2021 Fiscal Year Research-status Report
A worldwide study of genetic factor for suicide
| Project/Area Number |
20KK0194
|
|---|
| Research Institution | Yokohama City University |
|---|
Principal Investigator |
菱本 明豊 横浜市立大学, 医学研究科, 教授 (50529526)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
秋山 雅人 九州大学, 医学研究院, 講師 (10757686)
LIU XIAOXI 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 研究員 (20709216)
大塚 郁夫 神戸大学, 医学部附属病院, 助教 (40722880)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2020-10-27 – 2024-03-31
|
| Keywords | 自殺 / ゲノムワイド関連解析 / 自殺コンソーシアム / ポリジェニックリスクスコア |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
世界的に深刻な社会問題である「自殺」には強い遺伝要因が存在するとされる。しかしながら、自殺者試料の収集が極めて困難なことから、相応の規模のゲノム解析の実施が難しく、うつ病や統合失調症など他の精神科領域の表現型に比して、自殺の遺伝学的知見の獲得は大幅に遅れている。申請者らは、世界最大規模の自殺者DNA試料とそれら大半のゲノムワイド関連解析（genome-wide association study; GWAS）データを有し、2019年には世界で初めて「自殺完遂」のポリジェニック効果を報告した。本申請では、そうした経験・強みを生かし、白人自殺GWASを世界で初めて施行するなど自殺研究の世界的中核機関であるコロンビア大学精神科Mannらのグループと組んで、最近立ち上がった世界初の「国際自殺遺伝学コンソーシアム（以下、自殺コンソーシアム）」の拡張（特にアジア人コホートのサンプル増加への貢献）を目指す。自殺は例えば欧米とアジアでは、企図手段や並存精神疾患の割合などが大きく異なることも報告されている。自殺コンソーシアムの発展によって、自殺GWASのサンプルサイズ増加と多人種のデータ取得が可能となり、自殺リスクについての人類共通の遺伝因子の発見や、人種間の遺伝因子の差異、自殺と他のヒト表現型との遺伝的関連の精細なマッピングなど、これまで困難とされていた自殺の遺伝要因についての遺伝統計学的知見を産出中である。特に東アジア人集団の自殺行動GWASのスケールアップに注力している。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
自殺コンソーシアム発の過去最大の自殺行動者GWASについて、申請者らが共著した論文発表した（Biol Psychiatry）。コロンビア大学保有の白人自殺GWASについて、自殺行動とヒト表現型の遺伝的関連を自殺未遂と自殺完遂に区分しての解析を実施し、責任著者として論文発表した（Psychol Med）。さらに申請者らが保有する日本人自殺GWASと、コロンビア大学保有の白人自殺GWASについて、両者の遺伝的関連について解析し、論文投稿作業を進めている。本研究開始時から、追加の日本人自殺者 約400例のInfinium Asian Screening Arrayでのジェノタイピングを終了し、さらに年間100例のペースで自殺者試料を収集中である。コロンビア大学や自殺コンソーシアムとの共同研究の論文化がスムーズに実施できていること、自殺者試料の収集・ジェノタイピングが順調に進んでいることから、当初の計画以上に進展しているとした。
|
| Strategy for Future Research Activity |
当初の予定を超える自殺者試料の収集・ジェノタイピングを遂行中であり、本研究期間内に1500~1600例の日本人自殺者GWASを構築できる予定である。今後、特に自殺コンソーシアムに含まれる中国・台湾の自殺者データを活用し、「アジア人種における自殺リスク判定のためのポリジェニックリスクスコアの精度検討」や「アジア人種における自殺リスク候補遺伝子の同定」に注力する。人種横断的/人種特異的な自殺リスク候補遺伝子が得られた場合、申請者ら保有の日本人自殺者死後脳等を用いて、候補遺伝子のRNA/タンパク発現解析やDNAメチル化解析を行う。
|
| Causes of Carryover |
予定していた外注のDNAチップ解析の見積もり予定のサンプル数のクオリティが低く使用できなかった。そのため予定していた予算額より少ない額でチップ解析を行い、差額が生じた。
次年度には新たなサンプルを増やし、今年度のチップに回さなかったサンプルも再度、DNAの品質調整を行なって、DNA解析を行う計画のため、この差額分が相殺される予定である。
|
Research Products
(27 results)
-
-
-
-
[Journal Article] Subjective assessment of participants in education programs on clinical practice guidelines in the field of psychiatry2022
Author(s)
Ogasawara K, Numata S, Hasegawa N, Nakataki M, Makinodan M, Ohi K, Takeshima M, Tsuboi T, Hashimoto N, Onitsuka T, Muraoka H, Hori H, Ichihashi K, Inagaki T, Yasui-Furukori N, Hishimoto A et al.
