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2021 Fiscal Year Research-status Report

遺伝子領域間に引き起こされる転写共役型染色体転座経路の解明

Research Project

Project/Area Number 20K21536
Research InstitutionGunma University

Principal Investigator

柴田 淳史  群馬大学, 未来先端研究機構, 准教授 (30707633)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山内 基弘  九州大学, アイソトープ統合安全管理センター(馬出地区), 准教授 (60437910)
安原 崇哲  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 助教 (90757056)
Project Period (FY) 2020-07-30 – 2023-03-31
KeywordsDNA切断 / 染色体転座 / 発がん
Outline of Annual Research Achievements

発がんに大きく関わる染色体転座は、DNA二本鎖切断(DSB:DNA double strand break)の修復エラーにより生じる。しかしながら、発がんに繋がる遺伝子領域間での染色体転座がどのような過程で生じるかは未だ多くが明らかになっていない。申請者は、DSB修復の際のR-loop解消異常が染色体転座に関わることを示唆するデータを得ている(Yasuhara et al. &Shibata*, Cell, 2018)。しかしながら、転写共役型DSB修復と遺伝子領域間転座を繋ぐ分子メカニズムの解明までには至っていない。そこで本研究課題では、任意の場所とタイミングでDSBを人為的に誘導するヒト培養細胞実験系を確立し、転写活性を有する遺伝子間における染色体転座アッセイ系を構築することで、染色体転座を引き起こす分子機構解明を目指した。また本研究のもう一つの挑戦として、ヒト体細胞の大半を占めるにも関わらず、これまで解析が困難であったヒト静止期GO/G1期細胞を研究対象とする。今年度はタモキシフェン誘導体40HTにて制限酵素AsiSIが核内に誘導されるシステムを、網膜色素上皮細胞(RPE細胞:Retinal Pigment Epithelium)において構築し、またDSB発生を停止させるためのAIDタグ法を組み合わせた実験系を確立した。RPE細胞は接触阻害法によりGO/G1期に同調することが出来、GO/G1期に40HTを処理することでDSBを誘導することに成功した。これらのアッセイ系を用いて染色体転座アッセイ系の構築を中心に行い、染色体転座が起こりやすいDSB部位の組み合わせの同定を試みた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の計画通り、培養細胞に部位特異的制限酵素誘導系を作製し、AsiSI切断部位間の染色体転座の有無の検討を始めている。

Strategy for Future Research Activity

染色体転座が検出される部位において、DNA修復因子のノックダウンを行い、その分子機構解明を目指す。

Causes of Carryover

本研究計画にて作成したDSB誘導系において、染色体転座部位の同定が遅れていることから、次年度に同実験を行う。またそのための消耗品と人件費での利用を計画している。

  • Research Products

    (20 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results,  Peer Reviewed: 9 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 6 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] サセックス大学(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      サセックス大学
  • [Journal Article] RAP80 suppresses the vulnerability of R-loops during DNA double-strand break repair2022

    • Author(s)
      Yasuhara Takaaki、Kato Reona、Yamauchi Motohiro、Uchihara Yuki、Zou Lee、Miyagawa Kiyoshi、Shibata Atsushi
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 38 Pages: 110335~110335

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.110335

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Expression of non-homologous end joining factor, Ku80, is negatively correlated with PD?L1 expression in cancer cells after X?ray irradiation2021

    • Author(s)
      Kumazawa Takuya、Mori Yasumasa、Sato Hiro、Permata Tiara、Uchihara Yuki、Noda Shin-Ei、Okada Kohei、Kakoti Sangeeta、Suzuki Keiji、Ikota Hayato、Yokoo Hideaki、Gondhowiardjo Soehartati、Nakano Takashi、Ohno Tatsuya、Shibata Atsushi
    • Journal Title

      Oncology Letters

      Volume: 23 Pages: -

    • DOI

      10.3892/ol.2021.13147

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 64Cu-ATSM Predicts Efficacy of Carbon Ion Radiotherapy Associated with Cellular Antioxidant Capacity2021

    • Author(s)
      Nachankar Ankita、Oike Takahiro、Hanaoka Hirofumi、Kanai Ayaka、Sato Hiro、Yoshida Yukari、Obinata Hideru、Sakai Makoto、Osu Naoto、Hirota Yuka、Takahashi Akihisa、Shibata Atsushi、Ohno Tatsuya
    • Journal Title

