2020 Fiscal Year Research-status Report
A worldwide study of genetic factor for suicide
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20KK0194
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| Research Institution | Yokohama City University |
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Principal Investigator |
菱本 明豊 横浜市立大学, 医学研究科, 教授 (50529526)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
秋山 雅人 九州大学, 医学研究院, 講師 (10757686)
LIU XIAOXI 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 研究員 (20709216)
大塚 郁夫 神戸大学, 医学研究科, 医学研究員 (40722880)
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| Project Period (FY) |
2020-10-27 – 2024-03-31
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| Keywords | 自殺 / ゲノムワイド関連解析 / 自殺コンソーシアム / ポリジェニックリスクスコア |
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| Outline of Annual Research Achievements |
世界的に深刻な社会問題である「自殺」には強い遺伝要因が存在するとされる。しかしながら、自殺者試料の収集が極めて困難なことから、相応の規模のゲノム解析の実施が難しく、うつ病や統合失調症など他の精神科領域の表現型に比して、自殺の遺伝学的知見の獲得は大幅に遅れているのが現状である。申請者らは、世界最大規模の自殺者DNA試料とそれら大半のゲノムワイド関連解析（genome-wide association study; GWAS）データを有し、2019年には世界で初めて「自殺完遂」のポリジェニック効果を報告した。本申請では、そうした経験・強みを生かし、白人自殺GWASを世界で初めて施行するなど自殺研究の世界的中核機関であるコロンビア大学精神科Mannらのグループと組んで、最近立ち上がった世界初の「国際自殺遺伝学コンソーシアム（以下、自殺コンソーシアム）」の拡張（特にアジア人コホートのサンプル増加への貢献）を目指す。自殺は例えば欧米とアジアでは、企図手段や並存精神疾患の割合などが大きく異なることも報告されている。自殺コンソーシアムの発展によって、自殺GWASのサンプルサイズ増加と多人種のデータ取得が可能となり、自殺リスクについての人類共通の遺伝因子の発見や、人種間の遺伝因子の差異、自殺と他のヒト表現型との遺伝的関連の精細なマッピングなど、これまで困難とされていた自殺の遺伝要因についての遺伝統計学的知見の産出が強く期待できる。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
現時点で申請者らが保有する日本人自殺GWASと、コロンビア大学保有の白人自殺GWASについて、両者の遺伝的関連について解析し、論文投稿作業を進めている。また自殺コンソーシアム発の過去最大の自殺行動者GWASについても現在、申請者らが共著した論文を投稿中である。追加の日本人自殺者 約320例のInfinium Asian Screening Arrayでのジェノタイピングを終了し、現在さらに2021年度にジェノタイピングを行うための試料として、既に約100例の自殺者試料を収集できている。コロンビア大学や自殺コンソーシアムとの共同研究の論文化がスムーズに実施できていること、当初の予定より多い自殺者試料の収集・ジェノタイピングが2021年度末までに見込めることから、当初の計画以上に進展しているとした。
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| Strategy for Future Research Activity |
当初の予定（約400例）を超える約500例の自殺者試料の収集・ジェノタイピングが2021年度末までに見込め、2022年度初めには約1400例の日本人自殺者GWASを構築できる予定である。2022年度には、この日本人自殺者GWASデータと、自殺コンソーシアム保有の数万人を超える自殺者・自殺未遂者のGWASデータについて、ポリジェニックリスクスコア解析やGenetic correlation解析を用いて比較検討する。特に自殺コンソーシアムに含まれる中国・台湾の自殺者データを活用し、「アジア人種における自殺リスク判定のためのポリジェニックリスクスコアの精度検討」や「アジア人種における自殺リスク候補遺伝子の同定」に注力する。人種横断的/人種特異的な自殺リスク候補遺伝子が得られた場合、申請者ら保有の日本人自殺者死後脳、コロンビア大学保有の白人自殺者死後脳を用いて、候補遺伝子のRNA/タンパク発現解析やDNAメチル化解析を行う。
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| Causes of Carryover |
コロナ禍の影響もあり、分担研究者との会議がリモートとなり交通費の支出がなかった為。
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[Journal Article] Exploratory investigation on antibodies to GluN1 and cognitive dysfunction in patients with chronic autoimmune psychosis2021
Author(s)
Abe K, Chiba Y, Katsuse O, Takahashi Y, Suda A, Hattori S, Yoshimi R, Kirino Y, Kunii M, Yoshimi A, Asami T, Hishimoto A.
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Journal Title
Neurosci Letter
Volume: 743
Pages: -
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Platelet-derived growth factor BB: A potential diagnostic blood biomarker for differentiating bipolar disorder from major depressive disorder.2021
Author(s)
Idemoto K, Ishima T, Niitsu T, Hata T, Yoshida S, Hattori K, Horai T, Otsuka I, Yamamori H, Toda S, Kameno Y, Ota K, Oda Y, Kimura A, Hashimoto T, Mori N, Kikuchi M, Minabe Y, Hashimoto R, Hishimoto A, Nakagome K, Iyo M, Hashimoto K.
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Journal Title
J Psychiatr Res
Volume: 134
Pages: 48-56
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] The psychological effects of COVID-19 on hospital workers at the beginning of the outbreak with a large disease cluster on the Diamond Princess cruise ship.2021
Author(s)
Ide K, Asami T, Suda A, Yoshimi A, Fujita J, Nomoto M, Roppongi T, Hino K, Takahashi Y, Watanabe K, Shimada T, Hamasaki T, Endo E, Kaneko T, Suzuki M, Kubota K, Saigusa Y, Kato H, Odawara T, Nakajima H, Takeuchi I, Goto T, Aihara M, Hishimoto A.
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Journal Title
PLoS One.
Volume: 16
Pages: -
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Improvements in the degree of understanding the treatment guidelines for schizophrenia and major depressive disorder in a nationwide dissemination and implementation study.2021
Author(s)
Numata S, Nakataki M, Hasegawa N, Takaesu Y, Takeshima M, Onitsuka T, Nakamura T, Edagawa R, Edo H, Miura K, Matsumoto J, Yasui-Furukori N, Kishimoto T, Hori H, Tsuboi T, Yasuda Y, Furihata R, Muraoka H, Ochi S, Nagasawa T, Kyou Y, Murata A, Katsumoto E, Ohi K, Hishimoto A, Inada K, Watanabe K, Hashimoto R.
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Journal Title
Neuropsychopharmacol Rep.
Volume: -
Pages: -
DOI
Peer Reviewed
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