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2023 Fiscal Year Annual Research Report

多因子疾患の立体的な層別化に基づく臨床的多様性の詳細な理解の手法の開発

Research Project

Project/Area Number 20K19914
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

水野 聖士  東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 講師 (80646795)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Keywords層別化 / 臨床的多様性 / 妊娠高血圧症候群 / バイオインフォマティクス / 精密医療 / 機械学習 / 時系列クラスタリング
Outline of Annual Research Achievements

病態が不均一な多因子疾患に対して、遺伝・曝露因子や、病態の遷移のパターンなどで患者を層別化し、サブクラスごとにリスク予測、治療成績の最大化や、新しい治療方法の開発を行う精密医療の実現のための、患者の層別化手法が検討されてきたが、これまでに、多因子疾患の病態の多様性の機序の理解に有用な手法は開発されていない。そこで、妊娠高血圧症候群(HDP)を例にとり、東北メディカル・メガバンク計画三世代コホート調査参加者の約22,000人の妊婦のHDPの病型と、妊娠週数ごとの病態を、病型分類(フェノタイピング)により同定し、同定した約2,200人のHDP患者の病態遷移のパターンを、時系列クラスタリングにより層別化した。層別化により得られた特徴的な病態変化のパターンを時系列サブタイプ(temporal-subtype)と名づけ、得られたサブタイプの臨床的特徴を解析した。その結果、同じ最終病型に至る時系列サブタイプの間で、メジャーな有害アウトカムのリスク(オッズ比)が大きく異なることを見出し、HDPの不均一な病態の一部である、有害アウトカム発生の多様性に対応するサブクラスの候補を得た。また、HDPの病型には、重症化リスクの異なる、早期発症型と晩期発症型が知られているが、得られた時系列サブタイプは既知の分類とは対応せず、HDPには今まで知られている病型分類以上に多様性があり、その解明のための足がかりが得られたことを示している。

  • Research Products

    (4 results)

All 2024 2023

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Development of phenotyping algorithms for hypertensive disorders of pregnancy (HDP) and their application in more than 22,000 pregnant women2024

    • Author(s)
      Mizuno Satoshi、Wagata Maiko、Nagaie Satoshi、Ishikuro Mami、Obara Taku、Tamiya Gen、Kuriyama Shinichi、Tanaka Hiroshi、Yaegashi Nobuo、Yamamoto Masayuki、Sugawara Junichi、Ogishima Soichi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 14 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-024-55914-9

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Establishment of the early prediction models of low-birth-weight reveals influential genetic and environmental factors: a prospective cohort study2023

    • Author(s)
      Mizuno Satoshi、Nagaie Satoshi、Tamiya Gen、Kuriyama Shinichi、Obara Taku、Ishikuro Mami、Tanaka Hiroshi、Kinoshita Kengo、Sugawara Junichi、Yamamoto Masayuki、Yaegashi Nobuo、Ogishima Soichi
    • Journal Title

      BMC Pregnancy and Childbirth

      Volume: 23 Pages: -

    • DOI

      10.1186/s12884-023-05919-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 低出生体重の層別化に基づく環境・遺伝要因による予測モデルの開発2023

    • Author(s)
      水野聖士
    • Organizer
      情報計算化学生物学会2023年大会
  • [Book] データ収集・保管・管理. ヒト生体試料・データ取扱い実践ハンドブック2023

    • Author(s)
      森崎隆幸,西原広史,宮地勇人, 水野 聖士
    • Total Pages
      270
    • Publisher
      羊土社

URL: 

Published: 2024-12-25  

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