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2022 Fiscal Year Annual Research Report

遺伝子領域間に引き起こされる転写共役型染色体転座経路の解明

Research Project

Project/Area Number 20K21536
Research InstitutionGunma University

Principal Investigator

柴田 淳史  群馬大学, 未来先端研究機構, 准教授 (30707633)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山内 基弘  九州大学, アイソトープ統合安全管理センター(馬出地区), 准教授 (60437910)
安原 崇哲  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 助教 (90757056)
Project Period (FY) 2020-07-30 – 2023-03-31
KeywordsDNA切断 / 染色体転座 / 発がん / DNA二本鎖切断 / 転写共役型DNA修復
Outline of Annual Research Achievements

発がんに大きく関わる染色体転座は、DNA二本鎖切断(DSB:DNA double strand break)の修復エラーにより生じる。しかしながら、発がんに繋がる遺伝子領域間での染色体転座がどのような過程で生じるかは未だ多くが明らかになっていない。我々は、DSB修復の際のR-loop解消異常が染色体転座に関わることを示唆するデータを得ている(Yasuhara et al. &Shibata*, Cell, 2018)。しかしながら、転写共役型DSB修復と遺伝子領域間転座を繋ぐ分子メカニズムの解明までには至っていない。そこで本研究課題では、任意の場所とタイミングでDSBを人為的に誘導するヒト培養細胞実験系を確立し、転写活性を有する遺伝子間における染色体転座アッセイ系を構築することで、染色体転座を引き起こす分子機構解明を目指した。また本研究のもう一つの挑戦として、ヒト体細胞の大半を占めるにも関わらず、これまで解析が困難であったヒト静止期GO/G1期細胞を研究対象とする。今年度はタモキシフェン誘導体40HTにて制限酵素AsiSIが核内に誘導されるシステムを、網膜色素上皮細胞(RPE細胞:Retinal Pigment Epithelium)において構築し、またDSB発生を停止させるためのAIDタグ法を組み合わせた実験系を確立した。RPE細胞は接触阻害法によりGO/G1期に同調することが出来、GO/G1期に40HTを処理することでDSBを誘導することに成功した。これらのアッセイ系を用いて染色体転座アッセイ系の構築を中心に行い、染色体転座が起こりやすいDSB部位の組み合わせの同定を試みた。さらにCRISPRによりゲノムの2か所を切断し、染色体転座アッセイ系の構築を試みた。

  • Research Products

    (18 results)

All 2023 2022 Other

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 9 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Analysis of the relationship between LET, γH2AX foci volume and cell killing effect of carbon ions using high-resolution imaging technology2023

    • Author(s)
      Oike Takahiro、Kakoti Sangeeta、Sakai Makoto、Matsumura Akihiko、Ohno Tatsuya、Shibata Atsushi
    • Journal Title

      Journal of Radiation Research

      Volume: 64 Pages: 335~344

    • DOI

      10.1093/jrr/rrac098

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Calreticulin Upregulation in Cervical Cancer Tissues From Patients After 10 Gy Radiation Therapy2023

    • Author(s)
      Okada Kohei、Sato Hiro、Kumazawa Takuya、Mori Yasumasa、Permata Tiara Bunga Mayang、Uchihara Yuki、Noda Shin-ei、Suzuki Keiji、Ikota Hayato、Yokoo Hideaki、Gondhowiardjo Soehartati、Nakano Takashi、Ohno Tatsuya、Shibata Atsushi
    • Journal Title

      Advances in Radiation Oncology

      Volume: 8 Pages: 101159~101159

    • DOI

      10.1016/j.adro.2022.101159

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Carbon ion radiation and clustered DNA double-strand breaks2022

    • Author(s)
      Shibata Atsushi
    • Journal Title

      Enzymes

      Volume: 51 Pages: 117~130

    • DOI

      10.1016/bs.enz.2022.08.008

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Radiosensitization by the Selective Pan-FGFR Inhibitor LY28744552022

    • Author(s)
      Darwis Narisa Dewi Maulany、Horigome Eisuke、Li Shan、Adachi Akiko、Oike Takahiro、Shibata Atsushi、Hirota Yuka、Ohno Tatsuya
    • Journal Title

      Cells

      Volume: 11 Pages: 1727~1727

    • DOI

      10.3390/cells11111727

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] DNA damage promotes HLA class I presentation by stimulating a pioneer round of translation-associated antigen production2022

    • Author(s)
      Uchihara Yuki、Permata Tiara Bunga Mayang、Sato Hiro、Kawabata-Iwakawa Reika、Katada Sayako、Gu Wenchao、Kakoti Sangeeta、Yamauchi Motohiro、Kato Reona、Gondhowiardjo Soehartati、Hosen Naoki、Yasuhara Takaaki、Shibata Atsushi
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 82 Pages: 2557~2570.e7

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2022.04.030

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Regulation of immune-ligand presentation in response to DNA damage.2023

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      The 19th Ataxia-Telangiectasia workshop
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 放射線治療と免疫チェックポイント阻害剤併用時の最適化を目指した基礎医学研究2023

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第23回菅原・大西記念癌治療増感研究シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 放射線照射後に生じるDNA損傷を起因とする腫瘍免疫応答の研究2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      QST病院講演
    • Invited
  • [Presentation] 教育講演 生物「放射線の細胞への影響」2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      日本放射線腫瘍学会第35回学術大会
    • Invited
  • [Presentation] DNA二本鎖切断修復の経路選択性に影響するクロマチン構造変化の解析2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] The mechanism underlying HLA Class I presentation in response to DNA damage2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      The 29th Federation of Asian and Oceanian Biochemists and Molecular Biologists Conference & the 2022 Chinese Society of Biochemistry and Molecular Biology Online Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DNA損傷に応答する免疫リガンド発現制御機構2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Invited
  • [Presentation] 分子生物学に基づく放射線照射後の細胞応答の可視化2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      日本放射線影響学会第65回大会
    • Invited
  • [Presentation] DNA損傷応答により活性化される免疫リガンド発現制御機構2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第3回若手人材育成セミナー
    • Invited
  • [Presentation] 放射線治療時に生じる DNA 損傷を起因とする腫瘍免疫応答の研究2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第27回癌治療増感研究会 シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] DNA損傷により促進されるHLA Class I提示機構2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第9回DNA損傷応答ワークショップ Online
  • [Remarks] 柴田研究室

    • URL

      https://shibataxlab.com/

  • [Remarks] SHIBATA LAB

    • URL

      https://shibataxlab.com/english/

URL: 

Published: 2023-12-25  

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