2020 Fiscal Year Research-status Report
ロングリード配列決定法による放射線被ばく刻印の同定
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20K21718
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| Research Institution | Nagasaki University |
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Principal Investigator |
光武 範吏 長崎大学, 原爆後障害医療研究所, 教授 (50404215)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
鈴木 啓司 長崎大学, 原爆後障害医療研究所, 准教授 (00196809)
荻 朋男 名古屋大学, 環境医学研究所, 教授 (80508317)
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| Project Period (FY) |
2020-07-30 – 2022-03-31
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| Keywords | HPRTクローン |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、最新のゲノム解析技術、特にロングリード解析を用い、放射線ゲノム刻印の存在を明らかにし、放射線リスク研究に、集団ではなく個々の癌における放射線影響の有無を調べる手段を提供することである。そのため、長年様々な研究で使用されている放射線誘発HPRT変異クローンを用いた。これらのクローンは、放射線に寄って引き起こされた変異を持つことがほぼ確実であり、線量依存性や化学物質によって得られたクローンとの比較解析も容易にできる。本年度は、主としてHPRT変異クローンの作成とゲノム解析の準備を行った。
正常ヒト線維芽細胞をヒトテロメラーゼ（hTERT）遺伝子にて不死化したBJ1-hTERT細胞を用いた。無処理、137Csによるガンマ線照射（1, 3, 6 Gy）、またはN-ethyl-N-nitrosourea（ENU, 1 mM, 1 hr）による処理を行い、6-thioguanine（6-TG, 40 mM）存在下で培養を行い、それぞれ10~30個程度の6-TG耐性クローンを単離・樹立し、全クローンよりゲノムDNAを抽出した。次に、各エクソンの欠失状態を調べるため、HPRT遺伝子のそれぞれのエクソンを増幅できるプライマーを設定し、定量PCRにて各エクソンの欠失状態を確認した。無処理や低線量ではエクソンの欠失はほとんど見られなかったが、線量とともにエクソンの欠失が増加し、6 Gyでは全エクソンが欠失しているクローンが多く見られた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
研究打ち合わせの予定変更や試薬や消耗品の供給不足による購入の遅れのため
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| Strategy for Future Research Activity |
全ゲノムシークエンスを施行し、詳細な解析を行っていく。
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| Causes of Carryover |
今年度は、全ゲノム解析の開始が遅れてしまったため。次年度はこれらを次世代ゲノム解析や、同定された変異の検証を行うための試薬購入に充てる予定である。
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Research Products
(11 results)
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[Journal Article] Position paper from the Japan Thyroid Association task force on the management of low-risk papillary thyroid microcarcinoma (T1aN0M0) in adults2021
Author(s)
Horiguchi K, Yoshida Y, Iwaku K, Emoto N, Kasahara T, Sato J, Shimura H, Shindo H, Suzuki S, Nagano H, Furuya F, Makita N, Matsumoto F, Manaka K, Mitsutake N, Miyakawa M, Yokoya S, Sugitani I
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Journal Title
Endocrine Journal
Volume: -
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Papillary Thyroid Carcinoma in Ukraine After Chernobyl and in Japan After Fukushima: Different Histopathological Scenarios2020
Author(s)
Bogdanova TI, Saenko VA, Hashimoto Y, Hirokawa M, Zurnadzhy LY, Hayashi T, Ito M, Iwadate M, Mitsutake N, Rogounovitch TI, Sakamoto A, Naganuma H, Miyauchi A, Tronko MD, Thomas G, Yamashita S, Suzuki S
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Journal Title
Thyroid
Volume: -
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] The Clinicopathological Results of Thyroid Cancer With BRAFV600E Mutation in the Young Population of Fukushima2020
Author(s)
Iwadate M, Mitsutake N, Matsuse M, Fukushima T, Suzuki S, Matsumoto Y, Ookouchi C, Mizunuma H, Nakamura I, Nakano K, Sakamoto A, Hirokawa M, Ito M, Naganuma H, Hashimoto Y, Shimura H, Yamashita S, Suzuki S
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Journal Title
The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism
Volume: 105
Pages: e4328-e4336
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Digenic mutations in ALDH2 and ADH5 impair formaldehyde clearance and cause a multisystem disorder, AMeD syndrome2020
Author(s)
Oka Y, Hamada M, Nakazawa Y, ..., Tanaka M, Suganami T, Nakada S, Mitsutake N, Hara Y, Kato K, ..., Kaneko H, Matsumoto N, Matsuda F, Matsuo K, Takahashi Y, Mashimo T, Kojima S, Ogi T
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Journal Title
Science Advances
Volume: 6
Pages: eabd7197
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] チェルノブイリと福島の甲状腺がんにおける様々な病理学的シナリオ2020
Author(s)
サエンコ ウラジミール, ボグダノワ タチアナ, 橋本 優子, 廣川 満良, リュドミラ ズルナドジ, 林 俊哲, 伊東 正博, 岩館 学, 光武 範吏, ログノビッチ タチアナ, 坂本 穆彦, 長沼 廣, 宮内 昭, トロンコ ミコラ, トマス ジュラルディン, 山下 俊一, 鈴木 眞一
Organizer
第63回 日本放射線影響学会 年次大会
Invited
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