-
Journal Title
Neuropsychopharmacology Reports
Volume: Epub
Pages: Epub
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
[Journal Article] The characteristics of patients receiving psychotropic pro re nata medication at discharge for the treatment of schizophrenia and major depressive disorder: A nationwide survey from the EGUIDE project2022
Author(s)
Ichihashi K, Kyou Y, Hasegawa N, Yasui-Furukori N, Shimizu Y, Hori H, Hashimoto N, Ide K, Imamura Y, Yamada H, Ochi S, Iga JI, Takaesu Y, Ohi K, Tsuboi T, Iida H, Yamagata H, Hishimoto A et al.
-
Journal Title
Asian Journal of Psychiatry
Volume: 69
Pages: 103007
DOI
Peer Reviewed
-
-
[Journal Article] Hypnotic medication use among inpatients with schizophrenia and major depressive disorder: results of a nationwide study2022
Author(s)
Furihata R, Otsuki R, Hasegawa N, Tsuboi T, Numata S, Yasui-Furukori N, Kashiwagi H, Hori H, Ochi S, Muraoka H, Onitsuka T, Komatsu H, Takeshima M, Hishimoto A, et al.
-
Journal Title
Sleep Medicine
Volume: 89
Pages: 23～30
DOI
Peer Reviewed
-
-
-
-
-
-
-
[Journal Article] Japanese Project for Telepsychiatry Evaluation during COVID-19: Treatment Comparison Trial (J-PROTECT): Rationale, design, and methodology2021
Author(s)
Kishimoto T, Kinoshita S, Bun S, Sato Y, Kitazawa M, Kikuchi T, Sado M, Takamiya A, Mimura M, Nakamae T, Abe Y, Kanazawa T, Kawabata Y, Tomita H, Abe K, Hishimoto A, et al.
-
Journal Title
Contemporary Clinical Trials
Volume: 111
Pages: 106596～106596
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
-
[Journal Article] Characteristics of discharge prescriptions for patients with schizophrenia or major depressive disorder: Real-world evidence from the Effectiveness of Guidelines for Dissemination and Education (EGUIDE) psychiatric treatment project2021
Author(s)
Hashimoto N, Yasui-Furukori N, Hasegawa N, Ishikawa S, Numata S, Hori H, Iida H, Ichihashi K, Furihata R, Murata A, Tsuboi T, Takeshima M, Kyou Y, Komatsu H, Kubota C, Ochi S, Takaesu Y, Usami M, Nagasawa T, Hishimoto A, et al.
-
Journal Title
Asian Journal of Psychiatry
Volume: 63
Pages: 102744～102744
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
[Journal Article] Serum levels of glial cell line-derived neurotrophic factor as a biomarker for mood disorders and lithium response2021
Author(s)
Idemoto K, Niitsu T, Hata T, Ishima T, Yoshida S, Hattori K, Horai T, Otsuka I, Yamamori H, Toda S, Kameno Y, Ota K, Oda Y, Kimura A, Hashimoto T, Mori N, Kikuchi M, Minabe Y, Hashimoto R, Hishimoto A, et al.
-
Journal Title
Psychiatry Research
Volume: 301
Pages: 113967～113967
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Improvements in the degree of understanding the treatment guidelines for schizophrenia and major depressive disorder in a nationwide dissemination and implementation study2021
Author(s)
Numata S, Nakataki M, Hasegawa N, Takaesu Y, Takeshima M, Onitsuka T, Nakamura T, Edagawa R, Edo H, Miura K, Matsumoto J, Yasui-Furukori N, Kishimoto T, Hori H, Tsuboi T, Yasuda Y, Furihata R, Muraoka H, Ochi S, Nagasawa T, Kyou Y, Murata A, Katsumoto E, Ohi K, Hishimoto A, et al.
-
Journal Title
Neuropsychopharmacology Reports
Volume: 41
Pages: 199～206
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
