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2021 Fiscal Year Research-status Report

A worldwide study of genetic factor for suicide

Research Project

Project/Area Number 20KK0194
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

菱本 明豊  横浜市立大学, 医学研究科, 教授 (50529526)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 秋山 雅人  九州大学, 医学研究院, 講師 (10757686)
LIU XIAOXI  国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 研究員 (20709216)
大塚 郁夫  神戸大学, 医学部附属病院, 助教 (40722880)
Project Period (FY) 2020-10-27 – 2024-03-31
Keywords自殺 / ゲノムワイド関連解析 / 自殺コンソーシアム / ポリジェニックリスクスコア
Outline of Annual Research Achievements

世界的に深刻な社会問題である「自殺」には強い遺伝要因が存在するとされる。しかしながら、自殺者試料の収集が極めて困難なことから、相応の規模のゲノム解析の実施が難しく、うつ病や統合失調症など他の精神科領域の表現型に比して、自殺の遺伝学的知見の獲得は大幅に遅れている。申請者らは、世界最大規模の自殺者DNA試料とそれら大半のゲノムワイド関連解析(genome-wide association study; GWAS)データを有し、2019年には世界で初めて「自殺完遂」のポリジェニック効果を報告した。本申請では、そうした経験・強みを生かし、白人自殺GWASを世界で初めて施行するなど自殺研究の世界的中核機関であるコロンビア大学精神科Mannらのグループと組んで、最近立ち上がった世界初の「国際自殺遺伝学コンソーシアム(以下、自殺コンソーシアム)」の拡張(特にアジア人コホートのサンプル増加への貢献)を目指す。自殺は例えば欧米とアジアでは、企図手段や並存精神疾患の割合などが大きく異なることも報告されている。自殺コンソーシアムの発展によって、自殺GWASのサンプルサイズ増加と多人種のデータ取得が可能となり、自殺リスクについての人類共通の遺伝因子の発見や、人種間の遺伝因子の差異、自殺と他のヒト表現型との遺伝的関連の精細なマッピングなど、これまで困難とされていた自殺の遺伝要因についての遺伝統計学的知見を産出中である。特に東アジア人集団の自殺行動GWASのスケールアップに注力している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

自殺コンソーシアム発の過去最大の自殺行動者GWASについて、申請者らが共著した論文発表した(Biol Psychiatry)。コロンビア大学保有の白人自殺GWASについて、自殺行動とヒト表現型の遺伝的関連を自殺未遂と自殺完遂に区分しての解析を実施し、責任著者として論文発表した(Psychol Med)。さらに申請者らが保有する日本人自殺GWASと、コロンビア大学保有の白人自殺GWASについて、両者の遺伝的関連について解析し、論文投稿作業を進めている。本研究開始時から、追加の日本人自殺者 約400例のInfinium Asian Screening Arrayでのジェノタイピングを終了し、さらに年間100例のペースで自殺者試料を収集中である。コロンビア大学や自殺コンソーシアムとの共同研究の論文化がスムーズに実施できていること、自殺者試料の収集・ジェノタイピングが順調に進んでいることから、当初の計画以上に進展しているとした。

Strategy for Future Research Activity

当初の予定を超える自殺者試料の収集・ジェノタイピングを遂行中であり、本研究期間内に1500~1600例の日本人自殺者GWASを構築できる予定である。今後、特に自殺コンソーシアムに含まれる中国・台湾の自殺者データを活用し、「アジア人種における自殺リスク判定のためのポリジェニックリスクスコアの精度検討」や「アジア人種における自殺リスク候補遺伝子の同定」に注力する。人種横断的/人種特異的な自殺リスク候補遺伝子が得られた場合、申請者ら保有の日本人自殺者死後脳等を用いて、候補遺伝子のRNA/タンパク発現解析やDNAメチル化解析を行う。

Causes of Carryover

予定していた外注のDNAチップ解析の見積もり予定のサンプル数のクオリティが低く使用できなかった。そのため予定していた予算額より少ない額でチップ解析を行い、差額が生じた。
次年度には新たなサンプルを増やし、今年度のチップに回さなかったサンプルも再度、DNAの品質調整を行なって、DNA解析を行う計画のため、この差額分が相殺される予定である。

  • Research Products

    (27 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (25 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 23 results,  Open Access: 16 results) Presentation (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Columbia University(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Columbia University
  • [Journal Article] Mapping the genetic architecture of suicide attempt and suicide death using polygenic risk scores for clinically-related psychiatric disorders and traits2023

