シトシンメチル化解析によるヘテロクロマチン機能不全と関連疾患発症機構の解明

2022 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 20KK0351
• Research Institution: Chiba University
• Principal Investigator: 小野寺 淳 千葉大学, 大学院医学研究院, 准教授 (10586598)
• Project Period (FY): 2021 – 2022
• Keywords: エピジェネティクス / 発生・分化 / 第三世代シークエンス / 炎症性疾患 / 発現制御

Outline of Annual Research Achievements

交付申請書に記した研究目的に即し、研究代表者はepigenetic制御分子の欠損で共通に見られるゲノム不安定性、トランスポゾンの再活性化、炎症性の亢進、および細胞腫瘍化の機構解明を目指して、ヘテロクロマチン領域でのシトシンメチル化に着目して研究を進めた。主たる連携海外研究機関であるLa Jolla Institute for Immunology (LJI)での実験データの取得(R3年度)と解析(R4年度)を連動して進め、その過程で近隣のUniversity of California, San Diego (UCSD)の研究者の協力も得た。
研究期間全体を通じて行った、TET欠損で誘導される急性骨髄性白血病マウスモデルの研究では、ヘテロクロマチンからユークロマチンに変化する領域に関する原著論文を発表した。この論文を通じて、本研究の目的とする「ヘテロクロマチン機能不全と疾患発症の関係性」を明らかにしたことは大きな成果であった。また、該当領域にクラスターを形成しているstefin遺伝子のヒトにおけるホモログ遺伝子群の発現と、がん患者の予後についても新たな知見が得られた。さらに、本研究に関連する英文原著論文を八報、英文総説を一報、邦文総説を二報発表した。いずれも、epigeneticと関連疾患に関する内容が中心である。これらに加えて、日本国内でも複数回の学会発表の機会があった。
研究のキーデバイスである第三世代シークエンス技術（Oxford Nanopore社製）によるデータの取得は、オーストラリアのThe University of Queenslandとの共同研究であるが、国内所属研究機関でも同様の運用ができるように、附属病院検査部やかずさDNA研究所との共同研究体制の整備に取り組んでいる。以上のように研究期間全体でほぼ予定通りに研究を進めることができ、十分な成果を得られた。

Research Products

• [Int'l Joint Research] La Jolla Institute for Immunology(米国) (2021)
  • Year and Date: 2021-04-01 – 2021-08-16 | 2021-10-152022-03-23
  • Country Name: U.S.A.
  • Counterpart Institution: La Jolla Institute for Immunology
  • Co-investigator Overseas: Dr. Anjana Rao
  • Department: Division of SGE
  • Job Title: 教授
• [Journal Article] Characterization of eosinophils and natural killer cells in nasal polyps and peripheral blood in eosinophilic chronic rhinosinusitis patients (2023)
  • Author(s): Tsuji Kaori、Aoki Ami、Onodera Atsushi、Kiuchi Masahiro、Kokubo Kota、Morimoto Yuki、Iinuma Tomohisa、Hanazawa Toyoyuki、Nakayama Toshinori、Hirahara Kiyoshi
  • Journal Title: Allergology International Volume: 72 Pages: 335～338
  • DOI: 10.1016/j.alit.2022.11.009
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Thioredoxin-interacting protein is essential for memory T cell formation via the regulation of the redox metabolism (2023)
  • Author(s): Kokubo Kota、Hirahara Kiyoshi、Kiuchi Masahiro、Tsuji Kaori、Shimada Yuki、Sonobe Yuri、Shinmi Rie、Hishiya Takahisa、Iwamura Chiaki、Onodera Atsushi、Nakayama Toshinori
  • Journal Title: Proceedings of the National Academy of Sciences Volume: 120 Pages: e2218345120
  • DOI: 10.1073/pnas.2218345120
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Inducible disruption of Tet genes results in myeloid malignancy, readthrough transcription, and a heterochromatin-to-euchromatin switch (2023)
  • Author(s): Yuita Hiroshi、Lopez-Moyado Isaac F.、Jeong Hyeongmin、Cheng Arthur Xiuyuan、Scott-Browne James、An Jungeun、Nakayama Toshinori、Onodera Atsushi、Ko Myunggon、Rao Anjana
  • Journal Title: Proceedings of the National Academy of Sciences Volume: 120(6) Pages: e2214824120
  • DOI: 10.1073/pnas.2214824120
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Conventional and pathogenic Th2 cells in inflammation, tissue repair, and fibrosis (2022)
  • Author(s): Kokubo Kota、Onodera Atsushi、Kiuchi Masahiro、Tsuji Kaori、Hirahara Kiyoshi、Nakayama Toshinori
  • Journal Title: Frontiers in Immunology Volume: 13 Pages: 945063
  • DOI: 10.3389/fimmu.2022.945063
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Liver group 2 innate lymphoid cells regulate blood glucose levels through IL-13 signaling and suppression of gluconeogenesis (2022)
  • Author(s): Fujimoto Masanori、Yokoyama Masataka、Kiuchi Masahiro、Hosokawa Hiroyuki、Nakayama Akitoshi、Hashimoto Naoko、Sakuma Ikki、Nagano Hidekazu、Yamagata Kazuyuki、Kudo Fujimi、Manabe Ichiro、Lee Eunyoung、Hatano Ryo、Onodera Atsushi、Hirahara Kiyoshi、Yokote Koutaro、Miki Takashi、Nakayama Toshinori、Tanaka Tomoaki
  • Journal Title: Nature Communications Volume: 13 Pages: 5408
  • DOI: 10.1038/s41467-022-33171-6
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] シングルセル解析 (2022)
  • Author(s): 小野寺淳、本橋新一郎
  • Journal Title: 耳鼻咽喉科 Volume: 2(5) Pages: 666～667
• [Presentation] Unsaturated fatty acids promote pathogenic type 2 adaptive immunity via PPARg-ST2 axis. International Symposium for Future Mucosal Vaccines (2023)
  • Author(s): Yagyu, H., Kiuchi, M., Kokubo, K., Sasaki, A., Onodera, A., Iwamura, C., Kaneko, T., Nakayama T., and Hirahara, K.
  • Organizer: Safeguards and Innovations against Infectious Diseases
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Roles of TET and TDG in DNA demethylation in the immune system. International Symposium for Future Mucosal Vaccines (2023)
  • Author(s): Onodera, A., Tanaka, H., Hirahara, K., Nakayama, T., and Rao, A.
  • Organizer: Safeguards and Innovations against Infectious Diseases
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] CD69 regulates anti-tumor CD8T cell responses. (2023)
  • Author(s): Nasu, R., Wang, YS., Endo, Y., Hasegawa, I., Mita, Y., Onodera, A., Motohashi, S., Nakayama T., and Kimura KY.
  • Organizer: International Symposium for Future Mucosal Vaccines: Safeguards and Innovations against Infectious Diseases
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Connecting TET2 deficiency with inflammation in CMML and anti-tumor responses. (2022)
  • Author(s): Singh, AK., Onodera, A., Lopez-Moyado, IF., Sepulveda, H., Angel, JC., Rao, A.
  • Organizer: AACR, New Orleans, USA
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Nematode ascarosides attenuate mammalian type 2 inflammatory responses. (2022)
  • Author(s): Kiuchi, M., Kokubo, K., Onodera, A., Hirahara, K., and Nakayama, T.
  • Organizer: 第51回日本免疫学会学術集会
• [Remarks] 千葉大学大学院医学研究院 免疫発生学HP
  • URL: https://www.m.chiba-u.jp/dept/meneki/