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2021 Fiscal Year Research-status Report

新たな創薬資源の採集調査と新奇天然物生合成マシナリーの探索と解明

Research Project

Project/Area Number 20KK0173
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

阿部 郁朗  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 教授 (40305496)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 淡川 孝義  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 准教授 (80609834)
森 貴裕  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 助教 (60734564)
牛丸 理一郎  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 助教 (10873648)
Project Period (FY) 2020-10-27 – 2024-03-31
Keywords創薬資源採集調査 / 天然物生合成 / 生合成マシナリー / 生物多様性 / 中国南西部
Outline of Annual Research Achievements

以下の4つの項目を2020年度から4年間の計画で遂行した。
(1)植物内生菌、土壌微生物の最終単離(中国側が主導)長鎖対象地域として、未開拓薬用資源の宝庫、生物多様性ホットスポットとされる、中国南西部を選択した。(2)低分子化合物の単離構造決定、生物活性評価(中国側が主導)上述したカルチャー・コレクションについて、異なる培養条件下で二次代謝産物生産を詳細に検討し、微生物が生産する二次代謝産物とその生物活性を網羅的に解析した。(3)生合成マシナリーの解明と物質生産系の構築(日本側と中国側で同時進行)上述したカルチャー・コレクションで、有用な生物活性物質生産能を示した微生物について、全ゲノム配列を決定し、バイオインフォマティクスの技術を駆使したゲノムマイニングにより、テルペン、ポリケタイド、ペプチドなど、生物間相互作用に重要な役割を演ずる可能性が予想される創薬シード合物の新奇生合成酵素遺伝子を網羅的に探索し、その生合成マシナリーの詳細を解明る。大腸菌や酵母、麹菌などを宿主として、これら遺伝子の異種発現による物質生産系を構築する。有機化学を基盤として、生合成反応機構の詳細を酵素遺伝子レベルで明らかにする。(4)酵素結晶構造解析、機能改変と生合成リデザイン(日本側が主導)X線結晶構造解析により、酵素反応の立体構造基盤を明らかにするとともに、結晶構造に基づく酵素触媒機能の拡張と最適化をめざす。さらなる構造多様性の拡大と物質生産系の構築を実現し、所望の構造を有する、天然物を凌ぐ新規有用活性物質の安定供給をめざした。
本年度も、補酵素NADを基質とする生物活性天然物の新規生合成マシナリーなど、質量ともに充実した研究成果をあげることに成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

新型コロナウイルス感染拡大により互いの往来はならなかったが、共同研究成果が着実に多くの優れた共著論文に実りつつある。

Strategy for Future Research Activity

昨年度に引き続き、上述した4つの項目を年間計画で同時進行させる。本年度こそは、研究代表者を含め、若手研究者を戦略的に当該地域に派遣し、国際共同研究を強力に推進することで、独創的、先駆的な研究を格段に発展させる。

Causes of Carryover

新型コロナウイルス感染症拡大が本年も終息することなく、入国制限によりポスドクや留学生の来日が困難になり来年度にずれこんだ。結果として研究の進捗が遅れ、試薬・ガラス器具などの購入に充てる物品費、また、研究成果発表を予定していた国際学会が延期になったため旅費、など次年度に繰りこした。

  • Research Products

    (12 results)

All 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] ジ南大学/中国科学院/浙江大学(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      ジ南大学/中国科学院/浙江大学
  • [Journal Article] β-NAD as a building block in natural product biosynthesis2021

    • Author(s)
      Barra Lena、Awakawa Takayoshi、Shirai Kohei、Hu Zhijuan、Bashiri Ghader、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 600 Pages: 754~758

    • DOI

      10.1038/s41586-021-04214-7

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Heterodimeric Non-heme Iron Enzymes in Fungal Meroterpenoid Biosynthesis2021

    • Author(s)
      Li Xinyang、Awakawa Takayoshi、Mori Takahiro、Ling Meiqi、Hu Dan、Wu Bin、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 143 Pages: 21425~21432

    • DOI

      10.1021/jacs.1c11548

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Molecular insights into the endoperoxide formation by Fe(II)/α-KG-dependent oxygenase NvfI2021

    • Author(s)
      Mori Takahiro、Zhai Rui、Ushimaru Richiro、Matsuda Yudai、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Pages: 4417

    • DOI

      10.1038/s41467-021-24685-6

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] C-Glycoside metabolism in the gut and in nature: Identification, characterization, structural analyses and distribution of C-C bond-cleaving enzymes2021

    • Author(s)
      Mori Takahiro、Kumano Takuto、He Haibing、Watanabe Satomi、Senda Miki、Moriya Toshio、Adachi Naruhiko、Hori Sanae、Terashita Yuzu、Kawasaki Masato、Hashimoto Yoshiteru、Awakawa Takayoshi、Senda Toshiya、Abe Ikuro、Kobayashi Michihiko
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Pages: 6294

    • DOI

      10.1038/s41467-021-26585-1

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Stereodivergent Nitrocyclopropane Formation during Biosynthesis of Belactosins and Hormaomycins2021

    • Author(s)
      Shimo Shotaro、Ushimaru Richiro、Engelbrecht Alicia、Harada Mei、Miyamoto Kazunori、Kulik Andreas、Uchiyama Masanobu、Kaysser Leonard、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 143 Pages: 18413~18418

    • DOI

      10.1021/jacs.1c10201

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Aziridine Formation by a Fe II /α‐Ketoglutarate Dependent Oxygenase and 2‐Aminoisobutyrate Biosynthesis in Fungi2021

    • Author(s)
      Bunno Reito、Awakawa Takayoshi、Mori Takahiro、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 60 Pages: 15827~15831

    • DOI

      10.1002/anie.202104644

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] One Polyketide Synthase, Two Distinct Products: Trans‐Acting Enzyme‐Controlled Product Divergence in Calbistrin Biosynthesis2021

    • Author(s)
      Tao Hui、Mori Takahiro、Wei Xingxing、Matsuda Yudai、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 60 Pages: 8851~8858

    • DOI

      10.1002/anie.202016525

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structural Basis for Isomerization Reactions in Fungal Tetrahydroxanthone Biosynthesis and Diversification2021

    • Author(s)
      Yang Jiali、Mori Takahiro、Wei Xingxing、Matsuda Yudai、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 60 Pages: 19458~19465

    • DOI

      10.1002/anie.202107884

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Biosynthesis of alkyne-containing natural products2021

    • Author(s)
      Li Xinyang、Lv Jian-Ming、Hu Dan、Abe Ikuro
    • Journal Title

      RSC Chemical Biology

      Volume: 2 Pages: 166~180

    • DOI

      10.1039/D0CB00190B

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Enzymology and biosynthesis of the orsellinic acid derived medicinal meroterpenoids2021

    • Author(s)
      Tao Hui、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Current Opinion in Biotechnology

      Volume: 69 Pages: 52~59

    • DOI

      10.1016/j.copbio.2020.11.016

    • Peer Reviewed
  • [Remarks] 東京大学大学院薬学系研究科天然物化学教室

    • URL

      https://tennen.f.u-tokyo.ac.jp/head.htm

URL: 

Published: 2022-12-28  

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