2020 Fiscal Year Research-status Report
好酸球性副鼻腔炎における真菌叢マイクロバイオーム研究
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20K22998
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| Research Institution | University of Fukui |
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Principal Investigator |
木戸口 正典 福井大学, 学術研究院医学系部門(附属病院部), 特命助教 (30880132)
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| Project Period (FY) |
2020-09-11 – 2022-03-31
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| Keywords | 好酸球性副鼻腔炎 / 慢性副鼻腔炎 / マイクロバイオーム / 真菌 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
好酸球性副鼻腔炎は嗅覚障害や気管支喘息の合併率が高く、鼻腔内にポリープ（鼻茸）が多発し再発率が高い難治性疾患であり、原因としては未だ不明な点が多い。申請者は、環境的な要因のひとつとして細菌叢のマイクロバイオームに着目し研究を行ってきた。本研究では、好酸球性副鼻腔炎における真菌叢マイクロバイオーム解析を行い、病態解明につなげることを目的とする。具体的には、好酸球性副鼻腔炎の鼻腔に存在する真菌叢のマイクロバイオームを網羅的に同定し、すでに研究成果として得られている細菌叢のマイクロバイオームと統合することにより、好酸球性副鼻腔炎の病態に関与する微生物叢(細菌叢・真菌叢)を明らかにする。
研究代表施設および研究協力施設において、慢性副鼻腔炎（好酸 球性副鼻腔炎・非好酸球性副鼻腔炎）と診断された患者200名から鼻腔ぬぐい液の検体採取した。収集したぬぐい液200名からＤＮＡ抽出キットを使用して微生物叢由ＤＮＡを抽出した。抽出されたＤＮＡにはヒト由来ＤＮＡの他、細菌、真菌、植物などの共生物が含まれる。真菌叢マイクロバイオーム解析については internal transcribed spacer（ITS）領域を増幅するプライマーを使用した。次世代シークエンサーにて増幅した塩基配列を測定し、菌種の種レベルまで系統分類を行った。測定結果には一部、真菌以外の塩基配列が認められため、プライマーや増幅条件等を検討している。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
検体採取は完了しておりおおむね順調に進展している。
測定結果には一部、真菌以外の塩基配列が認められため、プライマーや増幅条件等を検討し、適切なプライマーおよび増幅条件を再検討している。
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| Strategy for Future Research Activity |
適切なプライマーおよび増幅条件を決定し、次世代シークエンサーでの再測定を行う。一部の検体については、ショットガンメタゲノムシークエンスを行う。また、得られたデータから微生物叢の代謝産物機能予測を行い、すでに得られている細菌データと比較し、好酸球性副鼻腔炎に存在する微生物叢やその機能を明らかにする。
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| Causes of Carryover |
当該年度はDNA抽出に時間を要し、次年度にて次世代シークエンサーを用いた測定を行うこととなった。また、次世代シークエンサーに用いる測定試薬が、COVID-19パンデミックによる影響にて海外からの輸入・納品に時間を要しており、次年度使用額が生じた。
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[Journal Article] Serum IgG4 as a biomarker reflecting pathophysiology and post-operative recurrence in chronic rhinosinusitis2020
Author(s)
Aiko Oka, Takahiro Ninomiya, Tazuko Fujiwara, Soshi Takao, Yasuharu Sato, Yuka Gion, Akira Minoura, Shin-ichi Haruna, Naohiro Yoshida, Yasunori Sakuma, Kenji Izuhara, Junya Ono, Masami Taniguchi, Takenori Haruna, Takaya Higaki, Shin Kariya, Takahisa Koyama, Tetsuji Takabayashi, Masanori Kidoguchi, et al.
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Journal Title
Allergology International
Volume: 69
Pages: 417～423
DOI
Peer Reviewed
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