2021 Fiscal Year Research-status Report
脳卒中後の機能回復に寄与するマイクロRNAの大規模探索と革新的予後予測への応用
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20K19309
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| Research Institution | Hiroshima Cosmopolitan University |
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Principal Investigator |
猪村 剛史 広島都市学園大学, 健康科学部, 講師(移行) (80760016)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | マイクロRNA / エピジェネティクス / 脳卒中 / 予後予測 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、運動機能障害を始めとする種々の後遺障害を有することの多い疾患である脳梗塞患者の機能回復に関連するエピジェネティクス制御の一端を明らかにするため、microRNA発現の観点から検討を行っている。
今年度は、研究協力施設における患者リクルートを開始し、末梢血からのmicroRNAの抽出、次世代シーケンサーを用いたmicroRNAの網羅的発現解析を順次行った。現在、10例を超える症例からのmicroRNA精製ならびにmicroRNA発現の網羅的発現解析が完了している。microRNAの網羅的発現解析実施時のライブラリ作成前に、bioAnalyzerにてmicroRNAの濃度を確認した。その際、small RNA濃度が検出限界以下であり、網羅的発現解析に至らない症例も数名認めた。網羅的発現解析では、STAR (version 2.7.2 b)を用いてhuman gencode.v38とthe human GRCh38 genomeへのマッピングを行った。microRNAの網羅的発現解析の実施と並行して、対象となった脳梗塞患者の運動機能や日常生活動作等の臨床情報を収集した。現在は、microRNAの網羅的発現解析と臨床情報収集にとどまっており、バイオインフォマティクスの観点から、運動機能改善や予後予測に有用となるmicroRNAの探索は行えていない。
今後は、患者リクルートを継続する予定である。また、differentially expressed microRNA (DEMs)sの探索を行うとともに、同定されたDEMsの生物学的意義について先行研究の知見を参考に考察する予定としている。
今年度の成果発表として、脳卒中患者の予後予測に機械学習を活用した研究成果や脳卒中患者の予後予測に関連する先行研究の知見を整理するためのレビューを発表した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
現時点で研究スケジュール全体に大きな影響を与えるトラブルはない。
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| Strategy for Future Research Activity |
患者リクルートを効率的に行うために関係医療機関との調整を積極的に実施していく。
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| Causes of Carryover |
患者リクルートのタイミングが影響した。次年度のマイクロRNAの解析費用として使用する。
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