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2020 Fiscal Year Research-status Report

新たな創薬資源の採集調査と新奇天然物生合成マシナリーの探索と解明

Research Project

Project/Area Number 20KK0173
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

阿部 郁朗  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 教授 (40305496)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 淡川 孝義  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 准教授 (80609834)
森 貴裕  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 助教 (60734564)
牛丸 理一郎  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 助教 (10873648)
Project Period (FY) 2020-10-27 – 2024-03-31
Keywords創薬資源採集調査 / 天然物生合成 / 生合成マシナリー / 生物多様性 / 中国南西部
Outline of Annual Research Achievements

以下の4つの項目を2020年度から4年間の計画で開始した。
1.植物内生菌、土壌微生物の採集単離(中国側が主導)調査対象地域として、未開拓薬用資源の宝庫、生物多様性ホットスポットとされる、中国南西部(広東、広西、雲南、海南省)を選択する。
2.低分子化合物の単離構造決定、生物活性評価(中国側が主導)上述したカルチャー・コレクションについて、異なる培養条件下で二次代謝産物生産能を詳細に検討し、微生物が生産する二次代謝産物とその生物活性を網羅的に解析する。
3.生合成マシナリーの解明と物質生産系の構築(日本側と中国側で同時進行)上述したカルチャー・コレクションについて、有用な生物活性物質生産能を示した微生物、あるいは、特異な分子骨格を生産する微生物については、全ゲノム配列を決定し、バイオインフォマティクスの技術を駆使したゲノムマイニングにより、テルペン、ポリケタイド、ペプチドなど、生物間相互作用に重要な役割を演ずる可能性が予想される創薬シード合物の新奇生合成酵素遺伝子を網羅的に探索し、その生合成マシナリーの詳細を解明する。大腸菌や酵母、麹菌などを宿主として、これら遺伝子の異種発現による物質生産系を構築する。有機化学を基盤として、生合成反応機構の詳細を酵素遺伝子レベルで明らかにする。
4.酵素結晶構造解析、機能改変と生合成リデザイン(日本側が主導) X線結晶構造解析により、酵素反応の立体構造基盤を明らかにするとともに、結晶構造に基づく酵素触媒機能の拡張と最適化をめざす。さらなる構造多様性の拡大と物質生産系の構築を実現し、所望の構造を有する、天然物を凌ぐ新規有用活性物質の大量安定供給をめざす。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

新型コロナウイルス感染拡大により互いの往来はならなかったが、共同研究成果が着実に多くの優れた共著論文に実りつつある。

Strategy for Future Research Activity

昨年度に引き続き、上述した4つの項目を年間の計画で同時進行させる。本年度こそは、研究代表者を含め、若手研究者を戦略的に当該地域に派遣し、国際共同研究を強力に推進することで、独創的、先駆的な研究を格段に発展させる。

Causes of Carryover

新型コロナウイルス感染拡大により、海外派遣、受け入れは残念ながら中止とせざるを得なかった。今年度こそは、研究代表者を含め、若手研究者を戦略的に当該地域に派遣し、国際共同研究を強力に推進することで、独創的、先駆的な研究を格段に発展させる。

  • Research Products

    (14 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 11 results,  Peer Reviewed: 12 results,  Open Access: 6 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] 曁南大学/武漢大学/中国科学院(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      曁南大学/武漢大学/中国科学院
  • [Journal Article] One Polyketide Synthase, Two Distinct Products: Trans‐Acting Enzyme‐Controlled Product Divergence in Calbistrin Biosynthesis2021

    • Author(s)
      Tao Hui、Mori Takahiro、Wei Xingxing、Matsuda Yudai、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 60 Pages: 8851~8858

    • DOI

      10.1002/anie.202016525

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Biosynthesis of alkyne-containing natural products2021

    • Author(s)
      Li Xinyang、Lv Jian-Ming、Hu Dan、Abe Ikuro
    • Journal Title

      RSC Chemical Biology

      Volume: 2 Pages: 166~180

    • DOI

      10.1039/D0CB00190B

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Enzymology and biosynthesis of the orsellinic acid derived medicinal meroterpenoids2021

    • Author(s)
      Tao Hui、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Current Opinion in Biotechnology

      Volume: 69 Pages: 52~59

    • DOI

      10.1016/j.copbio.2020.11.016

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Microbial soluble aromatic prenyltransferases for engineered biosynthesis2021

    • Author(s)
      Chen He-Ping、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Synthetic and Systems Biotechnology