    • Author(s)
      Otsuka Ikuo、Galfalvy Hanga、Guo Jia、Akiyama Masato、Rujescu Dan、Turecki Gustavo、Hishimoto Akitoyo、Mann J. John
    • Journal Title

      Psychological Medicine

      Volume: 53 Pages: 2689~2697

    • DOI

      10.1017/S0033291721004700

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Problematic Internet use and daily difficulties among adolescents with school refusal behaviors2022

    • Author(s)
      Fujita Junichi、Aoyama Kumi、Saigusa Yusuke、Miyazaki Hidehito、Aoki Yoshiko、Asanuma Kazuya、Takahashi Yuichi、Hishimoto Akitoyo
    • Journal Title

      Medicine

      Volume: 101 Pages: e28916

    • DOI

      10.1097/MD.0000000000028916

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Polymorphisms in the hypoxia inducible factor binding site of the macrophage migration inhibitory factor gene promoter in schizophrenia2022

    • Author(s)
      Okazaki Satoshi、Boku Shuken、Watanabe Yuichiro、Otsuka Ikuo、Horai Tadasu、Morikawa Ryo、Kimura Atsushi、Shimmyo Naofumi、Tanifuji Takaki、Someya Toshiyuki、Hishimoto Akitoyo
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 17 Pages: e0265738

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0265738

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Subjective assessment of participants in education programs on clinical practice guidelines in the field of psychiatry2022

    • Author(s)
      Ogasawara K, Numata S, Hasegawa N, Nakataki M, Makinodan M, Ohi K, Takeshima M, Tsuboi T, Hashimoto N, Onitsuka T, Muraoka H, Hori H, Ichihashi K, Inagaki T, Yasui-Furukori N, Hishimoto A et al.
    • Journal Title

      Neuropsychopharmacology Reports

      Volume: Epub Pages: Epub

    • DOI

      10.1002/npr2.12245

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Epigenetic clock analysis and increased plasminogen activator inhibitor-1 in high-functioning autism spectrum disorder2022

    • Author(s)
      Okazaki Satoshi、Kimura Ryo、Otsuka Ikuo、Funabiki Yasuko、Murai Toshiya、Hishimoto Akitoyo
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 17 Pages: e0263478

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0263478

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Accelerated epigenetic age and shortened telomere length based on DNA methylation in Nicolaides?Baraitser syndrome2022

    • Author(s)
      Shinko Yutaka、Okazaki Satoshi、Otsuka Ikuo、Horai Tadasu、Kim Saehyeon、Tanifuji Takaki、Hishimoto Akitoyo
    • Journal Title

      Molecular Genetics & Genomic Medicine

      Volume: 10 Pages: e1876

    • DOI

      10.1002/mgg3.1876

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The characteristics of patients receiving psychotropic pro re nata medication at discharge for the treatment of schizophrenia and major depressive disorder: A nationwide survey from the EGUIDE project2022

    • Author(s)
      Ichihashi K, Kyou Y, Hasegawa N, Yasui-Furukori N, Shimizu Y, Hori H, Hashimoto N, Ide K, Imamura Y, Yamada H, Ochi S, Iga JI, Takaesu Y, Ohi K, Tsuboi T, Iida H, Yamagata H, Hishimoto A et al.
    • Journal Title

      Asian Journal of Psychiatry

      Volume: 69 Pages: 103007

    • DOI

      10.1016/j.ajp.2022.103007

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural brain abnormalities in adolescent patients with anorexia nervosa at both the acute and weight-recovered phase2022

    • Author(s)
      Asami Takeshi、Takaishi Masao、Nakamura Ryota、Yoshimi Asuka、Konishi Jun、Aoyama Kumi、Fujita Junichi、Miyazaki Hidehito、Aoki Yoshiko、Asanuma Kazuya、Hattori Saki、Suda Akira、Whitford Thomas J.、Hirayasu Yoshio、Hishimoto Akitoyo
    • Journal Title

      Brain Imaging and Behavior

      Volume: Epub Pages: Epub

    • DOI

      10.1007/s11682-021-00622-5

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hypnotic medication use among inpatients with schizophrenia and major depressive disorder: results of a nationwide study2022

    • Author(s)
      Furihata R, Otsuki R, Hasegawa N, Tsuboi T, Numata S, Yasui-Furukori N, Kashiwagi H, Hori H, Ochi S, Muraoka H, Onitsuka T, Komatsu H, Takeshima M, Hishimoto A, et al.
    • Journal Title

