNAを試料としてスペーサー配列のアンプリコンシーケンス解析を実施し、Bray-Curtis指数による試料間の多様性の類似度について評価を行なった。昨年度に取得したデータと合わせて比較したところ、DNA濃度と試料間類似度のいずれのについてもDNA抽出の自動化はスペーサー配列の多様性解析に顕著な影響を生じないと考えられた。また、同解析を応用した個人識別においても、精度に影響を生じないと考えられた。
本年度に得られた結果については昨年度までのものと統合し、Forensic Science International: Reports誌に投稿した。既に受理されて2022年1月付で公開されている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
昨年度と同様に新型コロナウイルス感染症の影響を受けて試料の採集に遅れをきたしており、実験の遂行が遅れている。
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| Strategy for Future Research Activity |
来年度は元の計画では最終年度となるが、研究計画に遅れをきたしているため、研究課題の延長を視野に研究計画を進める。
元の計画通り、皮膚スワブについて採集と劣化試料の作成を行うことで実験を遂行することを目指すが、場合によっては皮膚微生物叢ではなく、既存試料の利用が可能な呼吸器や膣等の他の微生物叢についても検討する。
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| Causes of Carryover |
研究計画の遅れに伴って物品の取得が遅れているため。研究計画の延長を視野に使用計画も遅らせる。
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Research Products
(1 results)
