Verification of semen by using odorant binding protein 2 and investigation of physiological significance of odorant binding protein 2

2022 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 20K21697
• Research Institution: Gunma University
• Principal Investigator: 小湊 慶彦 群馬大学, 大学院医学系研究科, 教授 (30205512)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 平野 瞳子 群馬大学, 大学院医学系研究科, 技術職員 (20643810) ; 窪 理英子 群馬大学, 医学部, 技術職員 (40747127) ; 高橋 遥一郎 筑波大学, 医学医療系, 教授 (50640538) ; 佐野 利恵 群馬大学, 大学院医学系研究科, 准教授 (70455955) ; 早川 輝 群馬大学, 大学院医学系研究科, 助教 (90758575)
• Project Period (FY): 2020-07-30 – 2023-03-31
• Keywords: OBP2B / ABO遺伝子

Outline of Annual Research Achievements

ゲノム編集を用いてABO遺伝子の上皮細胞特異的転写調節領域（+22.6-kb site）を欠失した胃癌培養細胞KATOIIIを作製したところ、ABO遺伝子の発現が低下した。一方、ABO遺伝子のセントロメア側66.0-kbで+22.6-kb siteのセントロメア側43.4-kbにあるOBP2B遺伝子の発現が低下することが観察された（Sano R, et al. Sci Rep 2021;11:7325）。クロマチンループ構造は連続的に変形しても性質が保たれることを考慮し、トポロジカル関連ドメイン(Topologically Associated Domain, TAD) と呼ばれる。また、TADの内部で遺伝子発現が制御されることが明らかになっている。一方、ABO遺伝子周囲にはループ形成に基づくTADが想定されている。従って、前述の結果は、上皮細胞ではABO遺伝子とOBP2B遺伝子が同一のTAD内に存在し、同一の転写制御を受けている可能性を示唆している。ところで、ABO遺伝子の解析は非常に多く実施されている。また、Oアレルが存在し、A型やB型が欠失するヒトがいるにも関わらず、ABO遺伝子の欠失したヒトの報告がない。「なぜABO遺伝子は消滅しないのか？」という問いに対する答えとして、OBP2B遺伝子が種の保存に必要なため、+22.6-kb siteが必要となり、ABO遺伝子が保存されていることが考えられる。OBP2B蛋白精製の準備として、抗体を用いた免疫沈降法によりオドラント結合蛋白OBP2Bを分離し、イムノブロットを行い良好な結果を得た。次に、母乳中ではOBP2B蛋白がリガンドと結合していることが予想されるので、母乳を材料として免疫沈降実験を繰り返したが、良好な結果が得られなかった。

Research Products

• [Journal Article] Emergence of an erythroid cell-specific regulatory region in ABO intron 1 attributable to A- or B-antigen expression on erythrocytes in Hominoidea. (2023)
  • Author(s): Sano R, Fukuda H, Kubo R, Oishi T, Miyabe-Nishiwaki T, Kaneko A, Masato H, Takahashi Y, Hayakawa A, Yazawa S, Kominato Y.
  • Journal Title: Sci Rep. Volume: 13 Pages: 4947
  • DOI: 10.1038/s41598-023-31961-6.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Post-traumatic cerebral infarction caused by thrombus in the middle cerebral artery. (2023)
  • Author(s): Hayakawa A, Sano R, Takahashi Y, Fukuda H, Okawa T, Kubo R, Takei H, Komatsu T, Tokue H, Sawada Y, Oshima K, Horioka K, Kominato Y.
  • Journal Title: J Forensic Leg Med. Volume: 93 Pages: 102474
  • DOI: 10.1016/j.jflm.2022.102474.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A novel genotyping method for rapid identification of the Le gene to select patients for diagnosis with CA19-9. (2023)
  • Author(s): Sano R, Yokobori T, Harimoto N, Saeki H, Kominato Y, Shirabe K, Yazawa S.
  • Journal Title: Clin Chim Acta. Volume: 538 Pages: 181-188
  • DOI: 10.1016/j.cca.2022.11.006.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Hypothermic death resulting from extreme freezing with characteristic postmortem computed tomography findings: A case report and review of the literature. (2023)
  • Author(s): Tokue H, Sano R, Takahashi Y, Hayakawa A, Fukuda H, Tokue A, Kominato Y, Tsushima Y.
  • Journal Title: Radiol Case Rep. Volume: 18 Pages: 1423-1426
  • DOI: 10.1016/j.radcr.2023.01.007.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Reduction of blood group A antigen on erythrocytes in a patient with myelodysplastic syndrome harboring somatic mutations in RUNX1 and GATA2. (2022)
  • Author(s): Hayakawa A, Sano R, Takahashi Y, Okawa T, Kubo R, Harada M, Fukuda H, Yokohama A, Handa H, Kawabata-Iwakawa R, Tsuneyama H, Tsukada J, Kominato Y.
  • Journal Title: Transfusion Volume: 62 Pages: 469-480
  • DOI: 10.1111/trf.16766.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Usefulness of a tissue optical clearing technique for forensic autopsy. (2022)
  • Author(s): Takahashi Y, Hayakawa A, Sano R, Fukuda H, Kubo R, Tokue H, Okawa T, Kawamura M, Kominato Y.
  • Journal Title: J Forensic Sci. Volume: 67 Pages: 1124-1131
  • DOI: 10.1111/1556-4029.14995.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] I536T variant of RBM20 affects splicing of cardiac structural proteins that are causative for developing dilated cardiomyopathy. (2022)
  • Author(s): Yamamoto T, Sano R, Miura A, Imasaka M, Naito Y, Nishiguchi M, Ihara K, Otani N, Kominato Y, Ohmuraya M, Kuroyanagi H, Nishio H.
  • Journal Title: J Mol Med Volume: 100 Pages: 1741-1754
  • DOI: 10.1007/s00109-022-02262-8.
  • Peer Reviewed