      Sleep Medicine

      Volume: 89 Pages: 23~30

    • DOI

      10.1016/j.sleep.2021.11.005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dissecting the Shared Genetic Architecture of Suicide Attempt, Psychiatric Disorders, and Known Risk Factors2022

    • Author(s)
      Niamh Mullins, Jooeun Kang, Adrian I. Campos, Akitoyo Hishimoto, Minsoo Kim, Satoshi Okazaki, Ikuo Otsuka, et al.
    • Journal Title

      Biological Psychiatry

      Volume: 91 Pages: 313~327

    • DOI

      10.1016/j.psychres.2021.113967

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Searching for biomarkers in schizophrenia and psychosis: Case‐control study using capillary electrophoresis and liquid chromatography time‐of‐flight mass spectrometry and systematic review for biofluid metabolites2021

    • Author(s)
      Kim Saehyeon、Okazaki Satoshi、Otsuka Ikuo、Shinko Yutaka、Horai Tadasu、Shimmyo Naofumi、Hirata Takashi、Yamaki Naruhisa、Tanifuji Takaki、Boku Shuken、Sora Ichiro、Hishimoto Akitoyo
    • Journal Title

      Neuropsychopharmacology Reports

      Volume: 42 Pages: 42~51

    • DOI

      10.1002/npr2.12223

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Association between the examination rate of treatment‐resistant schizophrenia and the clozapine prescription rate in a nationwide dissemination and implementation study2021

    • Author(s)
      Yasui-Furukori N, Muraoka H, Hasegawa N, Ochi S, Numata S, Hori H, Hishimoto A, et al.
    • Journal Title

      Neuropsychopharmacology Reports

      Volume: 42 Pages: 3~9

    • DOI

      10.1002/npr2.12218

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A preliminary genetic association study of GAD1 and GABAB receptor genes in patients with treatment-resistant schizophrenia2021

    • Author(s)
      Miyazawa Atsuhiro、Kanahara Nobuhisa、Kogure Masanobu、Otsuka Ikuo、Okazaki Satoshi、Watanabe Yoshinori、Yamasaki Fumiaki、Nakata Yusuke、Oda Yasunori、Hishimoto Akitoyo、Iyo Masaomi
    • Journal Title

      Molecular Biology Reports

      Volume: 49 Pages: 2015~2024

    • DOI

      10.1007/s11033-021-07019-z

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Association of Two Variable Number of Tandem Repeats in the Monoamine Oxidase A Gene Promoter with Schizophrenia2021

    • Author(s)
      Tanifuji Takaki、Okazaki Satoshi、Otsuka Ikuo、Horai Tadasu、Shinko Yutaka、Kim Saehyeon、Sora Ichiro、Hishimoto Akitoyo
    • Journal Title

      Neuropsychiatric Disease and Treatment

      Volume: Volume 17 Pages: 3315~3323

    • DOI

      10.2147/NDT.S338854

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Japanese Project for Telepsychiatry Evaluation during COVID-19: Treatment Comparison Trial (J-PROTECT): Rationale, design, and methodology2021

    • Author(s)
      Kishimoto T, Kinoshita S, Bun S, Sato Y, Kitazawa M, Kikuchi T, Sado M, Takamiya A, Mimura M, Nakamae T, Abe Y, Kanazawa T, Kawabata Y, Tomita H, Abe K, Hishimoto A, et al.
    • Journal Title

      Contemporary Clinical Trials

      Volume: 111 Pages: 106596~106596

    • DOI

      10.1016/j.cct.2021.106596

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] First case of Myhre syndrome with schizophrenia2021

    • Author(s)
      Inoue Keisuke、Eiro Tsuyoshi、Semoto Misato、Roppongi Tomohide、Nomoto Munetaka、Takahashi Yuichi、Hishimoto Akitoyo
    • Journal Title

      Clinical Dysmorphology

      Volume: 30 Pages: 207~208

    • DOI

      10.1097/MCD.0000000000000386

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Association between suicidal behaviors and auditory and visual hallucinations in Japanese adolescent psychiatric outpatients at first visit: a cross‐sectional study2021

    • Author(s)
      Toyohara Nao、Fujita Junichi、Okumura Yasuyuki、Suda Akira、Hattori Saki、Saigusa Yusuke、Aoyama Kumi、Asanuma Kazuya、Takahashi Yuichi、Arai Takashi、Hishimoto Akitoyo
    • Journal Title