      Volume: 6 Pages: 51~62

    • DOI

      10.1016/j.synbio.2021.02.001

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Extensive expanding the chemical diversity of fusidane-type antibiotics using a stochastic combinational strategy2020

    • Author(s)
      Song Xiaojun、Lv Jianming、Cao Zhiqin、Huang Huiyun、Chen Guodong、Awakawa Takayoshi、Hu Dan、Gao Hao、Abe Ikuro、Yao Xinsheng
    • Journal Title

      Acta Pharmaceutica Sinica B

      Volume: 10 Pages: in press

    • DOI

      10.1016/j.apsb.2020.12.007

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Biosynthesis of Biscognienyne?B Involving a Cytochrome P450‐Dependent Alkynylation2020

    • Author(s)
      Lv Jian‐Ming、Gao Yao‐Hui、Zhao Huan、Awakawa Takayoshi、Liu Ling、Chen Guo‐Dong、Yao Xin‐Sheng、Hu Dan、Abe Ikuro、Gao Hao
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 59 Pages: 13531~13536

    • DOI

      10.1002/anie.202004364

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Discovery of the cryptic function of terpene cyclases as aromatic prenyltransferases2020

    • Author(s)
      He Haibing、Bian Guangkai、Herbst-Gervasoni Corey J.、Mori Takahiro、Shinsky Stephen A.、Hou Anwei、Mu Xin、Huang Minjian、Cheng Shu、Deng Zixin、Christianson David W.、Abe Ikuro、Liu Tiangang
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 11 Pages: 3958-3958

    • DOI

      10.1038/s41467-020-17642-2

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structural Diversification of Andiconin-Derived Natural Products by α-Ketoglutarate-Dependent Dioxygenases2020

    • Author(s)
      Bai Tongxuan、Matsuda Yudai、Tao Hui、Mori Takahiro、Zhang Yonghui、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Organic Letters

      Volume: 22 Pages: 4311~4315

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.0c01358

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Sporormielones A?E, bioactive novel C?C coupled orsellinic acid derivative dimers, and their biosynthetic origin2020

    • Author(s)
      Chen Guo-Dong、Hu Dan、Huang Mei-Juan、Tang Jia、Wang Xiao-Xia、Zou Jian、Xie Jun、Zhang Wei-Guang、Guo Liang-Dong、Yao Xin-Sheng、Abe Ikuro、Gao Hao
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 56 Pages: 4607~4610

    • DOI

      10.1039/D0CC00855A

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Deciphering the Biosynthetic Mechanism of Pelletierine in Lycopodium Alkaloid Biosynthesis2020

    • Author(s)
      Wang Juan、Zhang Ze-Kun、Jiang Fang-Fang、Qi Bo-Wen、Ding Ning、Hnin Saw Yu Yu、Liu Xiao、Li Jun、Wang Xiao-hui、Tu Peng-Fei、Abe Ikuro、Morita Hiroyuki、Shi She-Po
    • Journal Title

      Organic Letters

      Volume: 22 Pages: 8725~8729

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.0c03339

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Molecular Basis for Sesterterpene Diversity Produced by Plant Terpene Synthases2020

    • Author(s)
      Chen Qingwen、Li Jianxu、Liu Zhixi、Mitsuhashi Takaaki、Zhang Yuting、Liu Haili、Ma Yihua、He Juan、Shinada Tetsuro、Sato Tsutomu、Wang Yong、Liu Hongwei、Abe Ikuro、Zhang Peng、Wang Guodong
    • Journal Title

      Plant Communications

      Volume: 1 Pages: 100051~100051

    • DOI

      10.1016/j.xplc.2020.100051

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Identification and characterization of N9-methyltransferase involved in converting caffeine into non-stimulatory theacrine in tea2020

    • Author(s)
      Zhang Yue-Hong、Li Yi-Fang、Wang Yongjin、Tan Li、Cao Zhi-Qin、Xie Chao、Xie Guo、Gong Hai-Biao、Sun Wan-Yang、Ouyang Shu-Hua、Duan Wen-Jun、Lu Xiaoyun、Ding Ke、Kurihara Hiroshi、Hu Dan、Zhang Zhi-Min、Abe Ikuro、He Rong-Rong
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 11 Pages: 1473-1473

    • DOI

      10.1038/s41467-020-15324-7

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Remarks] 東京大学大学院薬学系研究科天然物化学教室

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~tennen/head.htm

URL: 

Published: 2021-12-27  

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