      Cancers

      Volume: 13 Pages: 6159~6159

    • DOI

      10.3390/cancers13246159

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Genome Maintenance Mechanisms at the Chromatin Level2021

    • Author(s)
      Takatsuka Hirotomo、Shibata Atsushi、Umeda Masaaki
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 22 Pages: 10384~10384

    • DOI

      10.3390/ijms221910384

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ATM’s Role in the Repair of DNA Double-Strand Breaks2021

    • Author(s)
      Shibata Atsushi、Jeggo Penny A.
    • Journal Title

      Genes

      Volume: 12 Pages: 1370~1370

    • DOI

      10.3390/genes12091370

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Mechanism of chromosome rearrangement arising from single-strand breaks2021

    • Author(s)
      Kot Palina、Yasuhara Takaaki、Shibata Atsushi、Hirakawa Miyako、Abe Yu、Yamauchi Motohiro、Matsuda Naoki
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 572 Pages: 191~196

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2021.08.001

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] High linear energy transfer carbon-ion irradiation upregulates PD-L1 expression more significantly than X-rays in human osteosarcoma U2OS cells2021

    • Author(s)
      Permata Tiara Bunga Mayang、Sato Hiro、Gu Wenchao、Kakoti Sangeeta、Uchihara Yuki、Yoshimatsu Yukihiko、Sato Itaru、Kato Reona、Yamauchi Motohiro、Suzuki Keiji、Oike Takahiro、Tsushima Yoshito、Gondhowiardjo Soehartati、Ohno Tatsuya、Yasuhara Takaaki、Shibata Atsushi
    • Journal Title

      Journal of Radiation Research

      Volume: 62 Pages: 773~781

    • DOI

      10.1093/jrr/rrab050

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Modulation of immune responses by DNA damage signaling2021

    • Author(s)
      Uchihara Yuki、Permata Tiara Bunga Mayang、Sato Hiro、Shibata Atsushi
    • Journal Title

      DNA Repair

      Volume: 104 Pages: 103135~103135

    • DOI

      10.1016/j.dnarep.2021.103135

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Analysis of radiotherapy-induced alteration of CD8+ T cells and PD-L1 expression in patients with uterine cervical squamous cell carcinoma2021

    • Author(s)
      Mori Yasumasa、Sato Hiro、Kumazawa Takuya、Permata Tiara、Yoshimoto Yuya、Murata Kazutoshi、Noda Shin-Ei、Kaminuma Takuya、Ando Ken、Oike Takahiro、Okonogi Noriyuki、Okada Kohei、Kakoti Sangeeta、Suzuki Keiji、Ikota Hayato、Yokoo Hideaki、Nakano Takashi、Ohno Tatsuya、Shibata Atsushi
    • Journal Title

      Oncology Letters

      Volume: 21 Pages: -

    • DOI

      10.3892/ol.2021.12707

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Immune responses regulated by DNA damage signaling2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      12th International Symposium Gunma University Initiative for Advanced Research (GIAR)、Hybrid conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 放射線の細胞への影響2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      日本放射線腫瘍学会 第12回放射線生物学セミナー
    • Invited
  • [Presentation] Radiation-induced DNA damage and repair: a look into carbon-ion dependent Clustered DNA Double Strand Breaks2021

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      International Training Course on Carbon Ion Radiotherapy 2021
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 放射線照射が誘発する免疫応答の分子機構からみた放射線免疫治療併用の可能性.2021

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第62回日本肺癌学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 修復:線量によって変化するDNA修復機構.2021

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      日本放射線腫瘍学会第34回学術大会
    • Invited
  • [Presentation] 正確なDNA修復へと導くDNA二本鎖切断修復経路の決定メカニズム.2021

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第94回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] 放射線治療時に生じるDNA損傷を起因とする腫瘍免疫活性化の分子メカニズム.2021

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第59回日本癌治療学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 放射線分子生物学の知見をどのようにして私たちの健康に役立てるのか?2021

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      日本放射線影響学会 第64回大会
    • Invited
  • [Presentation] 放射線照射により惹起される免疫応答系リガンドの発現制御機構.2021

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第49回放射線による制癌シンポジウム
  • [Remarks] 柴田研究室HP

    • URL

      https://shibataxlab.com/

URL: 

Published: 2022-12-28  

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