      Child and Adolescent Mental Health

      Volume: Epub Pages: Epub

    • DOI

      10.1111/camh.12504

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Severe Dementia Case in End of Life Care with Psychiatric Symptoms Treated by Perampanel2021

    • Author(s)
      Kumamoto Asaki、Chiba Yuhei、Suda Akira、Hishimoto Akitoyo、Kase Akihiko
    • Journal Title

      Journal of Epilepsy Research

      Volume: 11 Pages: 93~95

    • DOI

      10.14581/jer.21012

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Characteristics of discharge prescriptions for patients with schizophrenia or major depressive disorder: Real-world evidence from the Effectiveness of Guidelines for Dissemination and Education (EGUIDE) psychiatric treatment project2021

    • Author(s)
      Hashimoto N, Yasui-Furukori N, Hasegawa N, Ishikawa S, Numata S, Hori H, Iida H, Ichihashi K, Furihata R, Murata A, Tsuboi T, Takeshima M, Kyou Y, Komatsu H, Kubota C, Ochi S, Takaesu Y, Usami M, Nagasawa T, Hishimoto A, et al.
    • Journal Title

      Asian Journal of Psychiatry

      Volume: 63 Pages: 102744~102744

    • DOI

      10.1016/j.ajp.2021.102744

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Three-Dimensional Convolutional Autoencoder Extracts Features of Structural Brain Images With a “Diagnostic Label-Free” Approach: Application to Schizophrenia Datasets2021

    • Author(s)
      Yamaguchi Hiroyuki、Hashimoto Yuki、Sugihara Genichi、Miyata Jun、Murai Toshiya、Takahashi Hidehiko、Honda Manabu、Hishimoto Akitoyo、Yamashita Yuichi
    • Journal Title

      Frontiers in Neuroscience

      Volume: 15 Pages: 652987

    • DOI

      10.3389/fnins.2021.652987

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Psychological stress among pregnant and puerperal women in Japan during the coronavirus disease 2019 pandemic2021

    • Author(s)
      Obata Soichiro、Miyagi Etsuko、Haruyama Yasuo、Umazume Takeshi、Kobashi Gen、Yoshimi Asuka、Hishimoto Akitoyo、Kurasawa Kentaro、Suzuki Yukio、Ikeda Tomoaki、Kimura Tadashi、Yamada Hideto
    • Journal Title

      Journal of Obstetrics and Gynaecology Research

      Volume: 47 Pages: 2990~3000

    • DOI

      10.1111/jog.14877

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Serum levels of glial cell line-derived neurotrophic factor as a biomarker for mood disorders and lithium response2021

    • Author(s)
      Idemoto K, Niitsu T, Hata T, Ishima T, Yoshida S, Hattori K, Horai T, Otsuka I, Yamamori H, Toda S, Kameno Y, Ota K, Oda Y, Kimura A, Hashimoto T, Mori N, Kikuchi M, Minabe Y, Hashimoto R, Hishimoto A, et al.
    • Journal Title

      Psychiatry Research

      Volume: 301 Pages: 113967~113967

    • DOI

      10.1016/j.psychres.2021.113967

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Improvements in the degree of understanding the treatment guidelines for schizophrenia and major depressive disorder in a nationwide dissemination and implementation study2021

    • Author(s)
      Numata S, Nakataki M, Hasegawa N, Takaesu Y, Takeshima M, Onitsuka T, Nakamura T, Edagawa R, Edo H, Miura K, Matsumoto J, Yasui-Furukori N, Kishimoto T, Hori H, Tsuboi T, Yasuda Y, Furihata R, Muraoka H, Ochi S, Nagasawa T, Kyou Y, Murata A, Katsumoto E, Ohi K, Hishimoto A, et al.
    • Journal Title

      Neuropsychopharmacology Reports

      Volume: 41 Pages: 199~206

    • DOI

      10.1002/npr2.12173

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 臨床での活用が期待される自殺の生物学的知見2021

    • Author(s)
      大塚郁夫, 菱本明豊.
    • Journal Title

      医学のあゆみ

      Volume: 279(1) Pages: 29~34

  • [Journal Article] 自殺の神経生物学的異常2021

    • Author(s)
      大塚郁夫, 菱本明豊.
    • Journal Title

      臨床精神医学

      Volume: 50(6) Pages: 577~583

  • [Presentation] 日本人自殺者のゲノムワイド関連解析2021

    • Author(s)
      大塚郁夫, 菱本明豊.
    • Organizer
      第43回日本生物学的精神医学会・第51回日本神経精神薬理学会合同年会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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